FuNGI

A0A166JV41

Protein Details

Accession

A0A166JV41

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-37	APAILTSDAKKKKKSRSEKRAAAAKAN	Hydrophilic
75-94	SFVQGKLRKKMNKENVHSRA	Hydrophilic
353-372	AGVQKKREARDKGKEKEKVQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-41	KKKKKSRSEKRAAAAKANPHER
225-232	KKDDKKKG
249-306	GKDAPATLGKRAAKKAAAAQKAAAAAEKEKGKEKAAPAASGSGAPAKSAPPTPKKKGA
357-370	KKREARDKGKEKEK
448-465	GGRGGARGGGRGRGRGGP

Subcellular Location(s)

cyto 12, nucl 9, cyto_mito 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSATDPPAAPAPAILTSDAKKKKKSRSEKRAAAAKANPHERTKTVVRRLPPNLPEEIFWASVQKWVSDETVVWKSFVQGKLRKKMNKENVHSRAYIAFKTEDLVASFSREYDGHVFRDKAGNEAQAVVEFAPFQKIPVPTEKVKKDHRIGTIEEDEEYQAFLKTLEESTAKTMDTETLLETLIASTISAPQPTSTPLLEALKAEKSAQKDKEAILRNHAHYKEIKKDDKKKGAAAASTSTAAPSAAAPGKDAPATLGKRAAKKAAAAQKAAAAAEKEKGKEKAAPAASGSGAPAKSAPPTPKKKGAAAAATPATADTTAPVETSTAASEPSARRQRPVIAPSSRALEAALSGAGVQKKREARDKGKEKEKVQDGDASDAKGKTRPPTSGKVPVSIAVPSATGGGGVLPAPAILQRDQVPKVLARPTEPAATVPAAEGGAATLVRGGSGGRGGARGGGRGRGRGGPPAQGD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.19
4	0.29
5	0.38
6	0.42
7	0.5
8	0.58
9	0.67
10	0.74
11	0.83
12	0.84
13	0.86
14	0.91
15	0.91
16	0.91
17	0.9
18	0.83
19	0.8
20	0.75
21	0.72
22	0.7
23	0.69
24	0.65
25	0.61
26	0.61
27	0.54
28	0.54
29	0.56
30	0.56
31	0.57
32	0.59
33	0.6
34	0.65
35	0.7
36	0.72
37	0.67
38	0.61
39	0.56
40	0.51
41	0.46
42	0.41
43	0.38
44	0.3
45	0.25
46	0.24
47	0.18
48	0.21
49	0.21
50	0.17
51	0.15
52	0.15
53	0.17
54	0.15
55	0.16
56	0.18
57	0.24
58	0.24
59	0.24
60	0.22
61	0.23
62	0.29
63	0.33
64	0.36
65	0.37
66	0.46
67	0.55
68	0.64
69	0.68
70	0.69
71	0.75
72	0.77
73	0.8
74	0.79
75	0.81
76	0.79
77	0.77
78	0.69
79	0.6
80	0.55
81	0.47
82	0.39
83	0.31
84	0.25
85	0.2
86	0.21
87	0.2
88	0.16
89	0.14
90	0.15
91	0.12
92	0.14
93	0.14
94	0.13
95	0.13
96	0.12
97	0.14
98	0.18
99	0.21
100	0.21
101	0.26
102	0.26
103	0.26
104	0.32
105	0.29
106	0.26
107	0.26
108	0.25
109	0.2
110	0.21
111	0.19
112	0.14
113	0.14
114	0.11
115	0.09
116	0.07
117	0.07
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.13
122	0.15
123	0.17
124	0.24
125	0.29
126	0.31
127	0.4
128	0.46
129	0.48
130	0.55
131	0.61
132	0.6
133	0.61
134	0.61
135	0.57
136	0.53
137	0.53
138	0.49
139	0.4
140	0.34
141	0.28
142	0.23
143	0.19
144	0.17
145	0.11
146	0.07
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.07
151	0.07
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.12
156	0.13
157	0.13
158	0.12
159	0.12
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.07
168	0.06
169	0.05
170	0.05
171	0.04
172	0.03
173	0.06
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.1
180	0.12
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.13
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.12
189	0.12
190	0.13
191	0.13
192	0.16
193	0.23
194	0.25
195	0.26
196	0.26
197	0.27
198	0.34
199	0.39
200	0.36
201	0.35
202	0.38
203	0.37
204	0.43
205	0.41
206	0.36
207	0.33
208	0.37
209	0.39
210	0.42
211	0.48
212	0.49
213	0.59
214	0.67
215	0.71
216	0.69
217	0.62
218	0.59
219	0.54
220	0.46
221	0.37
222	0.29
223	0.22
224	0.2
225	0.17
226	0.12
227	0.09
228	0.08
229	0.07
230	0.05
231	0.06
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.08
240	0.13
241	0.14
242	0.14
243	0.19
244	0.22
245	0.25
246	0.27
247	0.28
248	0.23
249	0.24
250	0.3
251	0.32
252	0.32
253	0.29
254	0.28
255	0.27
256	0.27
257	0.25
258	0.19
259	0.12
260	0.1
261	0.13
262	0.14
263	0.14
264	0.17
265	0.19
266	0.2
267	0.24
268	0.24
269	0.28
270	0.28
271	0.27
272	0.24
273	0.24
274	0.22
275	0.18
276	0.17
277	0.12
278	0.1
279	0.1
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.14
284	0.2
285	0.27
286	0.36
287	0.42
288	0.5
289	0.52
290	0.53
291	0.55
292	0.53
293	0.49
294	0.42
295	0.41
296	0.33
297	0.3
298	0.27
299	0.21
300	0.16
301	0.11
302	0.09
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.11
316	0.13
317	0.22
318	0.3
319	0.3
320	0.32
321	0.35
322	0.41
323	0.44
324	0.48
325	0.47
326	0.42
327	0.44
328	0.43
329	0.44
330	0.38
331	0.3
332	0.26
333	0.17
334	0.13
335	0.11
336	0.09
337	0.05
338	0.05
339	0.08
340	0.11
341	0.12
342	0.13
343	0.18
344	0.23
345	0.28
346	0.37
347	0.43
348	0.5
349	0.6
350	0.69
351	0.73
352	0.78
353	0.81
354	0.75
355	0.76
356	0.74
357	0.66
358	0.58
359	0.55
360	0.46
361	0.44
362	0.43
363	0.35
364	0.31
365	0.28
366	0.27
367	0.24
368	0.26
369	0.27
370	0.3
371	0.35
372	0.37
373	0.44
374	0.5
375	0.57
376	0.56
377	0.53
378	0.5
379	0.44
380	0.4
381	0.33
382	0.26
383	0.17
384	0.15
385	0.11
386	0.1
387	0.08
388	0.07
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.06
398	0.08
399	0.09
400	0.12
401	0.17
402	0.23
403	0.25
404	0.28
405	0.29
406	0.29
407	0.33
408	0.36
409	0.33
410	0.3
411	0.33
412	0.34
413	0.35
414	0.33
415	0.29
416	0.26
417	0.25
418	0.23
419	0.18
420	0.16
421	0.12
422	0.11
423	0.1
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.08
435	0.09
436	0.09
437	0.1
438	0.1
439	0.15
440	0.16
441	0.19
442	0.2
443	0.27
444	0.28
445	0.31
446	0.34
447	0.36
448	0.38
449	0.42
450	0.42

A0A166JV41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer