FuNGI

A0A178BB11

Protein Details

Accession

A0A178BB11

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
183-210	PVNGDKTPPMEKKRKRRRWDESAASETP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
193-200	EKKRKRRR

Subcellular Location(s)

plas 15, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR000357 HEAT IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF02985 HEAT PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MAGPRAGKKSHVNGSGDMDTSNNKQSLMEASDKELYSGNGVDKYAGYDTSIAVGDHDDDMDDVALNGRSLTGQYTASKEILNEYAHGDTAEADILDSREKQAQIASRETDYQRRRFDRALSPDRADPFAKEGQEGGLSYKEIMQEREYEREKARVLKAIEDKENAGGNEVLDHQPTLKDGAAPVNGDKTPPMEKKRKRRRWDESAASETPATTEETKEQPETKKRSRWSPEPEAEKAPEAAAPARSRWDTTAMAPSGGATPAPVANGTGPVNPTFAFGTDISNRNAPLSDEQLDMMLPGEAEGYKVLEAPPGYEPVRRPVGMPALPTGYQGFLIPEADNSLAAMGKQLPTEIPGVGDLQFFKNEDMKYFGKLTDGADENEMTVEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGALFNQILPLLMERSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDLDHQDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWHARHTGVKIVQQIPILMGCAILPHLKGLVECIGENLNDEQPKVRMVTALALAALAEAASPYGIESFDDILNPLWTGARRQRGKALASFLKAVGYVIPLMDEEYSNYYTSQIMEIVIREFQSPDEEMKKVVLKVVSQCSNTAGVTPVYLKDNVLPEFFKHFWVRRMALDKRNYRQVVDTTVDLAQKAGVAEIVGRIVNNMKDENEAYRKMTVETVDKVISTLGAHDVDQRLEEQLIDGVLVAFQDQTIEDPIVIDGFATVVNALGERTKTYLPQIVATVLARLNNKSATVRQQAADLISRITFVMQKCDEDPQLIKLAQALYEYLGEEYPEVLGSILGALRAIVTVVGLHAMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGANYVNPREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGYIAKAIGPQDVLATLLGNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFMFEYIGEMAKDYVYAITPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGCVGLDCEDAMVHLLNLLWPNLFETSPHVIDRIIEAIEGIRNAVGTPLVLNYIWAGLFHPARKVRQPYWRIYNDAYVQSADSMTPAYPMFEEENLRRHELDIFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.54
3	0.46
4	0.38
5	0.3
6	0.27
7	0.27
8	0.3
9	0.24
10	0.21
11	0.21
12	0.22
13	0.27
14	0.28
15	0.3
16	0.26
17	0.3
18	0.35
19	0.35
20	0.34
21	0.3
22	0.25
23	0.22
24	0.23
25	0.21
26	0.18
27	0.18
28	0.18
29	0.17
30	0.2
31	0.19
32	0.16
33	0.15
34	0.13
35	0.13
36	0.14
37	0.15
38	0.12
39	0.11
40	0.11
41	0.11
42	0.11
43	0.11
44	0.09
45	0.08
46	0.09
47	0.09
48	0.08
49	0.06
50	0.08
51	0.09
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.09
57	0.1
58	0.1
59	0.12
60	0.15
61	0.19
62	0.22
63	0.23
64	0.23
65	0.21
66	0.23
67	0.24
68	0.23
69	0.2
70	0.2
71	0.2
72	0.19
73	0.19
74	0.15
75	0.12
76	0.12
77	0.11
78	0.08
79	0.07
80	0.08
81	0.09
82	0.12
83	0.12
84	0.13
85	0.18
86	0.18
87	0.19
88	0.23
89	0.29
90	0.31
91	0.36
92	0.37
93	0.34
94	0.4
95	0.43
96	0.47
97	0.49
98	0.53
99	0.57
100	0.59
101	0.62
102	0.6
103	0.64
104	0.64
105	0.67
106	0.67
107	0.64
108	0.62
109	0.62
110	0.6
111	0.56
112	0.47
113	0.38
114	0.35
115	0.33
116	0.3
117	0.26
118	0.24
119	0.22
120	0.22
121	0.21
122	0.18
123	0.15
124	0.14
125	0.14
126	0.16
127	0.19
128	0.19
129	0.21
130	0.2
131	0.26
132	0.29
133	0.37
134	0.38
135	0.39
136	0.4
137	0.43
138	0.44
139	0.45
140	0.45
141	0.44
142	0.42
143	0.45
144	0.5
145	0.51
146	0.53
147	0.47
148	0.45
149	0.4
150	0.42
151	0.33
152	0.28
153	0.22
154	0.17
155	0.16
156	0.18
157	0.16
158	0.14
159	0.14
