Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JMM9

Protein Details
Accession J5JMM9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32EQSYRLCQSRKSNNNNDAAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 11.5, cyto_mito 7.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MPFPFSDVCDLLEQSYRLCQSRKSNNNNDAAVHAWFRRHRAAVDAHDTDMAALLSTLLPEKRTDRVYCIQAPTLERVIGRALMLGSSRMLELATYKRPGAGVDLAECVERILSVTPNAVQEGQDQIVTVEQIDELLHGLAARIRWSAPAIRESSAAMSHESRGDLESMYRRLSARDAKWFTRLVLKDYQPLIFNANLLYRACDPVLPCILQIRDDFTEALAAMSSARGPLLPMAAAGGRGKLSTRRVLATVKPKLGVKVGRQQWLKGRSIKHCIDMGSGRMSVETKMDGEYCQIHVYLSSSQKRVQIFSKSGKDSTEDRSKVIPAIERALRLRTSECGFQEACILEGELVLYNDLDNTIMPFHKIRGHVTRRGRYMNTEQDSQPKPYEHLMIVYYDIFLVDDQSLMDVRHSERLKILQQVVHCERGLAALVPRETIDFRHSLAASALRKAFAKVIVERGEGLVLKPDEPYIVIDEKGRATSCRCIKLKKEYIGAFGDVGDFALVGAGFHAAKAKMYRIPNLKWTHFYIGCLNNKEQVQRWGDTPEFTIVCALELPQSLLQSFLAFGELTAVARADNTSTKLTVPPGIQCPHARLTVAFANPAVVDLCCFSFDKPGNTGGVWTPRFPAVTKIHTDRDYTNVVTLDELQAMAREAVEKPAQEVSQENLRWIAKLEGADPRGVAVDAVSQATATTMPTPSPVKLTMTTTRTTTQSTASGSSQESKAPTETSHQSQAVALPTPRAKEAEARREVSVSVISISSSSTASKTRSQKSAMRGSAKRVMGTASPEQSFKRRHCAASLGDKSAAPSAPPSRRPLENMNVNVSYGDSQSIDSQDSQATVKLEEPRRLANAQQQDIVIEIPSSDAEDDDDDDGSSQDLSSQSRSLAVVAAPKTTIAAAQQPSGSHHVHCKYVGAKCGFVGKTILLSSLALLHLAELTPLLRSHGVDVSRIIPCVETWWRKLGREEQQQQQQQQQQQQQQSRVLLVDSVQQSAETKALVARLDAARKEARREEGDWISVYDWRVLKHVSIAEDAGVEKKYYDGFQDPWRRWYCGLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.25
3 0.26
4 0.28
5 0.3
6 0.35
7 0.41
8 0.52
9 0.61
10 0.65
11 0.72
12 0.76
13 0.81
14 0.76
15 0.67
16 0.58
17 0.5
18 0.42
19 0.36
20 0.29
21 0.29
22 0.3
23 0.34
24 0.39
25 0.39
26 0.38
27 0.41
28 0.46
29 0.47
30 0.52
31 0.48
32 0.43
33 0.4
34 0.39
35 0.32
36 0.26
37 0.18
38 0.09
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.07
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.14
47 0.17
48 0.22
49 0.29
50 0.31
51 0.35
52 0.41
53 0.47
54 0.51
55 0.53
56 0.51
57 0.49
58 0.49
59 0.47
60 0.42
61 0.37
62 0.3
63 0.27
64 0.25
65 0.22
66 0.19
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.11
79 0.16
80 0.21
81 0.23
82 0.23
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.26
87 0.24
88 0.2
89 0.2
90 0.21
91 0.2
92 0.2
93 0.19
94 0.15
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.12
102 0.14
103 0.15
104 0.17
105 0.17
106 0.15
107 0.15
108 0.18
109 0.17
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.11
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.14
133 0.19
134 0.2
135 0.26
136 0.27
137 0.27
138 0.27
139 0.27
140 0.26
141 0.23
142 0.21
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.18
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.13
152 0.16
153 0.2
154 0.21
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.23
159 0.29
160 0.34
161 0.33
162 0.41
163 0.46
164 0.46
165 0.5
166 0.5
167 0.45
168 0.45
169 0.42
170 0.36
171 0.38
172 0.38
173 0.4
174 0.41
175 0.42
176 0.34
177 0.33
178 0.31
179 0.23
180 0.22
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.17
186 0.15
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.19
192 0.22
193 0.2
194 0.19
195 0.21
196 0.22
197 0.22
198 0.22
199 0.22
200 0.2
201 0.21
202 0.21
203 0.16
204 0.17
205 0.14
206 0.14
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.1
228 0.14
229 0.18
230 0.23
231 0.25
232 0.26
233 0.28
234 0.32
235 0.38
236 0.43
237 0.45
238 0.42
239 0.42
240 0.41
241 0.4
242 0.42
243 0.41
244 0.36
245 0.39
246 0.43
247 0.49
248 0.49
249 0.5
