FuNGI

J4UVQ0

Protein Details

Accession

J4UVQ0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
184-205	EQDLKDPKRARHPTKKHLKAVE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
192-198	RARHPTK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1
CDD	cd15841 SNARE_Qc

Amino Acid Sequences

MSSSAPRSGERVIHQDFIARIRYSNALPPPPNPPKLLDIPNTGLSSGQYTTPGFASRLAREQPLNIEADAELGMPLDLVGMPGVFDGDESSLQAPAQAPPVHPHDKPLLRPIAALGKPKVAEANVSFLRRTEYISSLASKRFEGNSPRALLMKAKRPVVRQAEAAADAPETIKRKIEHSFDVAEQDLKDPKRARHPTKKHLKAVEVTPLIPDLDAFPDSGAYVTIKFLTNPMAGSGNKFDSRLLSSLFRPIDKTQQEEAAYEAALAAHEADPVGNPKPQNLMNYDFYLGDGPEVGKNFRRKFDVDDPEHDEDALYTDQAGGCFQFNRVRAYETAQETELDHTTKYQDEVLLAFNDDESYPRQKAVYYYPVMQKSTIRPQRTKNIARTAGIYEEEQIVDQLDITVDDPTEEMRDAMKRYREQPLGWDQEGEEEEEEPQQEDEVVEELEEEEEAAATEQPEEDGDGDEADTRHRSPEEEGDAEGDEDED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.39
3	0.37
4	0.36
5	0.37
6	0.29
7	0.26
8	0.27
9	0.3
10	0.27
11	0.33
12	0.36
13	0.38
14	0.4
15	0.42
16	0.49
17	0.55
18	0.57
19	0.51
20	0.48
21	0.46
22	0.5
23	0.55
24	0.5
25	0.47
26	0.47
27	0.49
28	0.47
29	0.4
30	0.33
31	0.27
32	0.25
33	0.2
34	0.16
35	0.14
36	0.14
37	0.15
38	0.16
39	0.17
40	0.15
41	0.19
42	0.23
43	0.23
44	0.3
45	0.31
46	0.34
47	0.33
48	0.34
49	0.34
50	0.32
51	0.31
52	0.24
53	0.22
54	0.18
55	0.18
56	0.16
57	0.11
58	0.08
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.04
74	0.06
75	0.06
76	0.07
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.16
84	0.16
85	0.17
86	0.2
87	0.28
88	0.31
89	0.3
90	0.33
91	0.36
92	0.4
93	0.42
94	0.46
95	0.44
96	0.39
97	0.4
98	0.38
99	0.38
100	0.36
101	0.39
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.31
106	0.3
107	0.21
108	0.22
109	0.17
110	0.23
111	0.23
112	0.24
113	0.24
114	0.22
115	0.26
116	0.22
117	0.24
118	0.2
119	0.18
120	0.2
121	0.21
122	0.25
123	0.24
124	0.27
125	0.25
126	0.23
127	0.23
128	0.23
129	0.26
130	0.29
131	0.32
132	0.34
133	0.35
134	0.35
135	0.33
136	0.32
137	0.33
138	0.32
139	0.35
140	0.34
141	0.38
142	0.41
143	0.43
144	0.51
145	0.52
146	0.49
147	0.41
148	0.39
149	0.35
150	0.32
151	0.3
152	0.22
153	0.14
154	0.12
155	0.11
156	0.12
157	0.12
158	0.12
159	0.15
160	0.15
161	0.18
162	0.23
163	0.27
164	0.27
165	0.28
166	0.3
167	0.26
168	0.28
169	0.26
170	0.22
171	0.18
172	0.17
173	0.19
174	0.17
175	0.22
176	0.24
177	0.27
178	0.36
179	0.46
180	0.54
181	0.59
182	0.68
183	0.73
184	0.8
185	0.86
186	0.82
187	0.77
188	0.71
189	0.64
190	0.57
191	0.55
192	0.44
193	0.36
194	0.28
195	0.24
196	0.2
197	0.16
198	0.14
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.04
209	0.04
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.11
220	0.11
221	0.12
222	0.13
223	0.13
224	0.13
225	0.14
226	0.13
227	0.11
228	0.13
229	0.13
230	0.13
231	0.12
232	0.12
233	0.18
234	0.18
235	0.17
236	0.18
237	0.18
238	0.25
239	0.25
240	0.29
241	0.24
242	0.27
243	0.28
244	0.25
245	0.25
246	0.17
247	0.15
248	0.1
249	0.09
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.03
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.06
260	0.08
261	0.1
262	0.09
263	0.1
264	0.14
265	0.16
266	0.18
267	0.19
268	0.23
269	0.23
270	0.24
271	0.24
272	0.21
273	0.19
274	0.18
275	0.14
276	0.09
277	0.07
278	0.06
279	0.07
280	0.08
281	0.09
282	0.14
283	0.22
284	0.25
285	0.27
286	0.3
287	0.3
288	0.37
289	0.46
290	0.5
291	0.46
292	0.49
293	0.53
294	0.52
295	0.51
296	0.43
297	0.33
298	0.23
299	0.22
300	0.17
301	0.1
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.09
311	0.13
312	0.15
313	0.18
314	0.19
315	0.21
316	0.21
317	0.25
318	0.29
319	0.27
320	0.27
321	0.24
322	0.24
323	0.22
324	0.24
325	0.21
326	0.15
327	0.13
328	0.12
329	0.13
330	0.13
331	0.13
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.12
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.11
345	0.15
346	0.15
347	0.16
348	0.17
349	0.17
350	0.2
351	0.25
352	0.3
353	0.28
354	0.33
355	0.39
356	0.43
357	0.43
358	0.41
359	0.38
360	0.37
361	0.45
362	0.47
363	0.48
364	0.5
365	0.55
366	0.64
367	0.71
368	0.73
369	0.7
370	0.72
371	0.69
372	0.65
373	0.61
374	0.53
375	0.45
376	0.38
377	0.3
378	0.21
379	0.19
380	0.17
381	0.14
382	0.12
383	0.1
384	0.08
385	0.08
386	0.07
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.1
399	0.14
400	0.17
401	0.23
402	0.3
403	0.34
404	0.38
405	0.47
406	0.49
407	0.46
408	0.5
409	0.54
410	0.54
411	0.49
412	0.46
413	0.36
414	0.37
415	0.37
416	0.32
417	0.22
418	0.15
419	0.16
420	0.16
421	0.17
422	0.13
423	0.12
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.13
453	0.12
454	0.15
455	0.17
456	0.16
457	0.2
458	0.2
459	0.22
460	0.24
461	0.32
462	0.36
463	0.35
464	0.35
465	0.32
466	0.32
467	0.31

J4UVQ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer