Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B4Y2

Protein Details
Accession A0A178B4Y2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-31TASLARPSKRKMARDRESNDLHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 11, cyto 5.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MPGELIRSVTASLARPSKRKMARDRESNDLHLITDQDVAYEQDIQRNPGSVKPWLDYVRFKKSRGSIVEQAYVFERAVEVLPRSYKLWKLYLELRTKHLAKKNPARFAPHYVKVNALFERALVLLNKMPRIWEMYLHFLMQQPLVTTTRRTFDRALRALPLTQHNRIWALYRPFATSASGETAVKIWRRYMQIHPEDAEDFIELLRDMRKYTEAVRKYMEILNNPRFKSKEAKGPFQFWTEMIDLIIDHAKEIDTSDDSGINVEKIIHSGIQTFPDQRGVLWVGLARYWMHKGEYEKARDVFEQAVTTVMTVRDFSIVFDTYVEAEETMIGIKLNEAAARSDKARVDEAADADLDIQMIRFESLMQRRPFLLNDVMLRQNPHNVIEWEKRVALWGDNKKEVVQTYTDAIAAINPKKAVGKFHELWTNYAKFYEAGGNLQNARIIMEKAVKVPFKSVAELAEMWCEFAEMELRNDNFDKAVDIMAKATQAPKRSNVDYFDDSLSPQQRVHKSWKLWSFYVDLVESVSTLEETKKVYERIFELRIATPQTVVNYANLLEENKYFEDCFKVYERGLDLFSYPVAFEIWNLYLTKAVDRKIGMERLRDLFEQAVEDCPPKFAKVLYLMYGALEEDRGLARHAMRIYERATRAVADEDRLEMFNFYITKSASNFGLTSTRPIYERAIGALPDGEAKEMCLKFAEMERRLGEIDRARAIYGHASQFCDPRTSPEFWKRWESFEVQHGNEDTYKEMLRIKRSVQAQYNTDVNFIASQAVARGRQNGAAENGEDDAADGEDAMAALEREARAPVGFVAASTGPLGGNIKSGDAQEAANPDAIDLDDDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.38
3 0.43
4 0.52
5 0.57
6 0.64
7 0.69
8 0.72
9 0.77
10 0.81
11 0.81
12 0.8
13 0.78
14 0.72
15 0.65
16 0.55
17 0.45
18 0.36
19 0.33
20 0.24
21 0.22
22 0.18
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.14
27 0.19
28 0.18
29 0.22
30 0.24
31 0.27
32 0.27
33 0.31
34 0.31
35 0.3
36 0.33
37 0.31
38 0.33
39 0.32
40 0.37
41 0.38
42 0.41
43 0.46
44 0.5
45 0.55
46 0.56
47 0.56
48 0.57
49 0.58
50 0.63
51 0.6
52 0.61
53 0.58
54 0.59
55 0.64
56 0.56
57 0.51
58 0.44
59 0.38
60 0.3
61 0.22
62 0.16
63 0.11
64 0.12
65 0.14
66 0.14
67 0.17
68 0.19
69 0.21
70 0.23
71 0.26
72 0.3
73 0.32
74 0.35
75 0.33
76 0.36
77 0.43
78 0.49
79 0.54
80 0.52
81 0.51
82 0.54
83 0.56
84 0.59
85 0.58
86 0.59
87 0.6
88 0.68
89 0.73
90 0.75
91 0.75
92 0.75
93 0.72
94 0.72
95 0.7
96 0.67
97 0.63
98 0.55
99 0.55
100 0.49
101 0.49
102 0.41
103 0.34
104 0.27
105 0.21
106 0.22
107 0.17
108 0.16
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.18
113 0.2
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.23
118 0.22
119 0.24
120 0.24
121 0.29
122 0.3
123 0.3
124 0.3
125 0.26
126 0.27
127 0.22
128 0.19
129 0.13
130 0.16
131 0.17
132 0.18
133 0.19
134 0.21
135 0.26
136 0.27
137 0.3
138 0.31
139 0.37
140 0.45
141 0.46
142 0.45
143 0.44
144 0.43
145 0.41
146 0.41
147 0.43
148 0.38
149 0.38
150 0.37
151 0.35
152 0.35
153 0.34
154 0.33
155 0.31
156 0.31
157 0.32
158 0.32
159 0.32
160 0.31
161 0.32
162 0.3
163 0.23
164 0.19
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.19
171 0.21
172 0.21
173 0.19
