FuNGI

A0A178ARQ9

Protein Details

Accession

A0A178ARQ9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-50	IDSIVGEQRPPKRQRKTKDVIKKELEAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
34-37	KRQR
530-592	KVKAPAAKEAPTGRGGGGRGGPPARGGQNQRGRGQQNGGRGGGQRGGGPPAQRGRGNIARTGR

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 11, nucl 7.5, pero 3, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MDTLSGELEKLRLSSALDDPGWIDSIVGEQRPPKRQRKTKDVIKKELEAEFLTPSRSFNTEWLNRLQQRWDAPTNYRSLCQIAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAVAAMEDEDIMKRENAAARESGGLNRVINFSDPNGLLTTPPGFTRGLDFQKKSISDAKTTQEVEDTLGEASTASKNAEADEDDIPDLNGSRDSGAAGGDGQTPLEEEIDALLPVEFPALAPHGPLAMAASRKGGREWAHMVDINRDITNFRELVPEMAREYPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRLTFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPIPLEHYLWAGKGIYKIVTADKKFIDNGWKEANDVMSGKDKVKAPAAKEAPTGRGGGGRGGPPARGGQNQRGRGQQNGGRGGGQRGGGPPAQRGRGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLIQHLRSKDLLPACIFVFSKKRCEENAEALSNLDYCTAAEKSAIHMTIEKSLARLKPEDRDLPQIKRLRELLSRGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGREFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGTVIICAPGADEAPPAARLRQMMLGEPTKLRSQFRLTYNMMLNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKNVKISEADLEKIKREPCEICDIDLEACHQSCEDYKRLTNEMHLSLLADPVGRRVFSRNRLIVYKKDNKRTAGMLMQDGTSRGNEPTIKVLEIAQNQDRRADDLLPYLGPFAKFFRNLPKSPKDLILKTAFVPLSDIECFTKTTIDIPESVQNLNRKKDTLKLAQDQFLPLCQSWNYEDWDEYDYGRIKSLKFRELMETRIKEGHNAIDKKCLGCPDFLKHFEMEHDQWVIKENIDALRQLMSDQNLQLLPDYEQRIRVLKDLGFIDDGSRVELKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLADYTPEEIVALLSAFVFQEKTDVEPTLTASLERGVAAIVKISEKVNEIQTLHQVILSADDSNDFVSKPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPTLFQKMGTCQELIKRDICNCASLYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.19
3	0.23
4	0.22
5	0.22
6	0.22
7	0.22
8	0.22
9	0.18
10	0.14
11	0.09
12	0.13
13	0.16
14	0.16
15	0.17
16	0.23
17	0.31
18	0.41
19	0.5
20	0.56
21	0.64
22	0.73
23	0.81
24	0.85
25	0.88
26	0.89
27	0.91
28	0.91
29	0.9
30	0.87
31	0.82
32	0.76
33	0.68
34	0.61
35	0.51
36	0.42
37	0.37
38	0.31
39	0.28
40	0.24
41	0.22
42	0.22
43	0.22
44	0.22
45	0.23
46	0.32
47	0.34
48	0.38
49	0.44
50	0.5
51	0.52
52	0.54
53	0.54
54	0.5
55	0.5
56	0.54
57	0.53
58	0.49
59	0.5
60	0.52
61	0.55
62	0.51
63	0.46
64	0.41
65	0.38
66	0.34
67	0.32
68	0.33
69	0.34
70	0.4
71	0.42
72	0.43
73	0.44
74	0.47
75	0.45
76	0.46
77	0.44
78	0.4
79	0.4
80	0.4
81	0.4
82	0.39
83	0.39
84	0.35
85	0.34
86	0.3
87	0.29
88	0.31
89	0.27
90	0.25
91	0.23
92	0.21
93	0.17
94	0.19
95	0.2
96	0.17
97	0.17
98	0.16
99	0.2
100	0.2
101	0.2
102	0.2
103	0.2
104	0.19
105	0.19
106	0.21
107	0.21
108	0.26
109	0.29
110	0.35
111	0.4
112	0.45
113	0.51
114	0.59
115	0.6
116	0.59
117	0.59
118	0.58
119	0.54
120	0.5
121	0.46
122	0.37
123	0.32
124	0.27
125	0.24
126	0.18
127	0.14
128	0.14
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.08
135	0.09
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.05
140	0.04
141	0.04
142	0.03
143	0.03
144	0.03
145	0.03
146	0.04
147	0.05
148	0.06
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.13
153	0.17
154	0.18
155	0.2
156	0.2
157	0.2
158	0.23
159	0.24
160	0.22
161	0.2
162	0.2
163	0.18
164	0.19
165	0.18
166	0.16
167	0.16
168	0.16
169	0.15
170	0.18
171	0.17
172	0.17
173	0.17
174	0.16
175	0.15
176	0.16
177	0.17
178	0.13
179	0.13
180	0.13
181	0.12
182	0.13
183	0.17
184	0.23
185	0.3
186	0.37
187	0.38
188	0.39
189	0.45
190	0.45
191	0.44
192	0.45
193	0.39
194	0.36
195	0.4
196	0.41
197	0.41
198	0.42
199	0.38
200	0.33
201	0.3
202	0.26
203	0.22
204	0.19
205	0.12
206	0.11
207	0.1
208	0.08
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.09
214	0.1
215	0.1
216	0.12
217	0.12
218	0.13
219	0.14
220	0.15
221	0.14
222	0.14
223	0.13
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.09
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.07
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.04
256	0.05
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.07
262	0.08
263	0.07
264	0.08
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.14
269	0.16
270	0.17
271	0.18
272	0.21
273	0.21
274	0.25
275	0.29
276	0.28
277	0.3
278	0.32
279	0.32
280	0.31
281	0.31
282	0.28
283	0.24
284	0.21
285	0.18
286	0.17
287	0.2
288	0.16
289	0.14
290	0.16
291	0.16
292	0.19
293	0.2
294	0.19
295	0.18
296	0.21
297	0.21
298	0.18
299	0.19
300	0.17
301	0.16
302	0.15
303	0.15
304	0.14
305	0.16
306	0.18
307	0.16
308	0.16
309	0.15
310	0.16
311	0.18
312	0.18
313	0.17
314	0.15
315	0.15
316	0.14
317	0.15
318	0.14
319	0.1
320	0.07
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.05
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.1
349	0.11
350	0.18
351	0.19
352	0.21
353	0.23
354	0.26
355	0.26
356	0.3
357	0.38
358	0.38
359	0.47
360	0.47
361	0.52
362	0.52
363	0.53
364	0.59
365	0.5
366	0.43
367	0.41
368	0.42
369	0.35
370	0.32
371	0.31
372	0.2
373	0.2
374	0.18
375	0.1
376	0.06
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.07
398	0.08
399	0.11
400	0.1
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.09
414	0.07
415	0.06
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.07
