Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177CCM1

Protein Details
Accession A0A177CCM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-56FSKEPPMQGFKPKNKLRRQSAHLAQKKSKEAAKRDERFRRKREEAKNPSLREERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-50KPKNKLRRQSAHLAQKKSKEAAKRDERFRRKREEAKNP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MVFSKEPPMQGFKPKNKLRRQSAHLAQKKSKEAAKRDERFRRKREEAKNPSLREERQRVNQPVTIEAKRKFDTDVVGDEEDALNWAIDVERLAKKRKLEQEAAERGDNVEGNGEEGLLEKLKKRDAEGNEVEDDEEEDEADSMLDSESECEDDSSDTEAVSSRTKRKSERAASPAMSTTTNATAATNLDISPDFLKQKFPAVFNPAETPKILVTTSINSTLHNEAEILASFFPNADYVRRSAHAHAHKYSVREIAKFASNREYTALAILMEAHHAKVPDGLDIVLLPEGPHFHFSISNWVEGKKLPGHGKDQGFHPELVLNGFRTPLGLLTAHLWRGLFPAQPELQGRTAVTLHNQRDYIFLRRHRYVFREKRATEKQVLDANGKPLKGVEDIRVGMQEIGPRATLKLRRIDRGIQFKSGQEWQWKAHAEKERTRFNM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.78
3 0.81
4 0.87
5 0.87
6 0.86
7 0.84
8 0.84
9 0.85
10 0.86
11 0.84
12 0.83
13 0.79
14 0.77
15 0.76
16 0.71
17 0.67
18 0.65
19 0.65
20 0.67
21 0.71
22 0.72
23 0.76
24 0.82
25 0.87
26 0.88
27 0.88
28 0.87
29 0.86
30 0.88
31 0.88
32 0.88
33 0.88
34 0.88
35 0.9
36 0.82
37 0.8
38 0.77
39 0.72
40 0.71
41 0.69
42 0.65
43 0.64
44 0.71
45 0.7
46 0.68
47 0.65
48 0.56
49 0.55
50 0.54
51 0.5
52 0.48
53 0.45
54 0.47
55 0.45
56 0.45
57 0.4
58 0.36
59 0.34
60 0.3
61 0.3
62 0.28
63 0.27
64 0.25
65 0.24
66 0.22
67 0.17
68 0.15
69 0.11
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.1
77 0.15
78 0.2
79 0.26
80 0.3
81 0.34
82 0.43
83 0.51
84 0.54
85 0.55
86 0.59
87 0.63
88 0.68
89 0.67
90 0.59
91 0.5
92 0.43
93 0.38
94 0.3
95 0.2
96 0.14
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.14
108 0.18
109 0.19
110 0.21
111 0.28
112 0.31
113 0.39
114 0.4
115 0.4
116 0.38
117 0.37
118 0.34
119 0.26
120 0.23
121 0.14
122 0.1
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.14
148 0.17
149 0.22
150 0.28
151 0.32
152 0.36
153 0.43
154 0.52
155 0.56
156 0.61
157 0.59
158 0.59
159 0.56
160 0.53
161 0.47
162 0.37
163 0.3
164 0.21
165 0.17
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.19
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.26
189 0.26
190 0.25
191 0.28
192 0.23
193 0.22
194 0.2
195 0.18
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.15
229 0.23
230 0.29
231 0.32
232 0.33
233 0.36
234 0.37
235 0.36
236 0.37
237 0.35
238 0.3
239 0.26
240 0.25
241 0.23
242 0.26
243 0.25
244 0.25
245 0.26
246 0.25
247 0.25
248 0.25
249 0.23
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.2
283 0.2
284 0.23
285 0.22
286 0.22
287 0.22
288 0.21
289 0.25
290 0.18
291 0.22
292 0.25
293 0.27
294 0.32
295 0.38
296 0.41
297 0.39
298 0.4
299 0.41
300 0.38
301 0.35
302 0.31
303 0.24
304 0.21
305 0.22
306 0.2
307 0.13
308 0.11
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.11
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.14
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.19
328 0.19
329 0.22
330 0.24
331 0.25
332 0.24
333 0.24
334 0.23
335 0.19
336 0.19
337 0.17
338 0.21
339 0.26
340 0.27
341 0.3
342 0.31
343 0.29
344 0.33
345 0.35
346 0.37
347 0.37
348 0.42
349 0.45
350 0.5
351 0.54
352 0.55
353 0.59
354 0.62
355 0.65
356 0.68
357 0.71
358 0.67
359 0.72
360 0.76
361 0.75
362 0.72
363 0.65
364 0.6
365 0.56
366 0.57
367 0.52
368 0.45
369 0.46
370 0.42
371 0.38
372 0.32
373 0.27
374 0.26
375 0.27
376 0.26
377 0.22
378 0.25
379 0.26
380 0.27
381 0.27
382 0.25
383 0.22
384 0.21
385 0.2
386 0.16
387 0.17
388 0.17
389 0.16
390 0.17
391 0.24
392 0.29
393 0.31
394 0.39
395 0.43
396 0.49
397 0.54
398 0.61
399 0.63
400 0.67
401 0.66
402 0.62
403 0.59
404 0.54
405 0.54
406 0.51
407 0.48
408 0.45
409 0.45
410 0.42
411 0.47
412 0.51
413 0.48
414 0.51
415 0.55
416 0.55
417 0.6
418 0.65