Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165YFC1

Protein Details
Accession A0A165YFC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48QTSSSKYKAKRTQDHYYWWAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-132RAAAKSSGKKTVKSKKTVQPAGKAKPASKGKPSSTKSAGSKRKK
150-154KKRSK
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 10, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR029319  DNA_ligase_OB  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF14743  DNA_ligase_OB_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
CDD cd07896  Adenylation_kDNA_ligase_like  
cd08041  OBF_kDNA_ligase_like  
Amino Acid Sequences MPADVLAEINGIKPKVVLIDGEDVEVASQTSSSKYKAKRTQDHYYWWAWRNQAGAPTDARTCKHLKELLGEEYEEERIKRADPEGYASRAAAKSSGKKTVKSKKTVQPAGKAKPASKGKPSSTKSAGSKRKKDEDDDEDEDEEVQGGRSKKRSKKADEDEIDSDDNTKDEVMLANKWDIDSGIDPTGWWISEKLDGVRTYWNGRAMKSRLGNKFTPPKWLTDKLPTDFTLDGELFTGRGNFQDTVSIVKTMNSSKWKSVTFQIFDIPSSGDKVFEARVAEMKKLFGPGGQYACDEVVVLEHEQARDRQHVLDKLQEITEVGGEGLMLRKPGSLYEPRRSAALMKVKTFFDAEAEVIGYEKGHGKYAGSTGSLKCKMESGKTFNVGTGLSDKQRKNPPKIGSIIVYRFQELTRSGVPRFQGIAADKDRAKDAEIPPNRAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.16
4 0.14
5 0.14
6 0.21
7 0.21
8 0.21
9 0.2
10 0.18
11 0.17
12 0.16
13 0.13
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.1
18 0.12
19 0.16
20 0.23
21 0.3
22 0.4
23 0.49
24 0.59
25 0.66
26 0.72
27 0.79
28 0.78
29 0.8
30 0.75
31 0.73
32 0.7
33 0.64
34 0.61
35 0.52
36 0.48
37 0.41
38 0.39
39 0.38
40 0.32
41 0.31
42 0.28
43 0.28
44 0.31
45 0.32
46 0.3
47 0.29
48 0.31
49 0.31
50 0.36
51 0.37
52 0.35
53 0.38
54 0.42
55 0.42
56 0.41
57 0.38
58 0.32
59 0.3
60 0.3
61 0.24
62 0.2
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.2
69 0.2
70 0.27
71 0.29
72 0.31
73 0.3
74 0.28
75 0.3
76 0.26
77 0.26
78 0.22
79 0.23
80 0.28
81 0.32
82 0.42
83 0.4
84 0.45
85 0.54
86 0.62
87 0.66
88 0.65
89 0.7
90 0.69
91 0.77
92 0.8
93 0.76
94 0.75
95 0.75
96 0.74
97 0.71
98 0.66
99 0.57
100 0.57
101 0.59
102 0.54
103 0.54
104 0.55
105 0.55
106 0.62
107 0.64
108 0.62
109 0.58
110 0.6
111 0.58
112 0.61
113 0.65
114 0.65
115 0.71
116 0.71
117 0.76
118 0.73
119 0.71
120 0.69
121 0.66
122 0.64
123 0.59
124 0.53
125 0.45
126 0.41
127 0.36
128 0.27
129 0.2
130 0.12
131 0.08
132 0.1
133 0.11
134 0.15
135 0.22
136 0.31
137 0.38
138 0.48
139 0.57
140 0.61
141 0.69
142 0.74
143 0.78
144 0.73
145 0.71
146 0.63
147 0.57
148 0.49
149 0.38
150 0.31
151 0.2
152 0.17
153 0.11
154 0.09
155 0.06
156 0.06
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.19
188 0.24
189 0.22
190 0.23
191 0.28
192 0.27
193 0.32
194 0.34
195 0.4
196 0.38
197 0.42
198 0.43
199 0.42
200 0.49
201 0.44
202 0.48
203 0.41
204 0.41
205 0.42
206 0.44
207 0.41
208 0.4
209 0.44
210 0.37
211 0.38
212 0.35
213 0.32
214 0.28
215 0.26
216 0.2
217 0.15
218 0.13
219 0.11
220 0.1
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.05
225 0.05
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.12
232 0.13
233 0.13
234 0.11
235 0.11
236 0.13
237 0.13
238 0.17
239 0.2
240 0.22
241 0.23
242 0.27
243 0.27
244 0.28
245 0.32
246 0.35
247 0.3
248 0.29
249 0.3
250 0.26
251 0.26
252 0.24
253 0.19
254 0.12
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.14
265 0.15
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.11
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.14
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.2
295 0.24
296 0.29
297 0.29
298 0.33
299 0.32
300 0.31
301 0.3
302 0.26
303 0.21
304 0.17
305 0.15
306 0.09
307 0.07
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.14
319 0.22
320 0.29
321 0.37
322 0.41
323 0.41
324 0.41
325 0.41
326 0.38
327 0.36
328 0.39
329 0.35
330 0.34
331 0.37
332 0.37
333 0.37
334 0.36
335 0.27
336 0.2
337 0.17
338 0.14
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.07
345 0.07
346 0.12
347 0.12
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.17
352 0.2
353 0.21
354 0.17
355 0.2
356 0.2
357 0.29
358 0.32
359 0.31
360 0.29
361 0.31
362 0.33
363 0.37
364 0.43
365 0.41
366 0.44
367 0.48
368 0.48
369 0.43
370 0.42
371 0.33
372 0.28
373 0.24
374 0.21
375 0.23
376 0.31
377 0.32
378 0.39
379 0.5
380 0.57
381 0.62
382 0.67
383 0.67
384 0.67
385 0.7
386 0.66
387 0.6
388 0.59
389 0.55
390 0.51
391 0.47
392 0.4
393 0.37
394 0.32
395 0.32
396 0.25
397 0.26
398 0.27
399 0.29
400 0.29
401 0.32
402 0.33
403 0.32
404 0.33
405 0.28
406 0.28
407 0.27
408 0.34
409 0.33
410 0.39
411 0.37
412 0.36
413 0.39
414 0.33
415 0.34
416 0.34
417 0.37
418 0.41
419 0.47