Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165XTH1

Protein Details
Accession A0A165XTH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-40LLVEEKRKELPPNKRRKLSRPSHRIPGEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-35KRKELPPNKRRKLSRPSHR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
Amino Acid Sequences MAIHDSSQEFRLLVEEKRKELPPNKRRKLSRPSHRIPGEAQRDGATPFMQEYMREAHTILNHISTLGRMLSNIRKPYLDVHARQPPLARQARVLDPSDEKAWTDVKYLSNEERDQIDMQARIVLSKCADRVKQMEALEKRRSEVVAQEANPLMRLLPARLKVDSSSAVSDFVAAHNAGVTWFLTRRLAETSQNLREMQEERVRRQTERTRTLGSGAGREAAYMSIGEPSSVSDPASPSGGWLGNASSLASSWITGTPSSVPSSLPPEAFDLSSDEDEDDVELSASQIQQFESENAAILRTVEDTLAAVQQAEARLLEIGELQVELVNQLTRQTELTDQLYDDAVASAEYVERGNVQLREARRRAADSRKWILLFLIGASLSLLFLHYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.36
4 0.42
5 0.46
6 0.51
7 0.58
8 0.63
9 0.64
10 0.71
11 0.77
12 0.81
13 0.86
14 0.86
15 0.88
16 0.88
17 0.88
18 0.88
19 0.85
20 0.86
21 0.81
22 0.74
23 0.69
24 0.68
25 0.66
26 0.57
27 0.51
28 0.42
29 0.4
30 0.37
31 0.33
32 0.23
33 0.15
34 0.14
35 0.15
36 0.14
37 0.12
38 0.14
39 0.17
40 0.18
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.2
45 0.23
46 0.21
47 0.18
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.14
57 0.21
58 0.28
59 0.32
60 0.32
61 0.31
62 0.32
63 0.36
64 0.41
65 0.41
66 0.37
67 0.41
68 0.48
69 0.48
70 0.48
71 0.47
72 0.41
73 0.43
74 0.47
75 0.4
76 0.35
77 0.38
78 0.42
79 0.43
80 0.42
81 0.35
82 0.31
83 0.33
84 0.31
85 0.27
86 0.22
87 0.2
88 0.2
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.22
94 0.25
95 0.27
96 0.29
97 0.29
98 0.28
99 0.27
100 0.26
101 0.23
102 0.22
103 0.22
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.11
112 0.13
113 0.15
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.23
118 0.25
119 0.29
120 0.28
121 0.34
122 0.36
123 0.42
124 0.44
125 0.42
126 0.4
127 0.36
128 0.35
129 0.28
130 0.25
131 0.25
132 0.24
133 0.24
134 0.25
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.2
139 0.13
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.13
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.2
150 0.19
151 0.16
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.09
173 0.12
174 0.14
175 0.15
176 0.21
177 0.26
178 0.27
179 0.29
180 0.28
181 0.25
182 0.25
183 0.24
184 0.23
185 0.23
186 0.24
187 0.24
188 0.32
189 0.34
190 0.32
191 0.38
192 0.42
193 0.45
194 0.49
195 0.5
196 0.45
197 0.43
198 0.44
199 0.41
200 0.33
201 0.25
202 0.19
203 0.17
204 0.14
205 0.13
206 0.12
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.12
249 0.17
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.08
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.11
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.06
295 0.06
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.13
320 0.15
321 0.18
322 0.21
323 0.2
324 0.19
325 0.2
326 0.19
327 0.17
328 0.15
329 0.11
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.09
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.22
344 0.28
345 0.38
346 0.39
347 0.43
348 0.42
349 0.47
350 0.52
351 0.57
352 0.61
353 0.6
354 0.64
355 0.66
356 0.62
357 0.57
358 0.5
359 0.42
360 0.34
361 0.24
362 0.2
363 0.13
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.08
368 0.07