Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JW42

Protein Details
Accession J5JW42    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-315REERERLRQERERQREKEQNEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-309RKRKEEADRKEREEREAREQEERDRIMREERERLRQERERQR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MDKLIDERFERLEKALSGLIDSVTKYHPSMNLAEELMAADAELTKGLEQVQTHQNNHLRILELRQASTSLDTQIRDTLTSLSNTRRDIVNTHTTKFPSSPNYPIVYEELLSYARRISKTTMPPAATINASFPPSGLQSPTVGESQSQAVTPAATTPAAGATPATAATPATSTPLPTQSPAAINGVGGTHGVSLQHSSQHPHQGSSSGPSLLTSLPEPMAQYLNPLSGQVFFPWPQEDKIRSGSLASNQILVEKGIDPRGFDPVAEEERKRKEEADRKEREEREAREQEERDRIMREERERLRQERERQREKEQNEWRRASVIAGAADAPGGAAPKGPEKKQFQFTNLDDLDDDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.22
4 0.2
5 0.2
6 0.18
7 0.16
8 0.15
9 0.14
10 0.14
11 0.16
12 0.15
13 0.18
14 0.2
15 0.21
16 0.24
17 0.25
18 0.25
19 0.24
20 0.23
21 0.2
22 0.18
23 0.14
24 0.11
25 0.08
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.06
33 0.07
34 0.1
35 0.1
36 0.15
37 0.25
38 0.31
39 0.32
40 0.4
41 0.44
42 0.43
43 0.46
44 0.42
45 0.35
46 0.3
47 0.34
48 0.33
49 0.29
50 0.28
51 0.26
52 0.25
53 0.23
54 0.24
55 0.2
56 0.17
57 0.18
58 0.18
59 0.18
60 0.21
61 0.2
62 0.18
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.18
67 0.2
68 0.22
69 0.26
70 0.26
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.3
76 0.34
77 0.33
78 0.34
79 0.36
80 0.36
81 0.36
82 0.35
83 0.33
84 0.3
85 0.31
86 0.34
87 0.34
88 0.36
89 0.34
90 0.34
91 0.32
92 0.26
93 0.22
94 0.17
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.14
101 0.14
102 0.16
103 0.18
104 0.25
105 0.32
106 0.38
107 0.41
108 0.39
109 0.39
110 0.39
111 0.37
112 0.3
113 0.23
114 0.18
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.12
127 0.12
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.04
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.09
182 0.09
183 0.12
184 0.15
185 0.23
186 0.23
187 0.23
188 0.23
189 0.21
190 0.21
191 0.22
192 0.2
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.08
207 0.1
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.11
217 0.1
218 0.12
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.21
223 0.22
224 0.23
225 0.26
226 0.26
227 0.23
228 0.23
229 0.24
230 0.23
231 0.27
232 0.24
233 0.22
234 0.2
235 0.21
236 0.2
237 0.17
238 0.15
239 0.1
240 0.11
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.2
246 0.18
247 0.17
248 0.17
249 0.17
250 0.23
251 0.25
252 0.26
253 0.28
254 0.35
255 0.38
256 0.37
257 0.36
258 0.41
259 0.47
260 0.56
261 0.6
262 0.62
263 0.66
264 0.74
265 0.73
266 0.7
267 0.69
268 0.64
269 0.63
270 0.62
271 0.59
272 0.57
273 0.57
274 0.55
275 0.55
276 0.52
277 0.44
278 0.39
279 0.38
280 0.38
281 0.43
282 0.43
283 0.45
284 0.48
285 0.56
286 0.6
287 0.63
288 0.65
289 0.67
290 0.72
291 0.73
292 0.78
293 0.78
294 0.77
295 0.82
296 0.82
297 0.78
298 0.78
299 0.78
300 0.77
301 0.76
302 0.75
303 0.66
304 0.59
305 0.54
306 0.45
307 0.38
308 0.31
309 0.22
310 0.19
311 0.18
312 0.15
313 0.15
314 0.13
315 0.09
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.08
321 0.17
322 0.24
323 0.28
324 0.36
325 0.44
326 0.52
327 0.6
328 0.64
329 0.6
330 0.63
331 0.61
332 0.63
333 0.55
334 0.48
335 0.39
336 0.35
337 0.34