Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165YBC9

Protein Details
Accession A0A165YBC9    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MTSEAPVKRRKSKGDKAAAAPESHydrophilic
31-57PESSSTAKVARKDRKKKSRGSAAASEAHydrophilic
88-111PVEEGEGKKKKKRKSQAAEESESVHydrophilic
117-142AESAPAPAPKKEKKRKAKAAEDAAPVHydrophilic
151-176TEEPAAPTPKKEKKRKSKAVEEAAPVHydrophilic
311-330VESAAPKKKKQRKSVTIDEDHydrophilic
443-466DRDDKTVKRRLEKAKREKNVDRGVBasic
490-510TVTRLRLSRSKKTGRSKHYGFHydrophilic
578-601VEKARAEKRLLKRQEARKRKLADABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-15KRRKSKGD
38-50KVARKDRKKKSRG
72-80GKKEKKRKA
92-102GEGKKKKKRKS
123-135PAPKKEKKRKAKA
158-168TPKKEKKRKSK
193-199KKGKKKE
248-249KG
317-323KKKKQRK
348-374KKTKKTAAAVKTPAPTPAKAKKGPRAP
451-458RRLEKAKR
575-597RDGVEKARAEKRLLKRQEARKRK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MTSEAPVKRRKSKGDKAAAAPESASATAAEPESSSTAKVARKDRKKKSRGSAAASEAETAEVTAPVEEVEGGKKEKKRKAVEVEAEAPVEEGEGKKKKKRKSQAAEESESVPVEVAAESAPAPAPKKEKKRKAKAAEDAAPVVEAAPTPATEEPAAPTPKKEKKRKSKAVEEAAPVVETVAVVEEASSSVAPKKGKKKEKEAVVETTDSETATLVAADGVLAAAAVVHQQVETYTETPAPAPFKASKKGAKKAASSIADAPAVDEPATDVPAASTRAKTSKKAAKKTATTVTTTTIEDVVVPAVAAQVTPVESAAPKKKKQRKSVTIDEDAPMPEPSSPEKAPVSILKKTKKTAAAVKTPAPTPAKAKKGPRAPSPAPEPSESDEDIAMPGSDDEEAAAAAQDSDADSEDLHLRGFSTDEDSSDEEMDDDEPGVDVGSLPTIDRDDKTVKRRLEKAKREKNVDRGVIYLGRIPHGFYEDQMKAYFSQFGTVTRLRLSRSKKTGRSKHYGFIEFDSSAVAQIVAETMDNYLLLGHILQCSVIPREDVHPSLWVGANRKYRAVPHDRLARVSHNRERDGVEKARAEKRLLKRQEARKRKLADAGIDYDLEGAAYKKPKGVEAAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.81
4 0.83
5 0.74
6 0.64
7 0.53
8 0.44
9 0.35
10 0.27
11 0.22
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.13
16 0.12
17 0.1
18 0.11
19 0.14
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.18
24 0.22
25 0.29
26 0.37
27 0.45
28 0.56
29 0.66
30 0.76
31 0.82
32 0.87
33 0.9
34 0.91
35 0.91
36 0.89
37 0.86
38 0.83
39 0.77
40 0.73
41 0.63
42 0.53
43 0.42
44 0.34
45 0.26
46 0.18
47 0.13
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.09
57 0.12
58 0.15
59 0.22
60 0.28
61 0.37
62 0.44
63 0.53
64 0.58
65 0.65
66 0.71
67 0.75
68 0.77
69 0.75
70 0.73
71 0.65
72 0.57
73 0.47
74 0.37
75 0.26
76 0.19
77 0.12
78 0.09
79 0.15
80 0.23
81 0.3
82 0.38
83 0.46
84 0.55
85 0.64
86 0.75
87 0.78
88 0.8
89 0.86
90 0.89
91 0.9
92 0.86
93 0.77
94 0.68
95 0.58
96 0.47
97 0.35
98 0.24
99 0.15
100 0.1
101 0.08
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.07
108 0.09
109 0.11
110 0.14
111 0.22
112 0.31
113 0.42
114 0.52
115 0.62
116 0.72
117 0.81
118 0.88
119 0.9
120 0.92
121 0.9
122 0.88
123 0.85
124 0.77
125 0.67
126 0.56
127 0.45
128 0.35
129 0.25
130 0.16
131 0.09
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.18
142 0.22
143 0.21
144 0.24
145 0.32
146 0.41
147 0.5
148 0.59
149 0.63
150 0.71
151 0.82
152 0.89
153 0.89
154 0.9
155 0.9
156 0.89
157 0.84
158 0.76
159 0.67
160 0.57
161 0.47
162 0.36
163 0.26
164 0.16
165 0.1
166 0.07
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.11
178 0.14
179 0.21
180 0.31
181 0.4
182 0.5
183 0.57
184 0.66
185 0.7
186 0.76
187 0.78
188 0.73
189 0.69
190 0.62
191 0.55
192 0.45
193 0.39