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.14
164	0.12
165	0.12
166	0.13
167	0.17
168	0.18
169	0.19
170	0.19
171	0.21
172	0.21
173	0.2
174	0.2
175	0.18
176	0.25
177	0.31
178	0.39
179	0.46
180	0.55
181	0.66
182	0.77
183	0.84
184	0.86
185	0.89
186	0.91
187	0.9
188	0.92
189	0.9
190	0.87
191	0.83
192	0.74
193	0.65
194	0.55
195	0.44
196	0.34
197	0.24
198	0.19
199	0.13
200	0.14
201	0.16
202	0.19
203	0.23
204	0.25
205	0.29
206	0.35
207	0.43
208	0.51
209	0.56
210	0.61
211	0.64
212	0.71
213	0.75
214	0.76
215	0.76
216	0.77
217	0.77
218	0.75
219	0.73
220	0.67
221	0.61
222	0.52
223	0.44
224	0.33
225	0.26
226	0.21
227	0.19
228	0.19
229	0.19
230	0.18
231	0.22
232	0.23
233	0.23
234	0.23
235	0.25
236	0.22
237	0.23
238	0.3
239	0.26
240	0.25
241	0.23
242	0.22
243	0.19
244	0.17
245	0.14
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.1
254	0.11
255	0.12
256	0.13
257	0.13
258	0.14
259	0.13
260	0.15
261	0.12
262	0.12
263	0.13
264	0.12
265	0.16
266	0.19
267	0.22
268	0.22
269	0.24
270	0.23
271	0.21
272	0.21
273	0.19
274	0.17
275	0.19
276	0.19
277	0.18
278	0.18
279	0.17
280	0.16
281	0.14
282	0.12
283	0.07
284	0.05
285	0.04
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.15
299	0.16
300	0.19
301	0.2
302	0.23
303	0.28
304	0.26
305	0.26
306	0.26
307	0.32
308	0.31
309	0.3
310	0.27
311	0.25
312	0.25
313	0.25
314	0.21
315	0.14
316	0.13
317	0.12
318	0.1
319	0.08
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.07
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.11
338	0.09
339	0.09
340	0.08
341	0.09
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.11
347	0.11
348	0.12
349	0.16
350	0.16
351	0.16
352	0.2
353	0.2
354	0.22
355	0.23
356	0.21
357	0.18
358	0.19
359	0.18
360	0.18
361	0.19
362	0.17
363	0.16
364	0.16
365	0.15
366	0.14
367	0.13
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.14
375	0.14
376	0.16
377	0.19
378	0.24
379	0.27
380	0.35
381	0.42
382	0.44
383	0.49
384	0.5
385	0.48
386	0.49
387	0.49
388	0.46
389	0.45
390	0.43
391	0.43
392	0.45
393	0.45
394	0.43
395	0.48
396	0.51
397	0.46
398	0.43
399	0.42
400	0.45
401	0.52
402	0.51
403	0.42
404	0.33
405	0.31
406	0.3
407	0.26
408	0.2
409	0.12
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.07
423	0.09
424	0.11
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.14
429	0.15
430	0.16
431	0.13
432	0.14
433	0.13
434	0.17
435	0.19
436	0.17
437	0.18
438	0.18
439	0.18
440	0.18
441	0.18
442	0.13
443	0.13
444	0.14
445	0.14
446	0.15
447	0.17
448	0.16
449	0.17
450	0.19
451	0.19
452	0.17
453	0.15
454	0.13
455	0.14
456	0.14
457	0.14
458	0.12
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.06
464	0.04
465	0.03
466	0.04
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.09
474	0.1
475	0.12
476	0.12
477	0.14
478	0.14
479	0.14
480	0.14
481	0.12
482	0.1
483	0.07
484	0.07
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.1
498	0.14
499	0.15
500	0.14
501	0.18
502	0.2
503	0.22
504	0.23
505	0.2
506	0.15
507	0.16
508	0.16
509	0.14
510	0.13
511	0.11
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.07
517	0.06
518	0.05
519	0.04
520	0.04
521	0.03
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.02
526	0.03
527	0.03
528	0.04
529	0.06
530	0.08
531	0.11
532	0.16
533	0.2
534	0.22
535	0.26
536	0.36
537	0.45
538	0.52
539	0.57
540	0.58
541	0.6
542	0.65
543	0.64
544	0.61
545	0.53
546	0.47
547	0.44
548	0.38
549	0.34
550	0.27
551	0.24
552	0.18
553	0.16
554	0.13
555	0.08
556	0.06
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.05
561	0.05
562	0.04
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.06
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.09
579	0.09
580	0.1
581	0.1
582	0.09
583	0.07
584	0.07
585	0.09
586	0.09
587	0.08
588	0.07
589	0.06
590	0.06
591	0.05
592	0.04
593	0.03
594	0.02
595	0.02
596	0.02
597	0.02
598	0.02
599	0.02
600	0.02
601	0.03
602	0.03
603	0.04
604	0.05
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.06
611	0.06
612	0.05
613	0.06
614	0.09
615	0.14
616	0.22
617	0.24
618	0.26
619	0.31
620	0.35
621	0.37
622	0.36
623	0.37
624	0.31
625	0.3
626	0.3
627	0.25
628	0.2
629	0.18
630	0.15
631	0.09
632	0.07
633	0.05
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.08
642	0.09
643	0.09
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.1
648	0.09
649	0.07
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.07
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.09
660	0.09
661	0.11
662	0.13
663	0.13
664	0.13
665	0.14
666	0.16
667	0.14
668	0.16
669	0.14
670	0.13
671	0.17
672	0.23
673	0.25
674	0.23
675	0.24
676	0.23
677	0.23
678	0.21
679	0.17
680	0.13
681	0.09
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.09
686	0.1
687	0.09
688	0.1
689	0.14
690	0.14
691	0.15
692	0.14
693	0.14
694	0.19
695	0.2
696	0.21
697	0.21
698	0.23
699	0.26
700	0.3
701	0.31
702	0.29
703	0.36
704	0.39
705	0.43
706	0.49
707	0.52
708	0.51
709	0.59
710	0.55
711	0.49
712	0.46
713	0.4
714	0.36
715	0.3
716	0.27
717	0.19
718	0.21
719	0.2
720	0.16
721	0.15
722	0.1
723	0.09
724	0.08
725	0.06
726	0.04
727	0.04
728	0.04
729	0.04
730	0.05
731	0.04
732	0.04
733	0.05
734	0.07
735	0.08
736	0.09
737	0.1
738	0.1
739	0.11
740	0.12
741	0.16
742	0.19
743	0.19
744	0.19
745	0.2
746	0.2
747	0.19
748	0.2
749	0.18
750	0.17
751	0.17
752	0.18
753	0.17
754	0.16
755	0.16
756	0.14
757	0.12
758	0.09
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.1
764	0.11
765	0.11
766	0.11
767	0.11
768	0.1
769	0.1
770	0.09
771	0.07
772	0.07
773	0.06
774	0.06
775	0.05
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.03
781	0.03
782	0.03
783	0.03
784	0.04
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.05
793	0.03
794	0.03
795	0.03
796	0.03
797	0.03
798	0.03
799	0.03
800	0.04
801	0.04
802	0.05
803	0.06
804	0.06
805	0.09
806	0.09
807	0.1
808	0.13
809	0.18
810	0.17
811	0.18
812	0.18
813	0.16
814	0.17
815	0.16
816	0.15
817	0.11
818	0.14
819	0.13
820	0.13
821	0.15
822	0.14
823	0.16
824	0.16
825	0.19
826	0.23
827	0.27
828	0.29
829	0.27
830	0.28
831	0.28
832	0.27
833	0.26
834	0.19
835	0.15
836	0.13
837	0.13
838	0.11
839	0.11
840	0.13
841	0.11
842	0.17
843	0.17
844	0.19
845	0.2
846	0.23
847	0.23
848	0.22
849	0.23
850	0.19
851	0.22
852	0.21
853	0.19
854	0.18
855	0.17
856	0.15
857	0.15
858	0.12
859	0.09
860	0.09
861	0.1
862	0.08
863	0.08
864	0.07
865	0.07
866	0.07
867	0.06
868	0.05
869	0.05
870	0.04
871	0.04
872	0.04
873	0.04
874	0.04
875	0.04
876	0.04
877	0.04
878	0.03
879	0.04
880	0.04
881	0.03
882	0.03
883	0.03
884	0.03
885	0.04
886	0.04
887	0.05
888	0.07
889	0.08
890	0.09
891	0.1
892	0.12
893	0.13
894	0.14
895	0.15
896	0.14
897	0.2
898	0.21
899	0.22
900	0.24
901	0.26
902	0.31
903	0.37
904	0.45
905	0.45
906	0.5
907	0.53
908	0.59
909	0.61
910	0.63
911	0.61
912	0.6
913	0.57
914	0.52
915	0.5
916	0.42
917	0.35
918	0.28
919	0.23
920	0.14
921	0.11
922	0.08
923	0.07
924	0.08
925	0.07
926	0.1
927	0.1
928	0.14
929	0.16
930	0.2
931	0.21
932	0.23
933	0.25
934	0.28
935	0.28
936	0.27
937	0.29
938	0.28
939	0.27
940	0.24
941	0.23
942	0.23
943	0.22
944	0.22
945	0.17
946	0.18
947	0.22
948	0.22
949	0.24
950	0.22
951	0.27
952	0.33
953	0.43
954	0.49
955	0.5
956	0.59
957	0.65
958	0.71
959	0.67
960	0.6
961	0.51
962	0.41
963	0.38
964	0.29
965	0.21
966	0.13
967	0.15
968	0.14
969	0.13
970	0.13
971	0.11
972	0.11
973	0.1
974	0.09
975	0.07
976	0.07
977	0.07
978	0.08
979	0.09
980	0.09
981	0.09
982	0.11
983	0.13
984	0.14
985	0.21
986	0.24
987	0.3
988	0.34
989	0.37
990	0.37
991	0.35
992	0.34
993	0.28
994	0.25
995	0.19
996	0.15
997	0.11
998	0.09
999	0.08
1000	0.07
1001	0.06
1002	0.04
1003	0.04
1004	0.04
1005	0.05
1006	0.05
1007	0.06
1008	0.09
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.11
1012	0.16
1013	0.16
1014	0.18
1015	0.18
1016	0.17
1017	0.18
1018	0.18
1019	0.19
1020	0.2
1021	0.23
1022	0.25
1023	0.26
1024	0.24
1025	0.27
1026	0.26
1027	0.26
1028	0.2
1029	0.17
1030	0.14
1031	0.14
1032	0.15
1033	0.11
1034	0.11
1035	0.11
1036	0.11
1037	0.13
1038	0.12
1039	0.12
1040	0.11
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.09
1046	0.08
1047	0.07
1048	0.08
1049	0.08
1050	0.08
1051	0.08
1052	0.08
1053	0.08
1054	0.07
1055	0.06
1056	0.07
1057	0.1
1058	0.1
1059	0.1
1060	0.11
1061	0.14
1062	0.19
1063	0.21
1064	0.23
1065	0.2
1066	0.2
1067	0.22
1068	0.27
1069	0.3
1070	0.26
1071	0.27
1072	0.26
1073	0.25
1074	0.26
1075	0.25
1076	0.2
1077	0.13
1078	0.12
1079	0.1
1080	0.09
1081	0.08
1082	0.07
1083	0.07
1084	0.06
1085	0.06
1086	0.06
1087	0.06
1088	0.06
1089	0.06
1090	0.06
1091	0.06
1092	0.06
1093	0.08
1094	0.1
1095	0.1
1096	0.09
1097	0.09
1098	0.11
1099	0.13
1100	0.13
1101	0.11
1102	0.16
1103	0.21
1104	0.24
1105	0.24
1106	0.23
1107	0.21
1108	0.22
1109	0.23
1110	0.2
1111	0.14
1112	0.11
1113	0.11
1114	0.12
1115	0.14
1116	0.13
1117	0.11
1118	0.09
1119	0.09
1120	0.09
1121	0.09
1122	0.08
1123	0.06
1124	0.07
1125	0.07
1126	0.09
1127	0.09
1128	0.09
1129	0.09
1130	0.1
1131	0.09
1132	0.09
1133	0.09
1134	0.13
1135	0.17
1136	0.19
1137	0.26
1138	0.31
1139	0.36
1140	0.45
1141	0.53
1142	0.55
1143	0.62
1144	0.67
1145	0.69
1146	0.74
1147	0.74
1148	0.71
1149	0.66
1150	0.66
1151	0.61
1152	0.56
1153	0.49
1154	0.39
1155	0.34
1156	0.29
1157	0.26
1158	0.18
1159	0.13
1160	0.12
1161	0.1
1162	0.11
1163	0.1
1164	0.11
1165	0.1
1166	0.14
1167	0.16
1168	0.18
1169	0.23
1170	0.25
1171	0.33
1172	0.35
1173	0.38
1174	0.36
1175	0.34

A0A178BB11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer