Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177CDM6

Protein Details
Accession A0A177CDM6    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-134DDMAWLKGSKKRQKKIAKAEQMQKELEHydrophilic
278-307MDISEVKMKKPKKKKSKSSKRRRVEDDEDMBasic
351-374LAAQRRQALKKRKKMRPEDLARQLHydrophilic
620-641KGSGNTKTKKHLDKIEQEKRKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-94AKKKREDRLAAIKKEREKAARFAK
115-124GSKKRQKKIA
284-300KMKKPKKKKSKSSKRRR
356-366RQALKKRKKMR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MADLSIEEANKIRLSMGLAPLPVPGAAAPSGPVFKPAHAGDDSDEEPASTIESRQAAGFDNWKKLQEEEAAKKKREDRLAAIKKEREKAARFAKLEGKGLADAAEDEDDMAWLKGSKKRQKKIAKAEQMQKELEERERQAREALQYTEADLAGVRVGHEVDQFEDGEDQVLVLKDTAVDAEEDDELEAVSLKERERLQEKLDSKKRKRAYDPNDDGQKSILAQYDEEIDGKKRNAFTLDGQGRTVEQVQAEAAGATQPKRVAISLDILQEDAPINDYMDISEVKMKKPKKKKSKSSKRRRVEDDEDMIALPDEPAEEMEVDESETKFAPRKAKKNLFDESFVDDDDLQAQLAAQRRQALKKRKKMRPEDLARQLREDGTSAPQTPGEVVDSTELAEEDGALIIDETTEFVHNLGANAEDEAEEARRRQQRKSSQIPKGVGSPAVEVDDEGDVDMAQSYAEAAEAEDRERSASRAKSPDLTGTGLDDEKLVSGGIGATLALLKQRGLVANTEGPDKNSLWRSREKFLADKLRAEEEVERERREDRERQRNSARWATMSARDREENNRQANAKSEKEVARKLADIYNKEYKPTFQLTHTDEHGRQLNEKEAFKLLSHQFHGKGSGNTKTKKHLDKIEQEKRKIAENSLDTRAGGLSNAQDQQAKKNKFAGVRLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.2
3 0.23
4 0.24
5 0.24
6 0.24
7 0.23
8 0.23
9 0.19
10 0.14
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.14
18 0.14
19 0.19
20 0.17
21 0.18
22 0.24
23 0.23
24 0.26
25 0.25
26 0.26
27 0.23
28 0.27
29 0.27
30 0.23
31 0.22
32 0.17
33 0.17
34 0.15
35 0.15
36 0.11
37 0.1
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.19
45 0.27
46 0.28
47 0.35
48 0.36
49 0.39
50 0.39
51 0.37
52 0.39
53 0.38
54 0.43
55 0.45
56 0.53
57 0.58
58 0.6
59 0.65
60 0.67
61 0.67
62 0.66
63 0.63
64 0.61
65 0.64
66 0.72
67 0.74
68 0.76
69 0.74
70 0.73
71 0.73
72 0.71
73 0.68
74 0.62
75 0.63
76 0.64
77 0.66
78 0.61
79 0.59
80 0.61
81 0.56
82 0.55
83 0.47
84 0.39
85 0.3
86 0.29
87 0.24
88 0.17
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.08
100 0.12
101 0.17
102 0.28
103 0.38
104 0.47
105 0.55
106 0.65
107 0.74
108 0.81
109 0.86
110 0.88
111 0.88
112 0.87
113 0.89
114 0.87
115 0.81
116 0.71
117 0.61
118 0.53
119 0.46
120 0.43
121 0.39
122 0.35
123 0.38
124 0.39
125 0.39
126 0.38
127 0.38
128 0.36
129 0.35
130 0.33
131 0.27
132 0.25
133 0.26
134 0.24
135 0.2
136 0.16
137 0.11
138 0.1
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.06
177 0.07
178 0.08
179 0.13
180 0.14
181 0.19
182 0.22
183 0.25
184 0.27
185 0.34
186 0.39
187 0.45
188 0.53
189 0.59
190 0.62
191 0.69
192 0.72
193 0.72
194 0.77
195 0.77
196 0.76
197 0.77
198 0.78
199 0.77
200 0.78
201 0.7
202 0.61
203 0.51
204 0.42
205 0.31
206 0.26
207 0.2
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.14
217 0.15
218 0.18
219 0.16
220 0.17
221 0.19
222 0.2
223 0.21
224 0.28
225 0.31
226 0.29
227 0.29
228 0.28
229 0.26
230 0.24
231 0.23
232 0.14
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.12
258 0.09
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.11
269 0.12
270 0.14
271 0.21
272 0.27
273 0.35
274 0.45
275 0.55
276 0.61
277 0.71
278 0.8
279 0.86
280 0.91
281 0.93
282 0.95
283 0.95
284 0.93
285 0.91
286 0.88
287 0.85
288 0.8
289 0.76
290 0.68
291 0.58
292 0.49
293 0.4
294 0.32
295 0.23
296 0.16
297 0.08
298 0.05
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.12
315 0.21
316 0.27
317 0.35
318 0.45
319 0.54
320 0.59
321 0.63
322 0.66
323 0.59
324 0.55
325 0.49
326 0.42
327 0.33
328 0.27
329 0.21
330 0.15
331 0.13
332 0.1
333 0.09
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.06
338 0.1
339 0.11
340 0.12
341 0.16
342 0.19
343 0.25
344 0.34
345 0.42
346 0.48
347 0.57
348 0.67
349 0.7
350 0.78
351 0.81
352 0.82
353 0.82
354 0.8
355 0.8
356 0.8
357 0.8
358 0.71
359 0.62
360 0.54
361 0.44
362 0.36
363 0.27
364 0.18
365 0.14
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.02
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.15
412 0.21
413 0.24
414 0.29
415 0.38
416 0.46
417 0.55
418 0.66
419 0.69
420 0.7
421 0.76
422 0.73
423 0.65
424 0.58
425 0.5
426 0.41
427 0.31
428 0.24
429 0.17
430 0.15
431 0.14
432 0.1
433 0.1
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.08
453 0.08
454 0.1
455 0.1
456 0.12
457 0.16
458 0.19
459 0.25
460 0.29
461 0.31
462 0.33
463 0.34
464 0.37
465 0.33
466 0.31
467 0.25
468 0.21
469 0.21
470 0.17
471 0.16
472 0.12
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.06
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.08
491 0.1
492 0.11
493 0.13
494 0.16
495 0.19
496 0.2
497 0.23
498 0.22
499 0.22
500 0.23
501 0.22
502 0.25
503 0.29
504 0.33
505 0.33
506 0.42
507 0.45
508 0.47
509 0.52
510 0.5
511 0.48
512 0.52
513 0.58
514 0.51
515 0.51
516 0.49
517 0.47
518 0.43
519 0.4
520 0.35
521 0.3
522 0.37
523 0.36
524 0.35
525 0.33
526 0.35
527 0.38
528 0.41
529 0.45
530 0.46
531 0.53
532 0.57
533 0.65
534 0.72
535 0.74
536 0.75
537 0.74
538 0.66
539 0.57
540 0.55
541 0.51
542 0.49
543 0.49
544 0.45
545 0.41
546 0.42
547 0.43
548 0.47
549 0.52
550 0.52
551 0.51
552 0.52
553 0.5
554 0.49
555 0.54
556 0.53
557 0.47
558 0.41
559 0.43
560 0.44
561 0.48
562 0.52
563 0.48
564 0.44
565 0.42
566 0.41
567 0.4
568 0.4
569 0.37
570 0.4
571 0.45
572 0.43
573 0.44
574 0.42
575 0.39
576 0.39
577 0.41
578 0.37
579 0.31
580 0.38
581 0.39
582 0.43
583 0.45
584 0.45
585 0.39
586 0.42
587 0.45
588 0.39
589 0.39
590 0.38
591 0.42
592 0.41
593 0.42
594 0.38
595 0.35
596 0.35
597 0.32
598 0.37
599 0.34
600 0.35
601 0.37
602 0.4
603 0.39
604 0.39
605 0.44
606 0.4
607 0.4
608 0.39
609 0.44
610 0.47
611 0.51
612 0.54
613 0.57
614 0.62
615 0.66
616 0.68
617 0.69
618 0.71
619 0.75
620 0.83
621 0.84
622 0.85
623 0.8
624 0.79
625 0.7
626 0.69
627 0.62
628 0.55
629 0.54
630 0.51
631 0.53
632 0.51
633 0.51
634 0.42
635 0.39
636 0.35
637 0.26
638 0.19
639 0.16
640 0.13
641 0.17
642 0.19
643 0.2
644 0.24
645 0.25
646 0.35
647 0.43
648 0.44
649 0.43
650 0.48
651 0.52
652 0.53