174 0.23
175 0.27
176 0.31
177 0.37
178 0.43
179 0.46
180 0.48
181 0.47
182 0.44
183 0.4
184 0.36
185 0.29
186 0.19
187 0.13
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.11
196 0.13
197 0.14
198 0.21
199 0.29
200 0.3
201 0.33
202 0.35
203 0.34
204 0.36
205 0.39
206 0.35
207 0.33
208 0.38
209 0.44
210 0.48
211 0.48
212 0.49
213 0.46
214 0.45
215 0.46
216 0.43
217 0.44
218 0.43
219 0.52
220 0.52
221 0.55
222 0.55
223 0.49
224 0.45
225 0.35
226 0.33
227 0.24
228 0.21
229 0.16
230 0.14
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.09
258 0.12
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.17
263 0.16
264 0.14
265 0.17
266 0.16
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.14
279 0.17
280 0.25
281 0.31
282 0.34
283 0.36
284 0.36
285 0.37
286 0.35
287 0.33
288 0.27
289 0.2
290 0.17
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.14
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.16
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.14
337 0.12
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.07
342 0.05
343 0.04
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.03
348 0.04
349 0.09
350 0.14
351 0.22
352 0.23
353 0.23
354 0.25
355 0.26
356 0.26
357 0.24
358 0.22
359 0.16
360 0.17
361 0.19
362 0.19
363 0.19
364 0.2
365 0.17
366 0.18
367 0.17
368 0.17
369 0.16
370 0.15
371 0.2
372 0.23
373 0.24
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.19
378 0.19
379 0.16
380 0.2
381 0.25
382 0.27
383 0.28
384 0.28
385 0.28
386 0.28
387 0.26
388 0.2
389 0.14
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.13
403 0.14
404 0.16
405 0.17
406 0.23
407 0.23
408 0.26
409 0.31
410 0.3
411 0.31
412 0.33
413 0.3
414 0.22
415 0.21
416 0.18
417 0.13
418 0.14
419 0.14
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.08
428 0.09
429 0.08
430 0.07
431 0.08
432 0.1
433 0.11
434 0.13
435 0.16
436 0.17
437 0.16
438 0.17
439 0.19
440 0.17
441 0.18
442 0.16
443 0.13
444 0.14
445 0.14
446 0.13
447 0.12
448 0.11
449 0.1
450 0.09
451 0.08
452 0.06
453 0.06
454 0.08
455 0.07
456 0.08
457 0.11
458 0.12
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.11
463 0.11
464 0.1
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.11
474 0.13
475 0.17
476 0.19
477 0.23
478 0.27
479 0.29
480 0.31
481 0.3
482 0.34
483 0.31
484 0.31
485 0.28
486 0.24
487 0.22
488 0.24
489 0.23
490 0.18
491 0.17
492 0.22
493 0.25
494 0.28
495 0.35
496 0.38
497 0.39
498 0.46
499 0.52
500 0.49
501 0.46
502 0.44
503 0.39
504 0.33
505 0.32
506 0.24
507 0.17
508 0.13
509 0.12
510 0.1
511 0.07
512 0.06
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.06
517 0.08
518 0.1
519 0.13
520 0.15
521 0.15
522 0.17
523 0.2
524 0.24
525 0.25
526 0.24
527 0.24
528 0.23
529 0.25
530 0.25
531 0.22
532 0.17
533 0.16
534 0.16
535 0.15
536 0.14
537 0.12
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.09
545 0.11
546 0.11
547 0.12
548 0.11
549 0.12
550 0.14
551 0.14
552 0.16
553 0.16
554 0.18
555 0.17
556 0.2
557 0.21
558 0.19
559 0.2
560 0.17
561 0.14
562 0.12
563 0.12
564 0.1
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.08
571 0.08
572 0.1
573 0.1
574 0.1
575 0.12
576 0.12
577 0.17
578 0.17
579 0.17
580 0.19
581 0.19
582 0.22
583 0.25
584 0.32
585 0.3
586 0.31
587 0.33
588 0.33
589 0.36
590 0.33
591 0.29
592 0.23
593 0.2
594 0.18
595 0.15
596 0.14
597 0.13
598 0.14
599 0.12
600 0.14
601 0.14
602 0.13
603 0.13
604 0.12
605 0.15
606 0.19
607 0.21
608 0.21
609 0.22
610 0.21
611 0.2
612 0.2
613 0.16
614 0.1
615 0.08
616 0.06
617 0.05
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.09
622 0.1
623 0.14
624 0.15
625 0.17
626 0.18
627 0.22
628 0.24
629 0.29
630 0.3
631 0.27
632 0.27
633 0.25
634 0.25
635 0.26
636 0.24
637 0.18
638 0.18
639 0.17
640 0.18
641 0.18
642 0.17
643 0.12
644 0.11
645 0.12
646 0.12
647 0.1
648 0.12
649 0.12
650 0.13
651 0.14
652 0.16
653 0.14
654 0.15
655 0.15
656 0.14
657 0.18
658 0.17
659 0.2
660 0.2
661 0.21
662 0.2
663 0.22
664 0.23
665 0.22
666 0.23
667 0.2
668 0.21
669 0.19
670 0.19
671 0.17
672 0.14
673 0.13
674 0.13
675 0.11
676 0.09
677 0.1
678 0.17
679 0.17
680 0.17
681 0.16
682 0.16
683 0.17
684 0.24
685 0.32
686 0.26
687 0.31
688 0.31
689 0.32
690 0.33
691 0.32
692 0.31
693 0.27
694 0.29
695 0.28
696 0.28
697 0.26
698 0.26
699 0.26
700 0.25
701 0.24
702 0.26
703 0.25
704 0.27
705 0.29
706 0.32
707 0.33
708 0.32
709 0.28
710 0.29
711 0.32
712 0.33
713 0.4
714 0.46
715 0.51
716 0.5
717 0.6
718 0.55
719 0.54
720 0.55
721 0.51
722 0.45
723 0.48
724 0.51
725 0.42
726 0.44
727 0.41
728 0.38
729 0.35
730 0.32
731 0.26
732 0.21
733 0.21
734 0.18
735 0.24
736 0.26
737 0.31
738 0.34
739 0.35
740 0.39
741 0.44
742 0.51
743 0.53
744 0.55
745 0.51
746 0.51
747 0.54
748 0.47
749 0.42
750 0.34
751 0.26
752 0.2
753 0.17
754 0.14
755 0.09
756 0.08
757 0.1
758 0.14
759 0.16
760 0.17
761 0.21
762 0.21
763 0.25
764 0.26
765 0.27
766 0.28
767 0.27
768 0.26
769 0.23
770 0.22
771 0.19
772 0.17
773 0.13
774 0.1
775 0.08
776 0.07
777 0.06
778 0.05
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.04
784 0.05
785 0.08
786 0.08
787 0.09
788 0.1
789 0.11
790 0.11
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.11
795 0.1
796 0.13
797 0.12
798 0.13
799 0.12
800 0.12
801 0.09
802 0.11
803 0.13
804 0.09
805 0.12
806 0.12
807 0.13
808 0.14
809 0.15
810 0.16
811 0.16
812 0.16
813 0.16
814 0.19
815 0.18
816 0.19
817 0.18
818 0.16
819 0.16
820 0.15