Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177CYS4

Protein Details
Accession A0A177CYS4    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24AAGKKVAKTSRDKKQPASNKVATHydrophilic
366-385VDGPAKKKNHVENRFQRIKPHydrophilic
411-438LVVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-36KKVAKTSRDKKQPASNKVATGRVGKTKKAAAK
302-311KAKITKKAAK
417-429KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MAAGKKVAKTSRDKKQPASNKVATGRVGKTKKAAAKAPGPLLNLVQSFLNEHGYTEAASKLQAEAPAAASAASPKDLPALTTLYEQWEKNAKDASGAMDVDDNSAAGSDDSSSASESDSSDDSSDSEDEKKAPRKEAAAKDSDSDSDSDSGSDSDSDSDSDSDSSSSSSSSDSESEDEKAKPVKKSKRAASVASSSASSSSDSDSDSDSDAEPANIPLPESDSSDSSDSSDSSDSSDSSDSSDSSDSDSDSSSDSEAEVKTTQTKKAKKAASISSSSSSSSSSSSDSDSSSSDESDVAPEKKAKITKKAAKKDDSSSSSDSSSSDSDSSDSDKEEKSDSSATVGRASPVPAAGNKRKQSDSDSAAVDGPAKKKNHVENRFQRIKPDTAVDPRFASNDYVSYDYADRAHADLVVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGMIDTSGGKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.8
3 0.83
4 0.82
5 0.83
6 0.77
7 0.74
8 0.72
9 0.69
10 0.62
11 0.58
12 0.54
13 0.54
14 0.52
15 0.47
16 0.48
17 0.51
18 0.54
19 0.54
20 0.56
21 0.53
22 0.57
23 0.6
24 0.62
25 0.58
26 0.53
27 0.48
28 0.42
29 0.39
30 0.32
31 0.26
32 0.19
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.19
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.12
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.16
69 0.17
70 0.19
71 0.22
72 0.22
73 0.23
74 0.3
75 0.29
76 0.3
77 0.33
78 0.28
79 0.26
80 0.27
81 0.26
82 0.21
83 0.21
84 0.18
85 0.16
86 0.16
87 0.15
88 0.14
89 0.11
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.13
114 0.13
115 0.15
116 0.22
117 0.3
118 0.31
119 0.35
120 0.36
121 0.4
122 0.48
123 0.55
124 0.54
125 0.51
126 0.48
127 0.46
128 0.44
129 0.39
130 0.3
131 0.22
132 0.17
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.21
167 0.24
168 0.28
169 0.36
170 0.44
171 0.5
172 0.59
173 0.63
174 0.68
175 0.67
176 0.64
177 0.59
178 0.54
179 0.46
180 0.38
181 0.32
182 0.22
183 0.18
184 0.16
185 0.12
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.15
248 0.17
249 0.23
250 0.29
251 0.36
252 0.4
253 0.48
254 0.52
255 0.49
256 0.54
257 0.55
258 0.52
259 0.49
260 0.46
261 0.4
262 0.37
263 0.33
264 0.27
265 0.2
266 0.16
267 0.14
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.11
283 0.14
284 0.13
285 0.15
286 0.17
287 0.18
288 0.22
289 0.28
290 0.3
291 0.36
292 0.45
293 0.52
294 0.61
295 0.69
296 0.73
297 0.73
298 0.73
299 0.7
300 0.69
301 0.64
302 0.59
303 0.52
304 0.46
305 0.4
306 0.36
307 0.3
308 0.23
309 0.2
310 0.16
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.15
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.16
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.19
325 0.17
326 0.18
327 0.21
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.19
332 0.19
333 0.19
334 0.16
335 0.14
336 0.15
337 0.16
338 0.24
339 0.32
340 0.4
341 0.44
342 0.48
343 0.49
344 0.5
345 0.52
346 0.52
347 0.48
348 0.43
349 0.39
350 0.35
351 0.34
352 0.32
353 0.29
354 0.25
355 0.24
356 0.26
357 0.26
358 0.29
359 0.36
360 0.45
361 0.53
362 0.57
363 0.65
364 0.68
365 0.77
366 0.83
367 0.77
368 0.74
369 0.69
370 0.64
371 0.56
372 0.51
373 0.47
374 0.47
375 0.49
376 0.45
377 0.41
378 0.39
379 0.37
380 0.34
381 0.3
382 0.21
383 0.21
384 0.21
385 0.21
386 0.2
387 0.21
388 0.21
389 0.2
390 0.19
391 0.18
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.13
396 0.13
397 0.15
398 0.17
399 0.21
400 0.2
401 0.19
402 0.22
403 0.24
404 0.31
405 0.32
406 0.39
407 0.46
408 0.56
409 0.67
410 0.75
411 0.82
412 0.83
413 0.9
414 0.91
415 0.9
416 0.9
417 0.88
418 0.86
419 0.85
420 0.79
421 0.68
422 0.58
423 0.52
424 0.42
425 0.36
426 0.28
427 0.2
428 0.16