422	0.09
423	0.09
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.04
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.16
460	0.22
461	0.26
462	0.29
463	0.34
464	0.37
465	0.4
466	0.45
467	0.41
468	0.41
469	0.46
470	0.52
471	0.51
472	0.51
473	0.49
474	0.45
475	0.46
476	0.4
477	0.33
478	0.31
479	0.35
480	0.33
481	0.33
482	0.34
483	0.3
484	0.3
485	0.28
486	0.21
487	0.14
488	0.12
489	0.11
490	0.09
491	0.09
492	0.1
493	0.14
494	0.2
495	0.2
496	0.22
497	0.22
498	0.23
499	0.23
500	0.23
501	0.27
502	0.22
503	0.24
504	0.26
505	0.25
506	0.24
507	0.24
508	0.23
509	0.16
510	0.15
511	0.13
512	0.13
513	0.14
514	0.15
515	0.18
516	0.19
517	0.19
518	0.25
519	0.27
520	0.25
521	0.32
522	0.34
523	0.32
524	0.33
525	0.33
526	0.29
527	0.27
528	0.26
529	0.17
530	0.16
531	0.15
532	0.13
533	0.14
534	0.12
535	0.13
536	0.13
537	0.13
538	0.12
539	0.13
540	0.14
541	0.17
542	0.19
543	0.26
544	0.34
545	0.38
546	0.4
547	0.44
548	0.43
549	0.41
550	0.42
551	0.36
552	0.34
553	0.33
554	0.3
555	0.26
556	0.25
557	0.24
558	0.21
559	0.19
560	0.14
561	0.12
562	0.13
563	0.13
564	0.13
565	0.16
566	0.17
567	0.19
568	0.19
569	0.19
570	0.24
571	0.28
572	0.29
573	0.3
574	0.29
575	0.27
576	0.27
577	0.28
578	0.23
579	0.2
580	0.19
581	0.15
582	0.14
583	0.13
584	0.15
585	0.19
586	0.19
587	0.18
588	0.18
589	0.19
590	0.19
591	0.19
592	0.17
593	0.11
594	0.11
595	0.14
596	0.16
597	0.15
598	0.19
599	0.19
600	0.2
601	0.21
602	0.2
603	0.2
604	0.19
605	0.2
606	0.15
607	0.16
608	0.15
609	0.16
610	0.16
611	0.13
612	0.19
613	0.18
614	0.25
615	0.25
616	0.28
617	0.27
618	0.32
619	0.34
620	0.34
621	0.38
622	0.32
623	0.3
624	0.28
625	0.27
626	0.21
627	0.17
628	0.1
629	0.05
630	0.04
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.08
637	0.1
638	0.11
639	0.09
640	0.1
641	0.11
642	0.14
643	0.15
644	0.12
645	0.11
646	0.15
647	0.16
648	0.16
649	0.18
650	0.17
651	0.2
652	0.24
653	0.28
654	0.26
655	0.34
656	0.36
657	0.36
658	0.42
659	0.43
660	0.39
661	0.39
662	0.38
663	0.33
664	0.32
665	0.32
666	0.29
667	0.25
668	0.25
669	0.22
670	0.21
671	0.18
672	0.15
673	0.12
674	0.08
675	0.06
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.06
690	0.06
691	0.07
692	0.06
693	0.08
694	0.06
695	0.07
696	0.06
697	0.06
698	0.08
699	0.08
700	0.09
701	0.08
702	0.08
703	0.07
704	0.08
705	0.07
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.06
712	0.07
713	0.07
714	0.07
715	0.08
716	0.1
717	0.12
718	0.18
719	0.19
720	0.23
721	0.24
722	0.25
723	0.3
724	0.34
725	0.37
726	0.39
727	0.4
728	0.37
729	0.41
730	0.4
731	0.35
732	0.3
733	0.25
734	0.18