250 0.53
251 0.53
252 0.53
253 0.5
254 0.51
255 0.49
256 0.56
257 0.55
258 0.51
259 0.47
260 0.42
261 0.39
262 0.35
263 0.3
264 0.25
265 0.23
266 0.19
267 0.17
268 0.17
269 0.14
270 0.13
271 0.11
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.12
284 0.15
285 0.21
286 0.25
287 0.26
288 0.29
289 0.33
290 0.34
291 0.35
292 0.35
293 0.34
294 0.36
295 0.42
296 0.46
297 0.45
298 0.45
299 0.43
300 0.41
301 0.37
302 0.39
303 0.41
304 0.34
305 0.33
306 0.34
307 0.34
308 0.32
309 0.31
310 0.27
311 0.19
312 0.24
313 0.24
314 0.24
315 0.25
316 0.26
317 0.25
318 0.23
319 0.22
320 0.2
321 0.21
322 0.23
323 0.22
324 0.23
325 0.23
326 0.21
327 0.23
328 0.19
329 0.17
330 0.13
331 0.12
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.1
350 0.14
351 0.16
352 0.2
353 0.29
354 0.35
355 0.42
356 0.51
357 0.56
358 0.56
359 0.59
360 0.56
361 0.51
362 0.53
363 0.54
364 0.48
365 0.45
366 0.42
367 0.45
368 0.46
369 0.43
370 0.39
371 0.3
372 0.28
373 0.27
374 0.28
375 0.2
376 0.19
377 0.17
378 0.15
379 0.15
380 0.13
381 0.11
382 0.08
383 0.08
384 0.06
385 0.05
386 0.06
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.15
397 0.15
398 0.16
399 0.17
400 0.21
401 0.23
402 0.27
403 0.28
404 0.23
405 0.24
406 0.31
407 0.32
408 0.31
409 0.28
410 0.23
411 0.21
412 0.19
413 0.18
414 0.11
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.1
425 0.11
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.18
431 0.17
432 0.18
433 0.18
434 0.15
435 0.16
436 0.16
437 0.16
438 0.13
439 0.15
440 0.13
441 0.18
442 0.19
443 0.19
444 0.19
445 0.17
446 0.16
447 0.13
448 0.12
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.1
466 0.11
467 0.18
468 0.22
469 0.29
470 0.31
471 0.35
472 0.39
473 0.49
474 0.54
475 0.52
476 0.53
477 0.46
478 0.47
479 0.44
480 0.4
481 0.29
482 0.21
483 0.17
484 0.1
485 0.09
486 0.05
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.02
491 0.02
492 0.02
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.13
502 0.15
503 0.21
504 0.24
505 0.26
506 0.34
507 0.38
508 0.38
509 0.35
510 0.37
511 0.36
512 0.31
513 0.31
514 0.28
515 0.29
516 0.31
517 0.31
518 0.29
519 0.28
520 0.28
521 0.29
522 0.25
523 0.25
524 0.24
525 0.22
526 0.23
527 0.23
528 0.22
529 0.21
530 0.2
531 0.17
532 0.14
533 0.12
534 0.12
535 0.08
536 0.08
537 0.07
538 0.07
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.05
551 0.04
552 0.04
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.04
562 0.06
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.1
567 0.11
568 0.12
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.18
573 0.19
574 0.21
575 0.21
576 0.23
577 0.23
578 0.22
579 0.2
580 0.15
581 0.17
582 0.19
583 0.19
584 0.16
585 0.13
586 0.13
587 0.12
588 0.13
589 0.09
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.07
596 0.07
597 0.12
598 0.14
599 0.16
600 0.17
601 0.18
602 0.18
603 0.18
604 0.18
605 0.15
606 0.2
607 0.19
608 0.18
609 0.18
610 0.18
611 0.18
612 0.18
613 0.23
614 0.2
615 0.23
616 0.27
617 0.3
618 0.33
619 0.34
620 0.36
621 0.3
622 0.29
623 0.28
624 0.25
625 0.22
626 0.18
627 0.17
628 0.15
629 0.15
630 0.11
631 0.09
632 0.08
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.05
638 0.06
639 0.06
640 0.09
641 0.1
642 0.1
643 0.11
644 0.13
645 0.13
646 0.13
647 0.14
648 0.13
649 0.2
650 0.2
651 0.19
652 0.2
653 0.2
654 0.19
655 0.19
656 0.18
657 0.12
658 0.13
659 0.14
660 0.16
661 0.17
662 0.17
663 0.16
664 0.15
665 0.13
