Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0W377

Protein Details
Accession G0W377    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
361-391DPATIKRQTRVEVKKKKQRRGKITNTHMAGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
372-382EVKKKKQRRGK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG ndi:NDAI_0A01070  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MSHTGPNNSNASQNNDPLLANLNAFKNKVKSAPVISRPRPTAAAAGTVVGGSTNNITSPLRKALHDKKRSIELREQEERERSSGASRTNTPGTEPEVLEIDSSSDNEGMNGNGKVKSEHTDSTGSPPPRKKVKKEEGDVIVDGETEKSDITRSVTGTPIIDLNGDSDDDEVKEVRPGSIAAHALQANQSNISKSHDSSKLLWATEYIQKKGKPVAMNELMDYLSLKPNDKVIELLKKLEKISFDPKKNAFKYVSTYDVHSEGELIKLLRSQVTFKGISCKELKDGWPQCDETINELEEESKILVLRTKKDRTPRYVWYNNGGDLHRIDEEFIKMWENVQLPQFSELPRKLQDLGLKPASVDPATIKRQTRVEVKKKKQRRGKITNTHMAGILKDFSHRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.33
4 0.28
5 0.3
6 0.23
7 0.2
8 0.21
9 0.24
10 0.25
11 0.27
12 0.3
13 0.3
14 0.32
15 0.35
16 0.35
17 0.36
18 0.41
19 0.49
20 0.55
21 0.61
22 0.64
23 0.68
24 0.66
25 0.64
26 0.58
27 0.5
28 0.45
29 0.36
30 0.34
31 0.26
32 0.24
33 0.2
34 0.18
35 0.15
36 0.1
37 0.09
38 0.06
39 0.07
40 0.06
41 0.07
42 0.09
43 0.1
44 0.12
45 0.16
46 0.24
47 0.24
48 0.26
49 0.35
50 0.44
51 0.54
52 0.61
53 0.61
54 0.59
55 0.67
56 0.7
57 0.67
58 0.66
59 0.63
60 0.62
61 0.66
62 0.64
63 0.59
64 0.6
65 0.56
66 0.49
67 0.42
68 0.35
69 0.3
70 0.31
71 0.31
72 0.29
73 0.3
74 0.33
75 0.35
76 0.34
77 0.31
78 0.29
79 0.29
80 0.28
81 0.25
82 0.21
83 0.2
84 0.19
85 0.18
86 0.15
87 0.13
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.19
104 0.2
105 0.2
106 0.21
107 0.23
108 0.23
109 0.28
110 0.34
111 0.33
112 0.36
113 0.4
114 0.44
115 0.52
116 0.59
117 0.61
118 0.65
119 0.72
120 0.75
121 0.75
122 0.76
123 0.7
124 0.65
125 0.57
126 0.47
127 0.36
128 0.26
129 0.21
130 0.13
131 0.08
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.08
138 0.1
139 0.11
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.12
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.09
177 0.1
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.18
182 0.2
183 0.22
184 0.23
185 0.28
186 0.27
187 0.26
188 0.25
189 0.2
190 0.19
191 0.23
192 0.24
193 0.2
194 0.22
195 0.23
196 0.25
197 0.28
198 0.29
199 0.26
200 0.25
201 0.31
202 0.32
203 0.32
204 0.3
205 0.28
206 0.23
207 0.2
208 0.19
209 0.12
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.15
218 0.15
219 0.22
220 0.22
221 0.26
222 0.25
223 0.27
224 0.27
225 0.27
226 0.25
227 0.22
228 0.31
229 0.36
230 0.38
231 0.42
232 0.47
233 0.55
234 0.55
235 0.56
236 0.47
237 0.41
238 0.42
239 0.39
240 0.38
241 0.29
242 0.3
243 0.26
244 0.25
245 0.24
246 0.18
247 0.15
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.19
260 0.2
261 0.19
262 0.28
263 0.26
264 0.3
265 0.3
266 0.29
267 0.27
268 0.29
269 0.31
270 0.33
271 0.38
272 0.37
273 0.38
274 0.38
275 0.36
276 0.37
277 0.35
278 0.28
279 0.26
280 0.22
281 0.19
282 0.18
283 0.18
284 0.13
285 0.13
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.12
291 0.15
292 0.22
293 0.3
294 0.36
295 0.41
296 0.51
297 0.59
298 0.63
299 0.66
300 0.69
301 0.7
302 0.71
303 0.69
304 0.67
305 0.61
306 0.56
307 0.53
308 0.44
309 0.36
310 0.29
311 0.28
312 0.22
313 0.19
314 0.17
315 0.16
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.15
322 0.19
323 0.18
324 0.19
325 0.21
326 0.22
327 0.21
328 0.24
329 0.26
330 0.23
331 0.3
332 0.3
333 0.31
334 0.32
335 0.34
336 0.33
337 0.35
338 0.4
339 0.38
340 0.43
341 0.42
342 0.39
343 0.37
344 0.37
345 0.37
346 0.29
347 0.24
348 0.2
349 0.24
350 0.3
351 0.36
352 0.37
353 0.39
354 0.43
355 0.48
356 0.54
357 0.58
358 0.63
359 0.68
360 0.76
361 0.81
362 0.87
363 0.92
364 0.92
365 0.92
366 0.92
367 0.92
368 0.92
369 0.92
370 0.92
371 0.91
372 0.84
373 0.74
374 0.66
375 0.56
376 0.46
377 0.38
378 0.3
379 0.21