Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B339

Protein Details
Accession A0A178B339    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32TTAPAQYRQPGRKGKKAWRKNVDVTQIQHydrophilic
262-299NEDDKLKKKRPERKSLSQRNKIKRRKEAERKAKHEAKMBasic
343-364GEEEELKKRQFRKHPIPEAPLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-23GRKGKKAWR
107-112KRKKAK
266-304KLKKKRPERKSLSQRNKIKRRKEAERKAKHEAKMKAKEQ
311-311K
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MADTTTAPAQYRQPGRKGKKAWRKNVDVTQIQSGLEDVRDQIIQGGVVSEKTADELFAVDTTGSADIQKQVSKRHKPLKVDEILAQRSAIPAVASRKRLSDIDNEGKRKKAKVSGKEYDRLRAIAYGGEQVNKNVVQTGGDAQYDPWAVQEVKKDPRFTFLEEAKAKREPVTLKHAPISQAKSGKAIPAVRKPAGGKSYNPDFKDWQNELMRESDKAVEAEKLRLQEAREEAERMERAAAETESDSGEESVWESEWEGFSENEDDKLKKKRPERKSLSQRNKIKRRKEAERKAKHEAKMKAKEQQVQEIKKLAKSVEEKEKARAAVREALENKTLDIMSDDDGEEEELKKRQFRKHPIPEAPLEIVLPDELRDSLRLLKPEGNLLKDRFRSMMVRGKVESRRQIAYGKQKKYAVSEKWSYKDWKLPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.67
3 0.74
4 0.79
5 0.81
6 0.83
7 0.86
8 0.88
9 0.87
10 0.88
11 0.87
12 0.87
13 0.85
14 0.8
15 0.73
16 0.68
17 0.59
18 0.5
19 0.41
20 0.32
21 0.24
22 0.19
23 0.16
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.09
39 0.09
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.11
54 0.14
55 0.18
56 0.19
57 0.28
58 0.38
59 0.48
60 0.56
61 0.63
62 0.68
63 0.72
64 0.78
65 0.78
66 0.73
67 0.67
68 0.63
69 0.61
70 0.56
71 0.49
72 0.41
73 0.31
74 0.26
75 0.23
76 0.17
77 0.09
78 0.11
79 0.18
80 0.23
81 0.27
82 0.28
83 0.29
84 0.32
85 0.33
86 0.32
87 0.32
88 0.36
89 0.42
90 0.49
91 0.53
92 0.53
93 0.57
94 0.58
95 0.54
96 0.5
97 0.5
98 0.51
99 0.55
100 0.62
101 0.66
102 0.69
103 0.73
104 0.69
105 0.65
106 0.57
107 0.48
108 0.39
109 0.3
110 0.24
111 0.18
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.17
116 0.16
117 0.15
118 0.18
119 0.16
120 0.15
121 0.12
122 0.11
123 0.09
124 0.1
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.12
137 0.17
138 0.21
139 0.3
140 0.34
141 0.37
142 0.35
143 0.4
144 0.41
145 0.39
146 0.4
147 0.33
148 0.38
149 0.39
150 0.4
151 0.37
152 0.37
153 0.34
154 0.29
155 0.31
156 0.25
157 0.25
158 0.32
159 0.33
160 0.33
161 0.35
162 0.35
163 0.34
164 0.36
165 0.36
166 0.31
167 0.31
168 0.3
169 0.29
170 0.28
171 0.26
172 0.25
173 0.26
174 0.26
175 0.29
176 0.34
177 0.32
178 0.34
179 0.33
180 0.34
181 0.35
182 0.32
183 0.27
184 0.27
185 0.35
186 0.38
187 0.38
188 0.36
189 0.33
190 0.33
191 0.39
192 0.34
193 0.32
194 0.3
195 0.29
196 0.28
197 0.29
198 0.27
199 0.2
200 0.2
201 0.15
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.14
210 0.14
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.16
219 0.19
220 0.18
221 0.15
222 0.14
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.1
248 0.1
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.17
253 0.26
254 0.32
255 0.37
256 0.46
257 0.54
258 0.62
259 0.72
260 0.77
261 0.79
262 0.84
263 0.88
264 0.9
265 0.9
266 0.9
267 0.9
268 0.91
269 0.89
270 0.87
271 0.86
272 0.84
273 0.85
274 0.87
275 0.87
276 0.87
277 0.89
278 0.86
279 0.86
280 0.84
281 0.79
282 0.76
283 0.73
284 0.73
285 0.72
286 0.69
287 0.66
288 0.64
289 0.65
290 0.59
291 0.6
292 0.59
293 0.53
294 0.52
295 0.51
296 0.48
297 0.43
298 0.42
299 0.33
300 0.31
301 0.32
302 0.36
303 0.4
304 0.46
305 0.46
306 0.48
307 0.52
308 0.47
309 0.45
310 0.41
311 0.34
312 0.34
313 0.33
314 0.37
315 0.35
316 0.36
317 0.36
318 0.33
319 0.3
320 0.24
321 0.23
322 0.15
323 0.14
324 0.13
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.15
335 0.18
336 0.23
337 0.3
338 0.38
339 0.48
340 0.57
341 0.65
342 0.72
343 0.81
344 0.83
345 0.83
346 0.77
347 0.72
348 0.63
349 0.52
350 0.41
351 0.3
352 0.23
353 0.17
354 0.13
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.19
362 0.22
363 0.25
364 0.27
365 0.31
366 0.31
367 0.4
368 0.43
369 0.4
370 0.42
371 0.44
372 0.49
373 0.47
374 0.48
375 0.4
376 0.39
377 0.37
378 0.37
379 0.43
380 0.39
381 0.41
382 0.41
383 0.47
384 0.52
385 0.57
386 0.6
387 0.55
388 0.53
389 0.51
390 0.54
391 0.55
392 0.58
393 0.6
394 0.57
395 0.6
396 0.6
397 0.61
398 0.64
399 0.65
400 0.61
401 0.6
402 0.64
403 0.65
404 0.64
405 0.68
406 0.65
407 0.61