Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J4KNG7

Protein Details
Accession J4KNG7    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-216ARERADKKESRHKHRSHRHHQSRYDNDDKRBasic
245-319EDYHRSKRRDEDSREHKSRRRDDREKEWNRDRDRGRRDRERDEGRRHKRHASREHEEERGHGRRRRSGSPRRNEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-205KKEVEEARERADKKESRHKHRSHRH
249-317RSKRRDEDSREHKSRRRDDREKEWNRDRDRGRRDRERDEGRRHKRHASREHEEERGHGRRRRSGSPRRN
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNQIRAIQALNKKEIENGISPEASWHTDYRDTAYVYFGGLPYELSEGDIITIFSQFGEPVFLKLVRDKETGKSKGFGWLKYENQRSTDLAVDNLGGAEVGGRLLRVDHARYSMRDDEDQDEFKVGWEDLQRKEGKPVSDDESSEDEAPQRPMLQEERDLAKLIHEHDDDDPMKAFLIEEKKKEVEEARERADKKESRHKHRSHRHHQSRYDNDDKRRSQRDDDDSERRHRHQSDHRSDRHRDAAEDYHRSKRRDEDSREHKSRRRDDREKEWNRDRDRGRRDRERDEGRRHKRHASREHEEERGHGRRRRSGSPRRNEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.34
4 0.32
5 0.31
6 0.28
7 0.28
8 0.27
9 0.26
10 0.25
11 0.23
12 0.2
13 0.2
14 0.24
15 0.25
16 0.27
17 0.29
18 0.28
19 0.26
20 0.27
21 0.23
22 0.2
23 0.21
24 0.16
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.06
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.19
51 0.24
52 0.24
53 0.27
54 0.28
55 0.33
56 0.42
57 0.46
58 0.44
59 0.41
60 0.37
61 0.44
62 0.45
63 0.39
64 0.35
65 0.37
66 0.41
67 0.48
68 0.55
69 0.48
70 0.47
71 0.47
72 0.43
73 0.38
74 0.35
75 0.27
76 0.2
77 0.18
78 0.16
79 0.13
80 0.11
81 0.09
82 0.05
83 0.04
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.07
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.15
96 0.18
97 0.19
98 0.24
99 0.26
100 0.26
101 0.26
102 0.27
103 0.26
104 0.27
105 0.28
106 0.23
107 0.19
108 0.17
109 0.16
110 0.15
111 0.11
112 0.1
113 0.13
114 0.17
115 0.17
116 0.24
117 0.26
118 0.25
119 0.3
120 0.31
121 0.28
122 0.26
123 0.27
124 0.26
125 0.25
126 0.25
127 0.23
128 0.23
129 0.23
130 0.21
131 0.19
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.13
136 0.1
137 0.09
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.14
142 0.15
143 0.17
144 0.17
145 0.18
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.19
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.17
164 0.19
165 0.2
166 0.23
167 0.24
168 0.24
169 0.26
170 0.25
171 0.26
172 0.31
173 0.33
174 0.35
175 0.4
176 0.41
177 0.41
178 0.47
179 0.42
180 0.4
181 0.47
182 0.52
183 0.56
184 0.65
185 0.71
186 0.74
187 0.8
188 0.86
189 0.86
190 0.88
191 0.89
192 0.88
193 0.89
194 0.88
195 0.86
196 0.84
197 0.83
198 0.78
199 0.75
200 0.75
201 0.72
202 0.7
203 0.69
204 0.65
205 0.61
206 0.63
207 0.63
208 0.62
209 0.63
210 0.64
211 0.61
212 0.66
213 0.65
214 0.59
215 0.59
216 0.54
217 0.56
218 0.56
219 0.63
220 0.65
221 0.69
222 0.74
223 0.74
224 0.77
225 0.74
226 0.72
227 0.62
228 0.53
229 0.48
230 0.48
231 0.48
232 0.51
233 0.48
234 0.5
235 0.55
236 0.55
237 0.54
238 0.54
239 0.56
240 0.58
241 0.63
242 0.64
243 0.67
244 0.76
245 0.82
246 0.81
247 0.77
248 0.78
249 0.79
250 0.8
251 0.8
252 0.8
253 0.8
254 0.83
255 0.89
256 0.88
257 0.88
258 0.87
259 0.86
260 0.81
261 0.82
262 0.79
263 0.78
264 0.79
265 0.79
266 0.79
267 0.8
268 0.82
269 0.81
270 0.83
271 0.84
272 0.83
273 0.84
274 0.85
275 0.85
276 0.88
277 0.85
278 0.85
279 0.83
280 0.83
281 0.83
282 0.81
283 0.79
284 0.79
285 0.8
286 0.76
287 0.69
288 0.62
289 0.61
290 0.6
291 0.6
292 0.55
293 0.57
294 0.59
295 0.65
296 0.71
297 0.72
298 0.74
299 0.76