735	0.15
736	0.15
737	0.09
738	0.1
739	0.09
740	0.08
741	0.09
742	0.11
743	0.11
744	0.12
745	0.12
746	0.12
747	0.12
748	0.12
749	0.11
750	0.09
751	0.1
752	0.08
753	0.07
754	0.07
755	0.06
756	0.05
757	0.04
758	0.04
759	0.03
760	0.04
761	0.04
762	0.04
763	0.04
764	0.05
765	0.06
766	0.07
767	0.07
768	0.08
769	0.08
770	0.1
771	0.13
772	0.13
773	0.14
774	0.17
775	0.18
776	0.19
777	0.19
778	0.2
779	0.19
780	0.21
781	0.2
782	0.2
783	0.24
784	0.29
785	0.32
786	0.37
787	0.36
788	0.38
789	0.38
790	0.36
791	0.32
792	0.25
793	0.22
794	0.15
795	0.13
796	0.09
797	0.07
798	0.06
799	0.05
800	0.06
801	0.06
802	0.07
803	0.09
804	0.11
805	0.13
806	0.14
807	0.14
808	0.15
809	0.16
810	0.18
811	0.17
812	0.2
813	0.19
814	0.2
815	0.21
816	0.2
817	0.19
818	0.17
819	0.17
820	0.14
821	0.13
822	0.14
823	0.16
824	0.16
825	0.17
826	0.18
827	0.18
828	0.16
829	0.15
830	0.17
831	0.16
832	0.17
833	0.2
834	0.19
835	0.19
836	0.23
837	0.25
838	0.21
839	0.23
840	0.23
841	0.22
842	0.3
843	0.29
844	0.27
845	0.26
846	0.26
847	0.22
848	0.21
849	0.19
850	0.12
851	0.11
852	0.1
853	0.09
854	0.08
855	0.12
856	0.16
857	0.18
858	0.2
859	0.22
860	0.26
861	0.28
862	0.28
863	0.29
864	0.29
865	0.27
866	0.24
867	0.22
868	0.19
869	0.17
870	0.17
871	0.12
872	0.09
873	0.07
874	0.1
875	0.11
876	0.1
877	0.11
878	0.16
879	0.23
880	0.3
881	0.39
882	0.39
883	0.41
884	0.46
885	0.49
886	0.5
887	0.52
888	0.56
889	0.55
890	0.62
891	0.63
892	0.6
893	0.6
894	0.56
895	0.5
896	0.44
897	0.38
898	0.31
899	0.27
900	0.24
901	0.22
902	0.2
903	0.16
904	0.12
905	0.11
906	0.09
907	0.12
908	0.12
909	0.13
910	0.17
911	0.18
912	0.18
913	0.17
914	0.18
915	0.21
916	0.22
917	0.26
918	0.27
919	0.29
920	0.29
921	0.32
922	0.3
923	0.28
924	0.27
925	0.24
926	0.19
927	0.18
928	0.19
929	0.16
930	0.16
931	0.15
932	0.14
933	0.13
934	0.13
935	0.13
936	0.16
937	0.17
938	0.19
939	0.29
940	0.34
941	0.38
942	0.45
943	0.49
944	0.5
945	0.51
946	0.57
947	0.52
948	0.47
949	0.5
950	0.46
951	0.41
952	0.36
953	0.39
954	0.32
955	0.25
956	0.25
957	0.19
958	0.18
959	0.17
960	0.17
961	0.13
962	0.14
963	0.15
964	0.14
965	0.14
966	0.11
967	0.14
968	0.15
969	0.15
970	0.15
971	0.17
972	0.21
973	0.22
974	0.23
975	0.24
976	0.29
977	0.33
978	0.38
979	0.37
980	0.34
981	0.35
982	0.41
983	0.44
984	0.46
985	0.49
986	0.52
987	0.54
988	0.56
989	0.55
990	0.5
991	0.43
992	0.36
993	0.3
994	0.21
995	0.2
996	0.16
997	0.17
998	0.18
999	0.2
1000	0.21
1001	0.2
1002	0.2
1003	0.2
1004	0.23
1005	0.21
1006	0.18
1007	0.2
1008	0.2
1009	0.19
1010	0.22
1011	0.22
1012	0.21
1013	0.29
1014	0.34
1015	0.36
1016	0.34
1017	0.36
1018	0.41
1019	0.42
1020	0.46
1021	0.47
1022	0.44
1023	0.41
1024	0.44
1025	0.42
1026	0.36
1027	0.35
1028	0.37
1029	0.36
1030	0.39
1031	0.37
1032	0.4
1033	0.42
1034	0.41
1035	0.41
1036	0.39
1037	0.31
1038	0.31
1039	0.34
1040	0.34
1041	0.39
1042	0.41
1043	0.41
1044	0.36
1045	0.36
1046	0.34
1047	0.37
1048	0.31
1049	0.27
1050	0.27
1051	0.24
1052	0.23
1053	0.27
1054	0.25
1055	0.18
1056	0.17
1057	0.16
1058	0.17
1059	0.18
1060	0.18
1061	0.15
1062	0.16
1063	0.16
1064	0.16
1065	0.17
1066	0.16
1067	0.17
1068	0.17
1069	0.19
1070	0.18
1071	0.18
1072	0.18
1073	0.16
1074	0.16
1075	0.19
1076	0.23
1077	0.22
1078	0.24
1079	0.26
1080	0.3
1081	0.3
1082	0.3
1083	0.29
1084	0.25
1085	0.29
1086	0.27
1087	0.27
1088	0.24
1089	0.22
1090	0.2
1091	0.19
1092	0.18
1093	0.16
1094	0.15
1095	0.13
1096	0.14
1097	0.16
1098	0.18
1099	0.19
1100	0.2
1101	0.22
1102	0.22
1103	0.23
1104	0.25
1105	0.25
1106	0.24
1107	0.22
1108	0.22
1109	0.17
1110	0.17
1111	0.16
1112	0.13
1113	0.11
1114	0.09
1115	0.07
1116	0.07
1117	0.07
1118	0.06
1119	0.05
1120	0.04
1121	0.04
1122	0.05
1123	0.04
1124	0.04
1125	0.05
1126	0.06
1127	0.07
1128	0.06
1129	0.06
1130	0.06
1131	0.06
1132	0.07
1133	0.06
1134	0.05
1135	0.04
1136	0.05
1137	0.05
1138	0.06
1139	0.06
1140	0.05
1141	0.08
1142	0.08
1143	0.12
1144	0.14
1145	0.15
1146	0.15
1147	0.16
1148	0.18
1149	0.18
1150	0.18
1151	0.15
1152	0.13
1153	0.13
1154	0.13
1155	0.12
1156	0.1
1157	0.08
1158	0.09
1159	0.09
1160	0.1
1161	0.1
1162	0.1
1163	0.12
1164	0.12
1165	0.14
1166	0.15
1167	0.18
1168	0.2
1169	0.24
1170	0.24
1171	0.25
1172	0.3
1173	0.31
1174	0.28
1175	0.25
1176	0.22
1177	0.18
1178	0.19
1179	0.18
1180	0.13
1181	0.11
1182	0.12
1183	0.12
1184	0.12
1185	0.13
1186	0.1
1187	0.12
1188	0.15
1189	0.17
1190	0.17
1191	0.19
1192	0.18
1193	0.19
1194	0.25
1195	0.23
1196	0.24
1197	0.23
1198	0.26
1199	0.23
1200	0.23
1201	0.22
1202	0.16
1203	0.14
1204	0.1
1205	0.11
1206	0.17
1207	0.22
1208	0.23
1209	0.26
1210	0.26
1211	0.28
1212	0.28
1213	0.28
1214	0.21
1215	0.17
1216	0.16
1217	0.13
1218	0.14
1219	0.12
1220	0.11
1221	0.12
1222	0.1
1223	0.09
1224	0.1
1225	0.1
1226	0.11
1227	0.16
1228	0.17
1229	0.19
1230	0.24
1231	0.29
1232	0.35
1233	0.38
1234	0.38
1235	0.36
1236	0.39
1237	0.43
1238	0.44
1239	0.42
1240	0.37
1241	0.36
1242	0.38
1243	0.4
1244	0.36
1245	0.28
1246	0.26
1247	0.29
1248	0.27
1249	0.26
1250	0.24
1251	0.24
1252	0.3
1253	0.31
1254	0.29
1255	0.26
1256	0.34
1257	0.39
1258	0.4
1259	0.39
1260	0.37
1261	0.37
1262	0.44
1263	0.43
1264	0.39

A0A178ARQ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer