Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JQW5

Protein Details
Accession J5JQW5    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-33QQFCAFKLKTPKEQNFCRNEYHydrophilic
271-308SDEDETEKKSNKRKRGRVIKMKNKRLRQDEKEKEKLTLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-161LVPKLAPKIRHRERARERKAEAA
278-301KKSNKRKRGRVIKMKNKRLRQDEK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR006958  Mak16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF04874  Mak16  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MASDEIVWQIINQQFCAFKLKTPKEQNFCRNEYNVTGLCNRQSCPLANSRYATVRQHPTKQTLYLYMKTVERAHLPSKMWERIKLSNNYSKALEQIDERLIYWPKFLTHKCKQRLTRLTQVQIRMRRIAAEEERLGEKLVPKLAPKIRHRERARERKAEAAAKLERTIERELLERLRQGAYGEQPLNVSEDIWKKVLNAMEREGNGVRDEDMDEGIDSDEEELDSELEDGEKAVEYVSDLDESEEELNDLQDWLESDEEDEEEEEDDEDESDEDETEKKSNKRKRGRVIKMKNKRLRQDEKEKEKLTLTNDLAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.29
4 0.23
5 0.25
6 0.35
7 0.42
8 0.5
9 0.59
10 0.67
11 0.69
12 0.78
13 0.83
14 0.8
15 0.79
16 0.74
17 0.67
18 0.61
19 0.54
20 0.5
21 0.42
22 0.37
23 0.35
24 0.31
25 0.33
26 0.32
27 0.3
28 0.29
29 0.3
30 0.29
31 0.31
32 0.36
33 0.37
34 0.39
35 0.4
36 0.38
37 0.4
38 0.41
39 0.41
40 0.41
41 0.46
42 0.48
43 0.54
44 0.56
45 0.58
46 0.58
47 0.57
48 0.51
49 0.5
50 0.49
51 0.43
52 0.41
53 0.38
54 0.35
55 0.34
56 0.33
57 0.27
58 0.25
59 0.26
60 0.27
61 0.29
62 0.29
63 0.33
64 0.38
65 0.44
66 0.43
67 0.43
68 0.45
69 0.48
70 0.54
71 0.54
72 0.53
73 0.53
74 0.53
75 0.51
76 0.47
77 0.4
78 0.34
79 0.29
80 0.23
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.18
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.16
91 0.16
92 0.22
93 0.25
94 0.3
95 0.37
96 0.46
97 0.53
98 0.61
99 0.65
100 0.69
101 0.75
102 0.73
103 0.74
104 0.71
105 0.7
106 0.65
107 0.66
108 0.62
109 0.59
110 0.55
111 0.47
112 0.41
113 0.35
114 0.32
115 0.31
116 0.27
117 0.24
118 0.22
119 0.21
120 0.22
121 0.21
122 0.2
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.2
130 0.24
131 0.32
132 0.35
133 0.44
134 0.48
135 0.57
136 0.6
137 0.64
138 0.7
139 0.73
140 0.76
141 0.73
142 0.67
143 0.63
144 0.64
145 0.57
146 0.47
147 0.42
148 0.36
149 0.3
150 0.29
151 0.24
152 0.21
153 0.2
154 0.2
155 0.16
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.17
169 0.17
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.14
175 0.12
176 0.11
177 0.14
178 0.15
179 0.16
180 0.15
181 0.14
182 0.17
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.2
187 0.23
188 0.23
189 0.25
190 0.23
191 0.2
192 0.17
193 0.15
194 0.13
195 0.1
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.1
263 0.14
264 0.2
265 0.27
266 0.36
267 0.45
268 0.55
269 0.65
270 0.74
271 0.81
272 0.86
273 0.9
274 0.92
275 0.94
276 0.95
277 0.95
278 0.96
279 0.94
280 0.93
281 0.91
282 0.9
283 0.9
284 0.88
285 0.89
286 0.89
287 0.89
288 0.89
289 0.82
290 0.74
291 0.68
292 0.62
293 0.55
294 0.54