FuNGI

A0A165WJZ5

Protein Details

Accession

A0A165WJZ5

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
64-92	EKTGETFKRSKHKRLRRGRKSDPPPAASS	Basic
146-174	EAEREQLREKRRQEKRRRQVMRSRPERSW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
71-95	KRSKHKRLRRGRKSDPPPAASSSKR
153-168	REKRRQEKRRRQVMRS

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 9.5, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028083 Spt6_acidic_N_dom IPR017072 TF_Spt6
Gene Ontology	GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14632 SPT6_acidic

Amino Acid Sequences

MDNSGCAARSNKSAKTLRFVADLPRRVLQCGLSYLASLLADRHRRLDEEVEEELDEDDLDLMEEKTGETFKRSKHKRLRRGRKSDPPPAASSSKRRNAILFDVYVNAEDVELPSRGGIRDIWTEDEDEDDFIHYDEEKKGVGGMDEAEREQLREKRRQEKRRRQVMRSRPERSWIVPTCSVTDMTMTGLEGEKDGEYYEATASKEMICQDVFESSEVRACHLTEDDDIVRAHNISKRTRLATSALSEDALLSVQHPMTEETLDGTVTRVIMRLSKRKEREFGKEHISSMLLYSNIYYLPQLGWYDESTSMIKLPTTNEPCHLLILFRTIGDDQNRFELLYANIRPLLAELLENFSAQLMVSGFARDLVVELCLKTSSIEIRKLELFIDNLIPECLDPTLNTVYLIEFGGRNRRLLDLESEMDFRHYALPVIGIWILLDAPRTDARWLDKRDIEIARTPFYVLEYMTGEVLICCRMVLKVSVMLRPMREDTGEHIDQVFPRIVEPLSNTIVQTEAQIQFSAECPFARPINNSRVVPVDATVLLVRKIHLSRLVRTCRSVLQIHLAPALACEIATRTHHTVDDCLTSSNAALLSPALQISKDLEMNWLLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.55
3	0.58
4	0.52
5	0.5
6	0.48
7	0.49
8	0.51
9	0.53
10	0.49
11	0.49
12	0.47
13	0.45
14	0.46
15	0.38
16	0.32
17	0.29
18	0.28
19	0.23
20	0.22
21	0.21
22	0.2
23	0.17
24	0.13
25	0.13
26	0.18
27	0.25
28	0.26
29	0.3
30	0.31
31	0.33
32	0.36
33	0.41
34	0.37
35	0.35
36	0.36
37	0.33
38	0.31
39	0.29
40	0.26
41	0.19
42	0.14
43	0.09
44	0.07
45	0.05
46	0.06
47	0.06
48	0.06
49	0.06
50	0.07
51	0.07
52	0.08
53	0.1
54	0.11
55	0.15
56	0.2
57	0.27
58	0.37
59	0.45
60	0.54
61	0.63
62	0.74
63	0.79
64	0.86
65	0.91
66	0.91
67	0.94
68	0.94
69	0.93
70	0.92
71	0.91
72	0.89
73	0.83
74	0.75
75	0.7
76	0.66
77	0.61
78	0.62
79	0.61
80	0.6
81	0.59
82	0.57
83	0.54
84	0.52
85	0.53
86	0.48
87	0.4
88	0.33
89	0.3
90	0.29
91	0.26
92	0.22
93	0.15
94	0.1
95	0.09
96	0.08
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.1
102	0.1
103	0.11
104	0.11
105	0.12
106	0.16
107	0.18
108	0.21
109	0.21
110	0.22
111	0.21
112	0.22
113	0.19
114	0.15
115	0.13
116	0.11
117	0.1
118	0.09
119	0.1
120	0.08
121	0.1
122	0.11
123	0.12
124	0.11
125	0.1
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.09
130	0.1
131	0.11
132	0.12
133	0.12
134	0.14
135	0.13
136	0.14
137	0.19
138	0.23
139	0.27
140	0.35
141	0.42
142	0.5
143	0.61
144	0.71
145	0.77
146	0.83
147	0.88
148	0.9
149	0.91
150	0.9
151	0.9
152	0.89
153	0.89
154	0.87
155	0.82
156	0.73
157	0.7
158	0.64
159	0.57
160	0.55
161	0.49
162	0.45
163	0.43
164	0.42
165	0.39
166	0.36
167	0.33
168	0.24
169	0.2
170	0.14
171	0.11
172	0.1
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.07
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.05
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.11
192	0.11
193	0.12
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.08
202	0.12
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.12
208	0.12
209	0.13
210	0.1
211	0.13
212	0.12
213	0.13
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.11
218	0.12
219	0.13
220	0.17
221	0.18
222	0.24
223	0.27
224	0.29
225	0.3
226	0.3
227	0.29
228	0.28
229	0.27
230	0.23
231	0.2
232	0.17
233	0.16
234	0.14
235	0.12
236	0.08
237	0.06
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.1
258	0.14
259	0.22
260	0.27
261	0.36
262	0.41
263	0.45
264	0.51
265	0.52
266	0.57
267	0.54
268	0.52
269	0.51
270	0.46
271	0.43
272	0.37
273	0.33
274	0.24
275	0.19
276	0.16
277	0.09
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.09
292	0.08
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.07
300	0.09
301	0.16
302	0.2
303	0.2
304	0.21
305	0.24
306	0.25
307	0.24
308	0.22
309	0.15
310	0.11
311	0.13
312	0.12
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.11
317	0.14
318	0.15
319	0.13
320	0.15
321	0.15
322	0.14
323	0.14
324	0.13
325	0.11
326	0.16
327	0.16
328	0.14
329	0.15
330	0.14
331	0.14
332	0.12
333	0.12
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.08
338	0.09
339	0.09
340	0.08
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.04
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.12
364	0.15
365	0.21
366	0.21
367	0.23
368	0.24
369	0.24
370	0.24
371	0.2
372	0.16
373	0.12
374	0.13
375	0.11
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.08
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.08
393	0.07
394	0.08
395	0.17
396	0.18
397	0.19
398	0.19
399	0.2
400	0.21
401	0.21
402	0.23
403	0.19
404	0.2
405	0.2
406	0.2
407	0.19
408	0.19
409	0.17
410	0.14
411	0.12
412	0.1
413	0.09
414	0.08
415	0.09
416	0.08
417	0.09
418	0.09
419	0.07
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.06
425	0.05
426	0.08
427	0.09
428	0.1
429	0.11
430	0.14
431	0.19
432	0.27
433	0.31
434	0.35
435	0.36
436	0.37
437	0.43
438	0.42
439	0.39
440	0.38
441	0.36
442	0.32
443	0.3
444	0.29
445	0.22
446	0.22
447	0.2
448	0.13
449	0.12
450	0.11
451	0.11
452	0.11
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.09
464	0.1
465	0.15
466	0.17
467	0.2
468	0.22
469	0.24
470	0.24
471	0.26
472	0.27
473	0.22
474	0.21
475	0.2
476	0.22
477	0.28
478	0.28
479	0.25
480	0.23
481	0.23
482	0.23
483	0.25
484	0.21
485	0.13
486	0.13
487	0.14
488	0.14
489	0.13
490	0.16
491	0.17
492	0.18
493	0.19
494	0.19
495	0.17
496	0.18
497	0.17
498	0.15
499	0.16
500	0.16
501	0.16
502	0.16
503	0.16
504	0.16
505	0.17
506	0.18
507	0.13
508	0.12
509	0.14
510	0.17
511	0.19
512	0.22
513	0.26
514	0.3
515	0.38
516	0.45
517	0.42
518	0.41
519	0.42
520	0.4
521	0.36
522	0.3
523	0.23
524	0.16
525	0.17
526	0.17
527	0.14
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.17
532	0.18
533	0.2
534	0.27
535	0.3
536	0.37
537	0.47
538	0.55
539	0.53
540	0.55
541	0.55
542	0.51
543	0.52
544	0.47
545	0.4
546	0.39
547	0.39
548	0.37
549	0.36
550	0.32
551	0.26
552	0.24
553	0.22
554	0.14
555	0.1
556	0.08
557	0.08
558	0.11
559	0.14
560	0.2
561	0.21
562	0.24
563	0.27
564	0.28
565	0.3
566	0.3
567	0.32
568	0.27
569	0.26
570	0.24
571	0.22
572	0.2
573	0.19
574	0.15
575	0.1
576	0.09
577	0.08
578	0.09
579	0.1
580	0.11
581	0.09
582	0.09
583	0.11
584	0.13
585	0.17
586	0.17
587	0.16
588	0.19

A0A165WJZ5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer