Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AJD9

Protein Details
Accession A0A178AJD9    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-188TVNGKDSKDPSKRRKPKSNIVKSNSSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-178PSKRRKPK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MFVLPPPPRYPTGGYPGLPPGQIIETNNTLTHPTGPEYQLVVGEGTYVLRDELHLATPPPHPSEAPVHNPNPLATTVSPPTAGTKLSLVALAPRQPSHSQLYRLGTRNSTRSQVPPSIQESPHESHSQASDTGSHGANGIASSPLEGLRTPVFGEGNTALATVNGKDSKDPSKRRKPKSNIVKSNSSFVSRVIPHEALSKRLQEHNPNGHYAFANINRALQWLDLTSPTKEEHMTKILFTKAHALCHDINQITKGPNHLDIVMGFSTGDIIWYEPMSQKYTRINKNGVINPTPVSDVRWLPNSENLFLAAHMDGCLVVYDKEKEDAVFVAEEQSPSTEDVMSDAGKKTNLTIKKSVNSKNQKANPVSCWQISSSKINAFEFSPDRRHLAVVSEDGSFRIIDFLREKLLHHYMSYYGGMICVCWSPDGRYIVTGGQDDLVSIWSLEDRVLVARCQGHNSWVTAVQFDPWRCDERNYRIGSVGEDCRLLLWDFSVGMLHRPRAASVRQRNSIASSNLKMQRTRTDSTANRLRSNSNLTSGSLLDDDEVVHPVEPRARTAMLPPVLAKKVDEHPVVWLGFEEDCILTTCKSGHIRTWDRPKEGATNDDSGQSTTSTSNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.46
4 0.44
5 0.38
6 0.31
7 0.26
8 0.23
9 0.25
10 0.24
11 0.23
12 0.24
13 0.26
14 0.26
15 0.25
16 0.23
17 0.22
18 0.23
19 0.2
20 0.2
21 0.24
22 0.25
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.23
27 0.22
28 0.19
29 0.13
30 0.12
31 0.1
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.09
39 0.11
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.18
44 0.23
45 0.26
46 0.27
47 0.27
48 0.25
49 0.27
50 0.34
51 0.37
52 0.41
53 0.45
54 0.44
55 0.45
56 0.46
57 0.43
58 0.38
59 0.31
60 0.27
61 0.2
62 0.24
63 0.23
64 0.23
65 0.23
66 0.21
67 0.23
68 0.21
69 0.2
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.11
76 0.14
77 0.17
78 0.2
79 0.22
80 0.21
81 0.26
82 0.26
83 0.3
84 0.34
85 0.36
86 0.36
87 0.4
88 0.46
89 0.48
90 0.52
91 0.51
92 0.5
93 0.49
94 0.5
95 0.47
96 0.45
97 0.41
98 0.41
99 0.44
100 0.44
101 0.42
102 0.41
103 0.44
104 0.47
105 0.44
106 0.41
107 0.41
108 0.37
109 0.39
110 0.36
111 0.3
112 0.25
113 0.26
114 0.26
115 0.21
116 0.19
117 0.16
118 0.16
119 0.18
120 0.16
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.07
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.17
155 0.26
156 0.35
157 0.44
158 0.51
159 0.61
160 0.71
161 0.79
162 0.87
163 0.86
164 0.88
165 0.89
166 0.9
167 0.89
168 0.85
169 0.85
170 0.75
171 0.72
172 0.62
173 0.53
174 0.42
175 0.33
176 0.33
177 0.24
178 0.25
179 0.25
180 0.24
181 0.21
182 0.29
183 0.29
184 0.26
185 0.28
186 0.29
187 0.27
188 0.33
189 0.37
190 0.38
191 0.45
192 0.5
193 0.5
194 0.49
195 0.46
196 0.41
197 0.37
198 0.3
199 0.26
200 0.19
201 0.21
202 0.19
203 0.19
204 0.17
205 0.18
206 0.17
207 0.13
208 0.11
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.22
225 0.21
226 0.2
227 0.25
228 0.22
229 0.24
230 0.24
231 0.25
232 0.23
233 0.25
234 0.29
235 0.21
236 0.2
237 0.19
238 0.21
239 0.18
240 0.18
241 0.18
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.15
246 0.13
247 0.11
248 0.14
249 0.11
250 0.1
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.08
262 0.09
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.23
267 0.31
268 0.37
269 0.39
270 0.41
271 0.41
272 0.48
273 0.5
274 0.46
275 0.39
276 0.34
277 0.3
278 0.28
279 0.25
280 0.18
281 0.15
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.17
286 0.18
287 0.17
288 0.22
289 0.21
290 0.19
291 0.18
292 0.17
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.16
336 0.2
337 0.23
338 0.29
339 0.32
340 0.37
341 0.44
342 0.5
343 0.54
344 0.58
345 0.6
346 0.64
347 0.66
348 0.68
349 0.65
350 0.61
351 0.54
352 0.48
353 0.45
354 0.36
355 0.31
356 0.25
357 0.25
358 0.24
359 0.24
360 0.23
361 0.23
362 0.25
363 0.24
364 0.23
365 0.2
366 0.22
367 0.21
368 0.22
369 0.23
370 0.22
371 0.25
372 0.24
373 0.24
374 0.21
375 0.2
376 0.19
377 0.16
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.1
384 0.08
385 0.09
386 0.08
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.15
391 0.15
392 0.16
393 0.19
394 0.24
395 0.22
396 0.2
397 0.2
398 0.18
399 0.2
400 0.19
401 0.14
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.1
412 0.15
413 0.18
414 0.17
415 0.17
416 0.18
417 0.19
418 0.2
419 0.18
420 0.13
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.07
435 0.09
436 0.09
437 0.12
438 0.16
439 0.17
440 0.21
441 0.21
442 0.22
443 0.23
444 0.24
445 0.23
446 0.22
447 0.22
448 0.19
449 0.18
450 0.18
451 0.21
452 0.2
453 0.22
454 0.21
455 0.26
456 0.26
457 0.31
458 0.37
459 0.4
460 0.48
461 0.47
462 0.46
463 0.44
464 0.43
465 0.4
466 0.37
467 0.31
468 0.24
469 0.21
470 0.19
471 0.17
472 0.18
473 0.16
474 0.11
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.08
481 0.13
482 0.16
483 0.17
484 0.18
485 0.19
486 0.2
487 0.23
488 0.3
489 0.35
490 0.43
491 0.51
492 0.53
493 0.55
494 0.55
495 0.55
496 0.54
497 0.48
498 0.43
499 0.37
500 0.41
501 0.45
502 0.47
503 0.45
504 0.43
505 0.47
506 0.48
507 0.48
508 0.43
509 0.47
510 0.47
511 0.54
512 0.59
513 0.55
514 0.53
515 0.53
516 0.51
517 0.47
518 0.51
519 0.44
520 0.4
521 0.37
522 0.33
523 0.32
524 0.3
525 0.26
526 0.19
527 0.16
528 0.12
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.1
536 0.12
537 0.17
538 0.17
539 0.18
540 0.21
541 0.22
542 0.22
543 0.25
544 0.32
545 0.29
546 0.29
547 0.29
548 0.32
549 0.33
550 0.33
551 0.3
552 0.26
553 0.3
554 0.36
555 0.36
556 0.29
557 0.31
558 0.36
559 0.35
560 0.3
561 0.24
562 0.19
563 0.17
564 0.17
565 0.14
566 0.09
567 0.1
568 0.13
569 0.14
570 0.12
571 0.13
572 0.14
573 0.19
574 0.24
575 0.26
576 0.3
577 0.39
578 0.47
579 0.55
580 0.66
581 0.68
582 0.67
583 0.67
584 0.65
585 0.63
586 0.59
587 0.55
588 0.49
589 0.45
590 0.41
591 0.42
592 0.39
593 0.31
594 0.29
595 0.23
596 0.2