Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165XGB6

Protein Details
Accession A0A165XGB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
306-330VAQPHTTQPKRKKRTSSPPPPAPEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
315-319KRKKR
484-493KGARKRRRRK
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 6, cyto_nucl 5.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014886  La_xRRM  
IPR045537  Lar7_xRRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0070034  F:telomerase RNA binding  
GO:1904868  P:telomerase catalytic core complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF19977  xRRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51939  XRRM  
Amino Acid Sequences MSFAFVPRSVGRSKPRGGVSSPSTAVTMSRGAAVQSPQPTIATPSTASSSRSVPSISGEDIALLLSLVLSEYALWVAPALRDPNRDGYVALSSVISSHSALQDPSLSEAVVVKSLRQYAPDGYDIRMILATGVKHGPPGGYEIRRRDWDKVVSSFSSYSRNAWQAKALYVERLPHAARAHLGILKLFKTLLPNTPNPLQTISFPAHHQDPPDAVPKCKGFALLTLTNKADLDKILADWPWSSESSTISERGREASEDILEEARRAGMRTLAKAAWDKLQDEYLAYRARLLEEIARAEAEEPAAQPVAQPHTTQPKRKKRTSSPPPPAPEPEPAAEAPASKSTLTASSRYPPACVVRVRNVVPGTNKTALRSLFAISGAELDYVDFTKGLDSCYLRVASSSHAHKLVGHFASHPTVQKDALDDAGAPASEHEQLRPLVVELLDGRQEEVYWGQVPEKVRKQAVLKATSAAGLTVEPEGGEGEETKGARKRRRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.55
3 0.55
4 0.55
5 0.56
6 0.52
7 0.51
8 0.48
9 0.41
10 0.36
11 0.32
12 0.29
13 0.23
14 0.2
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.16
20 0.17
21 0.21
22 0.22
23 0.23
24 0.22
25 0.23
26 0.23
27 0.24
28 0.24
29 0.21
30 0.18
31 0.19
32 0.22
33 0.23
34 0.24
35 0.22
36 0.23
37 0.21
38 0.22
39 0.2
40 0.17
41 0.2
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.1
50 0.06
51 0.05
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.05
64 0.06
65 0.09
66 0.14
67 0.17
68 0.2
69 0.23
70 0.3
71 0.31
72 0.31
73 0.28
74 0.25
75 0.25
76 0.22
77 0.2
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.11
82 0.1
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.14
93 0.12
94 0.11
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.12
100 0.14
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.2
105 0.19
106 0.22
107 0.26
108 0.25
109 0.22
110 0.25
111 0.23
112 0.21
113 0.18
114 0.15
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.14
126 0.19
127 0.23
128 0.29
129 0.33
130 0.38
131 0.44
132 0.46
133 0.46
134 0.45
135 0.46
136 0.46
137 0.44
138 0.43
139 0.38
140 0.37
141 0.35
142 0.3
143 0.29
144 0.24
145 0.23
146 0.23
147 0.28
148 0.28
149 0.27
150 0.3
151 0.26
152 0.26
153 0.29
154 0.25
155 0.22
156 0.21
157 0.22
158 0.19
159 0.21
160 0.2
161 0.19
162 0.19
163 0.17
164 0.17
165 0.16
166 0.17
167 0.15
168 0.15
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.1
175 0.13
176 0.14
177 0.19
178 0.22
179 0.24
180 0.27
181 0.31
182 0.31
183 0.29
184 0.29
185 0.23
186 0.19
187 0.22
188 0.2
189 0.17
190 0.17
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.24
199 0.23
200 0.21
201 0.24
202 0.23
203 0.23
204 0.22
205 0.21
206 0.13
207 0.15
208 0.2
209 0.21
210 0.22
211 0.23
212 0.23
213 0.22
214 0.22
215 0.2
216 0.14
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.16
257 0.15
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.16
265 0.17
266 0.15
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.13
273 0.12
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.08
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.15
297 0.26
298 0.32
299 0.41
300 0.49
301 0.56
302 0.64
303 0.71
304 0.78
305 0.77
306 0.83
307 0.86
308 0.86
309 0.86
310 0.86
311 0.83
312 0.77
313 0.71
314 0.63
315 0.56
316 0.48
317 0.38
318 0.32
319 0.27
320 0.25
321 0.2
322 0.18
323 0.16
324 0.14
325 0.14
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.16
330 0.17
331 0.17
332 0.18
333 0.21
334 0.27
335 0.27
336 0.27
337 0.25
338 0.27
339 0.3
340 0.32
341 0.32
342 0.34
343 0.4
344 0.4
345 0.43
346 0.4
347 0.39
348 0.39
349 0.38
350 0.36
351 0.36
352 0.35
353 0.31
354 0.34
355 0.31
356 0.29
357 0.26
358 0.21
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.11
363 0.12
364 0.1
365 0.09
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.18
380 0.19
381 0.16
382 0.17
383 0.17
384 0.17
385 0.23
386 0.26
387 0.26
388 0.26
389 0.27
390 0.28
391 0.3
392 0.33
393 0.28
394 0.25
395 0.23
396 0.24
397 0.27
398 0.27
399 0.28
400 0.23
401 0.23
402 0.23
403 0.23
404 0.22
405 0.21
406 0.19
407 0.16
408 0.14
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.1
413 0.09
414 0.1
415 0.13
416 0.14
417 0.13
418 0.16
419 0.16
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.15
424 0.15
425 0.16
426 0.14
427 0.16
428 0.18
429 0.17
430 0.17
431 0.14
432 0.15
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.18
440 0.22
441 0.3
442 0.37
443 0.41
444 0.41
445 0.46
446 0.49
447 0.53
448 0.58
449 0.53
450 0.47
451 0.42
452 0.41
453 0.36
454 0.32
455 0.24
456 0.16
457 0.11
458 0.11
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.13
469 0.14
470 0.19
471 0.25
472 0.33
473 0.42