666 0.13
667 0.11
668 0.05
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.05
675 0.06
676 0.06
677 0.05
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.09
682 0.11
683 0.11
684 0.13
685 0.14
686 0.15
687 0.17
688 0.21
689 0.25
690 0.27
691 0.28
692 0.27
693 0.28
694 0.27
695 0.28
696 0.24
697 0.2
698 0.19
699 0.2
700 0.2
701 0.18
702 0.19
703 0.17
704 0.19
705 0.18
706 0.17
707 0.17
708 0.16
709 0.17
710 0.16
711 0.15
712 0.18
713 0.22
714 0.24
715 0.27
716 0.26
717 0.25
718 0.25
719 0.26
720 0.23
721 0.21
722 0.17
723 0.16
724 0.18
725 0.19
726 0.19
727 0.18
728 0.17
729 0.23
730 0.31
731 0.37
732 0.41
733 0.42
734 0.42
735 0.41
736 0.4
737 0.34
738 0.26
739 0.16
740 0.11
741 0.09
742 0.08
743 0.08
744 0.08
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.11
750 0.14
751 0.22
752 0.3
753 0.34
754 0.38
755 0.43
756 0.47
757 0.52
758 0.59
759 0.57
760 0.58
761 0.55
762 0.56
763 0.59
764 0.55
765 0.47
766 0.38
767 0.33
768 0.26
769 0.29
770 0.28
771 0.24
772 0.23
773 0.25
774 0.26
775 0.31
776 0.37
777 0.34
778 0.39
779 0.4
780 0.41
781 0.42
782 0.45
783 0.44
784 0.48
785 0.49
786 0.43
787 0.39
788 0.37
789 0.36
790 0.33
791 0.27
792 0.17
793 0.18
794 0.23
795 0.28
796 0.32
797 0.36
798 0.38
799 0.4
800 0.44
801 0.47
802 0.48
803 0.49
804 0.49
805 0.49
806 0.45
807 0.43
808 0.38
809 0.32
810 0.24
811 0.16
812 0.14
813 0.09
814 0.09
815 0.11
816 0.12
817 0.13
818 0.12
819 0.13
820 0.12
821 0.13
822 0.13
823 0.14
824 0.13
825 0.12
826 0.16
827 0.23
828 0.28
829 0.32
830 0.34
831 0.35
832 0.38
833 0.39
834 0.38
835 0.38
836 0.41
837 0.38
838 0.37
839 0.34
840 0.3
841 0.29
842 0.27
843 0.19
844 0.1
845 0.07
846 0.06
847 0.06
848 0.07
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.07
853 0.09
854 0.09
855 0.1
856 0.09
857 0.09
858 0.09
859 0.08
860 0.08
861 0.06
862 0.07
863 0.09
864 0.1
865 0.12
866 0.13
867 0.13
868 0.15
869 0.15
870 0.13
871 0.13
872 0.13
873 0.16
874 0.16
875 0.17
876 0.16
877 0.15
878 0.15
879 0.14
880 0.13
881 0.09
882 0.15
883 0.16
884 0.17
885 0.19
886 0.19
887 0.23
888 0.27
889 0.26
890 0.22
891 0.28
892 0.29
893 0.31
894 0.3
895 0.31
896 0.32
897 0.35
898 0.41
899 0.36
900 0.34
901 0.32
902 0.39
903 0.35
904 0.3
905 0.28
906 0.2
907 0.2
908 0.2
909 0.2
910 0.13
911 0.13
912 0.12
913 0.12
914 0.11
915 0.09
916 0.08
917 0.07
918 0.07
919 0.07
920 0.07
921 0.05
922 0.05
923 0.07
924 0.07
925 0.09
926 0.1
927 0.11
928 0.14
929 0.18
930 0.19
931 0.19
932 0.21
933 0.23
934 0.23
935 0.23
936 0.2
937 0.16
938 0.15
939 0.2
940 0.27
941 0.28
942 0.3
943 0.38
944 0.42
945 0.44
946 0.5
947 0.54
948 0.55
949 0.6
950 0.65
951 0.65
952 0.72
953 0.77
954 0.74
955 0.74
956 0.71
957 0.67
958 0.69
959 0.69
960 0.67
961 0.69
962 0.72
963 0.69
964 0.67
965 0.62
966 0.55
967 0.47
968 0.39
969 0.3
970 0.24
971 0.25
972 0.21
973 0.2
974 0.18
975 0.17
976 0.18
977 0.18
978 0.19
979 0.11
980 0.1
981 0.11
982 0.13
983 0.13
984 0.12
985 0.17
986 0.2
987 0.26
988 0.26
989 0.3
990 0.35
991 0.38
992 0.45
993 0.45
994 0.48
995 0.47
996 0.49
997 0.52
998 0.49
999 0.49
1000 0.43
1001 0.39
1002 0.33
1003 0.31
1004 0.29
1005 0.27
1006 0.24
1007 0.22
1008 0.24
1009 0.24
1010 0.24
1011 0.26
1012 0.28
1013 0.25
1014 0.26
1015 0.25
1016 0.22
1017 0.22
1018 0.22
1019 0.19
1020 0.17
1021 0.14
1022 0.12
1023 0.13
1024 0.15
1025 0.15
1026 0.19
1027 0.21
1028 0.24
1029 0.34
1030 0.44
1031 0.45
1032 0.53
1033 0.57
1034 0.55