Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177CRN1

Protein Details
Accession A0A177CRN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MEEARLARLGKRKRRASPDRPSKQVSKQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-24RLGKRKRRASPDRPSKQ
Subcellular Location(s) cyto 11.5cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
Amino Acid Sequences MEEARLARLGKRKRRASPDRPSKQVSKQAEAKTSSEIRYPKGAIKRTWAYKYPRTEDISIEEVLQAPTLNIAVLSSFQWDDRWIFHKADPMKTKQVWIIGANTDAIKQNIIQELAECNTPNVKLHFPPMRATTTMHSKLMLLFHETHLRIVVPTANLMQVEWGETGKDPKSVGSWQPAVLENTVFLIDLPRRVDGAVSEKLETTFGQSLMAFLEAQEVGQKVREGLRKFDFAETNRLAFVHSISGSHSTGPRRNDTGLPGLAAAIRRLNLNNVERLELDYASSSIGGLKEEFLEKLYLAASGLQPLSSKAPEDWADRFRVYFPTHDTVINSTGGVECGGVITLNSRSYNAPTFARRCLRTHISTRSGLLSHNKMLLARGRQKDGTPFGWVYVGSANVTESAWGSQSILKSGKESALKINNWECGVVVPVPTEKLQGLADGEVPPMNVFQGTVEVPFKVPGEKYEGKKPWFFMDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.87
3 0.88
4 0.9
5 0.91
6 0.89
7 0.88
8 0.85
9 0.82
10 0.8
11 0.79
12 0.75
13 0.72
14 0.71
15 0.7
16 0.71
17 0.67
18 0.59
19 0.56
20 0.54
21 0.48
22 0.45
23 0.42
24 0.38
25 0.4
26 0.41
27 0.41
28 0.45
29 0.51
30 0.47
31 0.53
32 0.58
33 0.6
34 0.65
35 0.65
36 0.64
37 0.66
38 0.72
39 0.69
40 0.67
41 0.65
42 0.6
43 0.54
44 0.51
45 0.46
46 0.37
47 0.32
48 0.25
49 0.21
50 0.19
51 0.16
52 0.11
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.16
69 0.19
70 0.2
71 0.22
72 0.24
73 0.31
74 0.34
75 0.42
76 0.44
77 0.47
78 0.52
79 0.51
80 0.52
81 0.47
82 0.46
83 0.4
84 0.35
85 0.32
86 0.25
87 0.24
88 0.23
89 0.2
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.12
94 0.11
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.14
99 0.13
100 0.15
101 0.16
102 0.17
103 0.14
104 0.12
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.18
111 0.25
112 0.31
113 0.3
114 0.34
115 0.35
116 0.36
117 0.34
118 0.34
119 0.31
120 0.34
121 0.36
122 0.32
123 0.29
124 0.26
125 0.26
126 0.26
127 0.23
128 0.17
129 0.16
130 0.17
131 0.23
132 0.23
133 0.22
134 0.2
135 0.19
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.14
158 0.17
159 0.19
160 0.22
161 0.22
162 0.21
163 0.23
164 0.25
165 0.24
166 0.21
167 0.18
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.11
192 0.1
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.12
210 0.17
211 0.17
212 0.22
213 0.25
214 0.26
215 0.28
216 0.3
217 0.29
218 0.25
219 0.32
220 0.28
221 0.25
222 0.23
223 0.22
224 0.19
225 0.15
226 0.14
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.14
235 0.15
236 0.2
237 0.22
238 0.24
239 0.24
240 0.25
241 0.26
242 0.26
243 0.26
244 0.22
245 0.19
246 0.17
247 0.15
248 0.14
249 0.12
250 0.1
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.1
256 0.15
257 0.16
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.21
263 0.2
264 0.15
265 0.13
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.11
294 0.1
295 0.11
296 0.09
297 0.13
298 0.16
299 0.19
300 0.22
301 0.22
302 0.25
303 0.25
304 0.25
305 0.23
306 0.25
307 0.23
308 0.22
309 0.24
310 0.25
311 0.26
312 0.26
313 0.26
314 0.23
315 0.24
316 0.21
317 0.16
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.07
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.03
328 0.05
329 0.07
330 0.09
331 0.09
332 0.11
333 0.12
334 0.15
335 0.19
336 0.2
337 0.22
338 0.27
339 0.3
340 0.36
341 0.42
342 0.42
343 0.42
344 0.47
345 0.5
346 0.5
347 0.55
348 0.56
349 0.54
350 0.52
351 0.51
352 0.46
353 0.4
354 0.37
355 0.35
356 0.31
357 0.28
358 0.28
359 0.27
360 0.25
361 0.27
362 0.3
363 0.32
364 0.37
365 0.39
366 0.42
367 0.43
368 0.45
369 0.49
370 0.48
371 0.41
372 0.38
373 0.34
374 0.3
375 0.29
376 0.27
377 0.21
378 0.17
379 0.16
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.11
392 0.12
393 0.17
394 0.19
395 0.19
396 0.2
397 0.22
398 0.26
399 0.27
400 0.28
401 0.32
402 0.37
403 0.38
404 0.43
405 0.45
406 0.44
407 0.41
408 0.39
409 0.3
410 0.23
411 0.24
412 0.18
413 0.15
414 0.13
415 0.13
416 0.15
417 0.15
418 0.17
419 0.14
420 0.15
421 0.14
422 0.15
423 0.15
424 0.14
425 0.16
426 0.15
427 0.16
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.11
432 0.11
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.1
437 0.1
438 0.13
439 0.14
440 0.15
441 0.15
442 0.17
443 0.18
444 0.18
445 0.19
446 0.18
447 0.26
448 0.33
449 0.37
450 0.46
451 0.53
452 0.55
453 0.59
454 0.59