194 0.3
195 0.21
196 0.16
197 0.11
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.06
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.14
229 0.18
230 0.21
231 0.26
232 0.31
233 0.37
234 0.42
235 0.5
236 0.54
237 0.54
238 0.52
239 0.52
240 0.55
241 0.49
242 0.43
243 0.37
244 0.31
245 0.26
246 0.24
247 0.2
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.18
264 0.2
265 0.22
266 0.29
267 0.35
268 0.42
269 0.5
270 0.56
271 0.57
272 0.58
273 0.62
274 0.61
275 0.54
276 0.48
277 0.41
278 0.35
279 0.3
280 0.26
281 0.21
282 0.14
283 0.12
284 0.1
285 0.09
286 0.06
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.08
301 0.16
302 0.22
303 0.27
304 0.37
305 0.46
306 0.55
307 0.65
308 0.73
309 0.75
310 0.77
311 0.82
312 0.8
313 0.75
314 0.67
315 0.57
316 0.47
317 0.37
318 0.3
319 0.2
320 0.13
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.14
325 0.13
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.21
331 0.24
332 0.25
333 0.32
334 0.36
335 0.39
336 0.4
337 0.44
338 0.43
339 0.42
340 0.45
341 0.45
342 0.46
343 0.45
344 0.48
345 0.45
346 0.41
347 0.42
348 0.35
349 0.3
350 0.29
351 0.34
352 0.37
353 0.4
354 0.46
355 0.49
356 0.56
357 0.6
358 0.6
359 0.62
360 0.57
361 0.57
362 0.57
363 0.55
364 0.49
365 0.44
366 0.4
367 0.34
368 0.35
369 0.3
370 0.24
371 0.18
372 0.15
373 0.14
374 0.12
375 0.09
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.06
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.07
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.13
408 0.15
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.1
413 0.11
414 0.1
415 0.08
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.13
432 0.19
433 0.25
434 0.32
435 0.39
436 0.43
437 0.49
438 0.57
439 0.65
440 0.69
441 0.74
442 0.78
443 0.81
444 0.84
445 0.86
446 0.84
447 0.82
448 0.8
449 0.73
450 0.63
451 0.53
452 0.49
453 0.41
454 0.35
455 0.28
456 0.2
457 0.18
458 0.17
459 0.16
460 0.14
461 0.16
462 0.15
463 0.13
464 0.2
465 0.19
466 0.21
467 0.2
468 0.21
469 0.19
470 0.2
471 0.23
472 0.15
473 0.17
474 0.16
475 0.17
476 0.22
477 0.23
478 0.23
479 0.23
480 0.25
481 0.25
482 0.32
483 0.37
484 0.41
485 0.49
486 0.58
487 0.64
488 0.73
489 0.8
490 0.81
491 0.83
492 0.78
493 0.76
494 0.74
495 0.7
496 0.61
497 0.55
498 0.51
499 0.41
500 0.36
501 0.29
502 0.21
503 0.16
504 0.14
505 0.1
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.1
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.14
530 0.17
531 0.22
532 0.23
533 0.22
534 0.22
535 0.22
536 0.24
537 0.26
538 0.26
539 0.25
540 0.32
541 0.39
542 0.38
543 0.41
544 0.41
545 0.43
546 0.48
547 0.53
548 0.51
549 0.52
550 0.6
551 0.58
552 0.6
553 0.58
554 0.58
555 0.58
556 0.61
557 0.61
558 0.59
559 0.6
560 0.59
561 0.6
562 0.54
563 0.52
564 0.49
565 0.47
566 0.45
567 0.49
568 0.53
569 0.53
570 0.54
571 0.56
572 0.6
573 0.64
574 0.66
575 0.69
576 0.72
577 0.79
578 0.85
579 0.87
580 0.85
581 0.84
582 0.82
583 0.77
584 0.76
585 0.71
586 0.67
587 0.62
588 0.58
589 0.51
590 0.45
591 0.39
592 0.31
593 0.25
594 0.17
595 0.12
596 0.09
597 0.12
598 0.17
599 0.18
600 0.21
601 0.23
602 0.26