Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165YQ60

Protein Details
Accession A0A165YQ60    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-94DYVQEKEPSSTKKRKRRRRDPAQAEGEEGGGGGRRRRATQQRKAPKKSGPTQBasic
114-140IDALIKVKRTNRPKKRKKNEEDVLDQFHydrophilic
345-367DMDSERRKRNAERMRNLTRKIQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-90TKKRKRRRRDPAQAEGEEGGGGGRRRRATQQRKAPKKS
119-131KVKRTNRPKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MADNEPLNERDIFGEDSDLSDLDDGAPGQRAVAESSGEDSGEDYVQEKEPSSTKKRKRRRRDPAQAEGEEGGGGGRRRRATQQRKAPKKSGPTQEELDAMTPEERGRLKIDAEIDALIKVKRTNRPKKRKKNEEDVLDQFADEEVSRLREMMLAAADDDMEANRRKAPASAKLRLLPQVMETLRKNALWESIVDNNLMEAVRRWLEPLPDKSLPALNIQKDFMEILPALEITTQILRESQLGRIILFYTKCKRVTPDVKRVAERLMEAWTRPIVKRSASYRDRAIPTAAAPQQRERERLGAILARGKEEPRRTRPNAVAIPQREMGTYTVAPQSGLVKANHMSVDMDSERRKRNAERMRNLTRKIQSQRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.17
4 0.17
5 0.15
6 0.13
7 0.11
8 0.11
9 0.08
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.14
23 0.14
24 0.13
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.08
31 0.1
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.21
37 0.28
38 0.37
39 0.45
40 0.53
41 0.63
42 0.73
43 0.82
44 0.88
45 0.92
46 0.93
47 0.94
48 0.95
49 0.94
50 0.94
51 0.92
52 0.82
53 0.73
54 0.62
55 0.51
56 0.39
57 0.29
58 0.18
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.17
63 0.18
64 0.21
65 0.31
66 0.42
67 0.5
68 0.59
69 0.67
70 0.73
71 0.82
72 0.87
73 0.85
74 0.81
75 0.8
76 0.79
77 0.78
78 0.73
79 0.67
80 0.62
81 0.57
82 0.51
83 0.42
84 0.34
85 0.24
86 0.19
87 0.14
88 0.12
89 0.1
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.16
96 0.18
97 0.2
98 0.18
99 0.18
100 0.17
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.18
108 0.25
109 0.36
110 0.47
111 0.56
112 0.68
113 0.78
114 0.86
115 0.92
116 0.95
117 0.93
118 0.93
119 0.9
120 0.86
121 0.82
122 0.74
123 0.67
124 0.55
125 0.46
126 0.35
127 0.26
128 0.19
129 0.12
130 0.09
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.14
154 0.18
155 0.25
156 0.31
157 0.35
158 0.37
159 0.39
160 0.4
161 0.39
162 0.36
163 0.27
164 0.2
165 0.21
166 0.19
167 0.2
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.19
173 0.13
174 0.14
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.07
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.13
193 0.19
194 0.22
195 0.27
196 0.26
197 0.27
198 0.27
199 0.27
200 0.25
201 0.24
202 0.26
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.21
207 0.19
208 0.19
209 0.14
210 0.11
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.16
234 0.19
235 0.22
236 0.27
237 0.29
238 0.3
239 0.33
240 0.39
241 0.49
242 0.53
243 0.58
244 0.62
245 0.65
246 0.65
247 0.63
248 0.56
249 0.47
250 0.38
251 0.29
252 0.24
253 0.21
254 0.19
255 0.2
256 0.2
257 0.21
258 0.21
259 0.24
260 0.21
261 0.22
262 0.28
263 0.31
264 0.39
265 0.4
266 0.44
267 0.45
268 0.5
269 0.51
270 0.47
271 0.43
272 0.34
273 0.31
274 0.35
275 0.34
276 0.31
277 0.3
278 0.34
279 0.41
280 0.44
281 0.45
282 0.41
283 0.4
284 0.36
285 0.35
286 0.32
287 0.28
288 0.25
289 0.28
290 0.25
291 0.24
292 0.24
293 0.26
294 0.3
295 0.36
296 0.44
297 0.47
298 0.57
299 0.6
300 0.67
301 0.7
302 0.72
303 0.7
304 0.67
305 0.67
306 0.6
307 0.6
308 0.53
309 0.48
310 0.39
311 0.33
312 0.28
313 0.23
314 0.21
315 0.19
316 0.19
317 0.19
318 0.19
319 0.18
320 0.19
321 0.18
322 0.21
323 0.19
324 0.19
325 0.2
326 0.23
327 0.23
328 0.21
329 0.19
330 0.15
331 0.21
332 0.2
333 0.25
334 0.28
335 0.35
336 0.42
337 0.44
338 0.5
339 0.5
340 0.59
341 0.64
342 0.69
343 0.72
344 0.75
345 0.82
346 0.85
347 0.83
348 0.82
349 0.78
350 0.77