Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JVM9

Protein Details
Accession J5JVM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-108ASSKKTTTAAKKKPAAKKKPAAKKKKPAAKKKPATKKKPAAAKKKKALTPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-131KKTTTAAKKKPAAKKKPAAKKKKPAAKKKPATKKKPAAAKKKKALTPEQKEKKQLAQLRKMALPKGPKGK
208-220RRRLARKLEKRRP
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 12, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MLSLVNRAVAGRALSAAATSTSSKIIVPIFAAAAPRVRRFAPIARSFTVSARVRFPAAASSKKTTTAAKKKPAAKKKPAAKKKKPAAKKKPATKKKPAAAKKKKALTPEQKEKKQLAQLRKMALPKGPKGKPTNAWTVFLADNVKAGSGVPLTDKVKDISAQFKNLPEHEKTRLTERAHENLAANKAALKQWVESYPAGVIYMANLARRRLARKLEKRRPALLPDERQAKSAPSAYSLFIKSNHDQVTADTPTDAFRQLALQWKSLPESEKQRYKDAASADVQKNRDAIADLRAKGKAYWTDKGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.12
20 0.18
21 0.21
22 0.22
23 0.24
24 0.23
25 0.25
26 0.29
27 0.35
28 0.39
29 0.44
30 0.47
31 0.46
32 0.49
33 0.48
34 0.45
35 0.46
36 0.4
37 0.35
38 0.33
39 0.32
40 0.3
41 0.29
42 0.28
43 0.27
44 0.28
45 0.32
46 0.33
47 0.36
48 0.36
49 0.38
50 0.4
51 0.39
52 0.44
53 0.48
54 0.53
55 0.57
56 0.64
57 0.7
58 0.78
59 0.83
60 0.82
61 0.82
62 0.82
63 0.83
64 0.86
65 0.88
66 0.89
67 0.89
68 0.9
69 0.89
70 0.9
71 0.9
72 0.9
73 0.91
74 0.91
75 0.9
76 0.9
77 0.91
78 0.92
79 0.91
80 0.91
81 0.89
82 0.85
83 0.85
84 0.84
85 0.84
86 0.85
87 0.85
88 0.83
89 0.82
90 0.78
91 0.74
92 0.74
93 0.74
94 0.73
95 0.74
96 0.75
97 0.72
98 0.74
99 0.7
100 0.65
101 0.62
102 0.59
103 0.57
104 0.56
105 0.55
106 0.53
107 0.54
108 0.51
109 0.45
110 0.42
111 0.38
112 0.35
113 0.39
114 0.38
115 0.41
116 0.44
117 0.47
118 0.5
119 0.49
120 0.54
121 0.46
122 0.46
123 0.39
124 0.37
125 0.32
126 0.26
127 0.23
128 0.12
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.18
147 0.19
148 0.21
149 0.22
150 0.25
151 0.26
152 0.26
153 0.29
154 0.23
155 0.25
156 0.27
157 0.3
158 0.27
159 0.31
160 0.36
161 0.34
162 0.39
163 0.4
164 0.4
165 0.37
166 0.38
167 0.33
168 0.3
169 0.3
170 0.22
171 0.18
172 0.15
173 0.15
174 0.14
175 0.15
176 0.12
177 0.11
178 0.13
179 0.15
180 0.17
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.1
187 0.08
188 0.05
189 0.08
190 0.08
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.16
195 0.19
196 0.23
197 0.26
198 0.35
199 0.43
200 0.53
201 0.64
202 0.7
203 0.77
204 0.79
205 0.79
206 0.74
207 0.68
208 0.67
209 0.64
210 0.6
211 0.57
212 0.6
213 0.55
214 0.51
215 0.47
216 0.39
217 0.33
218 0.32
219 0.26
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.25
224 0.25
225 0.23
226 0.21
227 0.26
228 0.24
229 0.3
230 0.3
231 0.28
232 0.27
233 0.27
234 0.31
235 0.27
236 0.26
237 0.19
238 0.17
239 0.18
240 0.19
241 0.18
242 0.12
243 0.1
244 0.12
245 0.14
246 0.23
247 0.24
248 0.25
249 0.25
250 0.27
251 0.29
252 0.3
253 0.31
254 0.27
255 0.35
256 0.42
257 0.49
258 0.51
259 0.54
260 0.55
261 0.56
262 0.54
263 0.47
264 0.43
265 0.4
266 0.46
267 0.46
268 0.49
269 0.47
270 0.44
271 0.42
272 0.37
273 0.33
274 0.27
275 0.22
276 0.24
277 0.3
278 0.3
279 0.33
280 0.34
281 0.34
282 0.32
283 0.36
284 0.37
285 0.36