Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4KM78

Protein Details
Accession J4KM78    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-41LDDAPYVHQKKKKKRAGRKKRRAITGFEGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-34KKKKKRAGRKKRRA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 7.5, nucl 7, cyto 6, plas 6, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
Amino Acid Sequences MDSDHEHDGLELDDAPYVHQKKKKKRAGRKKRRAITGFEGAFPAVCSLGVIHLTRSRILCRCAHNSRGGSPRIQTCIHRFRTRRNLNSELSTYFNEYMFLGGIDTYTAFSPEQLEDGALIPRGCEPTTHDDDDDAAANSRFYDGNARNWTVDFAAVAAGFLSVSVLPLAGVEAVPTERAIGVVENFLRYVLQHDVCPEHAANISEALRVCDRARDEWPRFWRLERLLPGRFTLAAAQTFGVHEEADWFLEGRNEEAGKAPTEVKPEVIFYASLVAAGVRVPKTESGRSALTVSRQFTCSLTLRSIEMPDDDVSGYFERLALGAGADTMTRLKLQPLGRAVFRPAELQDGWVRQVPFEALPADEDVVFLLERDILEAMTVGTLMTAHVCELSSGLRFIKTIETVQPSFYTFLPQHLIKDYKPPRANDRPPPSIHDRAAAAEETQVERPQDEESEAEELSKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.2
4 0.24
5 0.3
6 0.36
7 0.45
8 0.55
9 0.66
10 0.75
11 0.78
12 0.85
13 0.89
14 0.94
15 0.96
16 0.96
17 0.96
18 0.95
19 0.94
20 0.88
21 0.85
22 0.81
23 0.8
24 0.7
25 0.6
26 0.52
27 0.41
28 0.36
29 0.28
30 0.2
31 0.1
32 0.08
33 0.07
34 0.06
35 0.08
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.16
40 0.18
41 0.21
42 0.23
43 0.28
44 0.3
45 0.34
46 0.37
47 0.4
48 0.48
49 0.52
50 0.55
51 0.57
52 0.56
53 0.58
54 0.6
55 0.56
56 0.5
57 0.48
58 0.48
59 0.44
60 0.44
61 0.42
62 0.43
63 0.5
64 0.55
65 0.59
66 0.58
67 0.64
68 0.72
69 0.77
70 0.76
71 0.74
72 0.74
73 0.68
74 0.7
75 0.63
76 0.54
77 0.47
78 0.4
79 0.35
80 0.29
81 0.25
82 0.2
83 0.17
84 0.16
85 0.12
86 0.11
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.05
94 0.07
95 0.06
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.15
113 0.21
114 0.28
115 0.3
116 0.28
117 0.26
118 0.27
119 0.27
120 0.24
121 0.17
122 0.12
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.16
130 0.17
131 0.25
132 0.3
133 0.31
134 0.3
135 0.3
136 0.31
137 0.22
138 0.2
139 0.12
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.17
184 0.14
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.2
201 0.27
202 0.3
203 0.36
204 0.41
205 0.41
206 0.41
207 0.4
208 0.4
209 0.34
210 0.37
211 0.36
212 0.37
213 0.35
214 0.35
215 0.34
216 0.3
217 0.27
218 0.21
219 0.16
220 0.12
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.17
249 0.17
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.11
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.08
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.11
269 0.15
270 0.17
271 0.18
272 0.19
273 0.2
274 0.21
275 0.22
276 0.2
277 0.21
278 0.23
279 0.23
280 0.21
281 0.22
282 0.21
283 0.2
284 0.23
285 0.21
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.19
292 0.16
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.08
319 0.14
320 0.16
321 0.21
322 0.26
323 0.29
324 0.3
325 0.31
326 0.33
327 0.29
328 0.28
329 0.24
330 0.19
331 0.21
332 0.19
333 0.2
334 0.22
335 0.21
336 0.22
337 0.24
338 0.23
339 0.18
340 0.19
341 0.18
342 0.15
343 0.15
344 0.14
345 0.1
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.08
378 0.08
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.13
384 0.16
385 0.17
386 0.19
387 0.23
388 0.29
389 0.29
390 0.31
391 0.31
392 0.28
393 0.28
394 0.25
395 0.25
396 0.19
397 0.22
398 0.26
399 0.25
400 0.26
401 0.31
402 0.35
403 0.3
404 0.4
405 0.44
406 0.49
407 0.55
408 0.57
409 0.6
410 0.67
411 0.75
412 0.75
413 0.77
414 0.74
415 0.71
416 0.74
417 0.72
418 0.69
419 0.62
420 0.55
421 0.47
422 0.42
423 0.41
424 0.35
425 0.27
426 0.21
427 0.22
428 0.21
429 0.22
430 0.23
431 0.21
432 0.2
433 0.21
434 0.21
435 0.2
436 0.19
437 0.18
438 0.18
439 0.2
440 0.19