Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165YHE1

Protein Details
Accession A0A165YHE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-61VPTGPNQQQGQPPRKKRRNNKQNRGNNNAQNNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-48PRKKRRNN
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 6
Family & Domain DBs
CDD cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MERALVSYDDIQPGPVPSLPQPPVAGPSVPTGPNQQQGQPPRKKRRNNKQNRGNNNAQNNNAHVQNSNANVNGFNAGYAGNGWGNRQPQMHAQAHWDDPMHAGYPQAAPPQLPAHPQSFPTQHQHLPPKPQTSLPAKPLPTQPRAMQVEQEYIGGEEEEGYAEEEYEGGEEEEGEEEMSRMLSREEVWDDSALIDAWEAATAEYEAMHGKSKDWKNEPVKKWYNVPPKPSPSKAAPTPKPEPTTENSQPFDYNTFVPSHDPSLAYDSGAVAGAKGAGGASRDEAFEQAVNATYWAGYWTAVYYSHNRADTTAAVKRKAEEEEVEGEYVGEEAEEDDEAVIASPIDEDIIPTQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.27
6 0.28
7 0.29
8 0.29
9 0.28
10 0.3
11 0.3
12 0.28
13 0.2
14 0.22
15 0.24
16 0.24
17 0.24
18 0.27
19 0.29
20 0.35
21 0.36
22 0.37
23 0.4
24 0.49
25 0.58
26 0.62
27 0.69
28 0.73
29 0.81
30 0.87
31 0.9
32 0.92
33 0.93
34 0.94
35 0.94
36 0.94
37 0.95
38 0.93
39 0.91
40 0.89
41 0.86
42 0.84
43 0.79
44 0.72
45 0.64
46 0.58
47 0.52
48 0.44
49 0.37
50 0.28
51 0.24
52 0.25
53 0.25
54 0.23
55 0.21
56 0.2
57 0.19
58 0.2
59 0.18
60 0.14
61 0.11
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.13
71 0.15
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.23
76 0.31
77 0.32
78 0.3
79 0.32
80 0.33
81 0.33
82 0.33
83 0.27
84 0.2
85 0.18
86 0.18
87 0.15
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.21
104 0.24
105 0.25
106 0.27
107 0.31
108 0.32
109 0.32
110 0.38
111 0.46
112 0.45
113 0.51
114 0.53
115 0.52
116 0.49
117 0.48
118 0.47
119 0.45
120 0.47
121 0.43
122 0.44
123 0.4
124 0.42
125 0.49
126 0.49
127 0.45
128 0.43
129 0.38
130 0.4
131 0.43
132 0.4
133 0.36
134 0.3
135 0.29
136 0.26
137 0.25
138 0.17
139 0.12
140 0.12
141 0.09
142 0.07
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.07
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.18
198 0.22
199 0.29
200 0.33
201 0.41
202 0.49
203 0.59
204 0.62
205 0.64
206 0.67
207 0.62
208 0.64
209 0.64
210 0.65
211 0.6
212 0.63
213 0.61
214 0.62
215 0.66
216 0.63
217 0.58
218 0.51
219 0.53
220 0.54
221 0.56
222 0.54
223 0.55
224 0.58
225 0.6
226 0.58
227 0.53
228 0.49
229 0.44
230 0.47
231 0.46
232 0.47
233 0.42
234 0.4
235 0.39
236 0.36
237 0.34
238 0.27
239 0.21
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.16
249 0.2
250 0.19
251 0.17
252 0.15
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.12
289 0.15
290 0.21
291 0.26
292 0.28
293 0.27
294 0.27
295 0.29
296 0.29
297 0.31
298 0.32
299 0.32
300 0.33
301 0.34
302 0.35
303 0.36
304 0.37
305 0.34
306 0.3
307 0.29
308 0.31
309 0.32
310 0.3
311 0.26
312 0.23
313 0.19
314 0.16
315 0.11
316 0.06
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07