Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A166B4C6

Protein Details
Accession A0A166B4C6    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-286DAMGKKPSTPRKAPKSRGRPKKDTGENBasic
300-321ASASAKKPRAPRSRKQPAKEGTHydrophilic
332-356GSPKAPASVKRPRGRPRKESTKDGABasic
364-385AAPVRRGRKSKQQSSTRAQTPLHydrophilic
417-440EGARTEGEGRQRKKRRVAAPASDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-229RRAKRRR
263-281GKKPSTPRKAPKSRGRPKK
304-317AKKPRAPRSRKQPA
335-351KAPASVKRPRGRPRKES
426-432RQRKKRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MFGFFSKKPSESGLAQSPDVPKPSGSSESNQQLRTPSPSVAPSNDLQLPPSTPGRESEEPEPALPSKPEPITESLHALVSSVPPKTLHVYTMTEIGKADESMLNALASFFATLTPPPRLHCARCHADFMEVENTERSCHVAHDDDAAEVERGGPSGYQTLWGCCEKITPGDGSEGPPDGWCYEGFHTTDIKRARFRADSTPTDDKLKSCLRLNCHGVRDALPRRAKRRREPELDLAEVADDAASSGTEDSGVAEIARGVDAMGKKPSTPRKAPKSRGRPKKDTGENGMDVDDASSVAASASASAKKPRAPRSRKQPAKEGTEVMEVDASTHGSPKAPASVKRPRGRPRKESTKDGAETGAESDAAPVRRGRKSKQQSSTRAQTPLQVEVVLPQRTRSQSRNARAASRARTGAETDGEGARTEGEGRQRKKRRVAAPASDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.39
3 0.42
4 0.42
5 0.41
6 0.4
7 0.35
8 0.27
9 0.26
10 0.3
11 0.32
12 0.31
13 0.31
14 0.37
15 0.45
16 0.51
17 0.49
18 0.46
19 0.43
20 0.44
21 0.46
22 0.4
23 0.32
24 0.3
25 0.34
26 0.36
27 0.35
28 0.36
29 0.3
30 0.32
31 0.35
32 0.31
33 0.28
34 0.26
35 0.25
36 0.25
37 0.29
38 0.26
39 0.22
40 0.25
41 0.32
42 0.34
43 0.36
44 0.37
45 0.39
46 0.39
47 0.39
48 0.38
49 0.32
50 0.31
51 0.28
52 0.25
53 0.24
54 0.24
55 0.25
56 0.25
57 0.28
58 0.3
59 0.3
60 0.32
61 0.26
62 0.26
63 0.24
64 0.21
65 0.18
66 0.17
67 0.18
68 0.14
69 0.15
70 0.14
71 0.16
72 0.21
73 0.21
74 0.19
75 0.2
76 0.22
77 0.22
78 0.29
79 0.27
80 0.23
81 0.22
82 0.22
83 0.19
84 0.16
85 0.16
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.07
100 0.1
101 0.14
102 0.15
103 0.17
104 0.24
105 0.28
106 0.31
107 0.36
108 0.42
109 0.44
110 0.46
111 0.48
112 0.42
113 0.4
114 0.37
115 0.34
116 0.31
117 0.25
118 0.23
119 0.21
120 0.2
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.12
135 0.09
136 0.09
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.15
175 0.21
176 0.23
177 0.25
178 0.25
179 0.26
180 0.29
181 0.29
182 0.32
183 0.35
184 0.37
185 0.37
186 0.41
187 0.45
188 0.42
189 0.43
190 0.4
191 0.32
192 0.31
193 0.31
194 0.27
195 0.28
196 0.3
197 0.31
198 0.36
199 0.42
200 0.41
201 0.39
202 0.38
203 0.33
204 0.32
205 0.36
206 0.33
207 0.36
208 0.37
209 0.39
210 0.47
211 0.54
212 0.6
213 0.62
214 0.68
215 0.69
216 0.71
217 0.73
218 0.72
219 0.68
220 0.61
221 0.51
222 0.41
223 0.32
224 0.24
225 0.18
226 0.09
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.02
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.06
247 0.07
248 0.09
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.19
253 0.28
254 0.33
255 0.41
256 0.48
257 0.57
258 0.67
259 0.76
260 0.8
261 0.83
262 0.86
263 0.88
264 0.88
265 0.85
266 0.82
267 0.82
268 0.8
269 0.75
270 0.71
271 0.67
272 0.59
273 0.51
274 0.44
275 0.34
276 0.26
277 0.2
278 0.13
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.06
288 0.08
289 0.1
290 0.14
291 0.16
292 0.21
293 0.29
294 0.39
295 0.48
296 0.54
297 0.62
298 0.7
299 0.79
300 0.83
301 0.81
302 0.8
303 0.77
304 0.76
305 0.7
306 0.61
307 0.53
308 0.48
309 0.42
310 0.33
311 0.26
312 0.18
313 0.15
314 0.14
315 0.12
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.18
323 0.21
324 0.26
325 0.32
326 0.42
327 0.51
328 0.58
329 0.66
330 0.69
331 0.76
332 0.81
333 0.83
334 0.83
335 0.84
336 0.83
337 0.83
338 0.8
339 0.78
340 0.7
341 0.62
342 0.53
343 0.42
344 0.36
345 0.28
346 0.22
347 0.12
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.17
354 0.23
355 0.3
356 0.35
357 0.4
358 0.47
359 0.57
360 0.66
361 0.72
362 0.77
363 0.78
364 0.82
365 0.86
366 0.8
367 0.75
368 0.65
369 0.61
370 0.54
371 0.49
372 0.41
373 0.32
374 0.26
375 0.25
376 0.32
377 0.3
378 0.27
379 0.25
380 0.31
381 0.36
382 0.42
383 0.41
384 0.45
385 0.51
386 0.59
387 0.66
388 0.64
389 0.64
390 0.65
391 0.68
392 0.64
393 0.6
394 0.55
395 0.47
396 0.46
397 0.43
398 0.4
399 0.33
400 0.28
401 0.24
402 0.23
403 0.22
404 0.19
405 0.17
406 0.14
407 0.13
408 0.13
409 0.14
410 0.23
411 0.31
412 0.37
413 0.48
414 0.58
415 0.66
416 0.75
417 0.81
418 0.8
419 0.82
420 0.86