Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177C520

Protein Details
Accession A0A177C520    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-49ETVKTLSRRISKFQRPRRRPPYHHPKMNSKDLIHydrophilic
318-339SWDMKCWRCEKNFRNKFRALQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-37RRISKFQRPRRRPP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011146  HIT-like  
IPR036265  HIT-like_sf  
IPR032566  Znf-C2HE  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01230  HIT  
PF16278  zf-C2HE  
Amino Acid Sequences MSINSLCSSRRLKPAPETVKTLSRRISKFQRPRRRPPYHHPKMNSKDLIIRADDASDEAITAEEITGDAAPRVAAHGGMPTTQGPGNAFAELMSKSKPPAKSVNETRNKGKPSSRPASSSKNFNGRDGLGIYVQYPERNPEGRVIEYDDEFVVIQDRYPKASVHLLLLPRDPSLTLEHPLVTLSNNPAFLAKLKPRVERLKLLAARELRRKYGLSSASDAPYQRALEDLMSSPDPPSPEERDSLLPQGRDWSREIMSGVHTHPSMNHLHIHVLSRDMHSPWLKKKNHYLSFNSSFLVGLDEFPLKDGSPRFHPGDWLSWDMKCWRCEKNFRNKFRALQEHLDEEFEEWKQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.69
3 0.67
4 0.68
5 0.63
6 0.66
7 0.64
8 0.61
9 0.58
10 0.57
11 0.56
12 0.58
13 0.64
14 0.66
15 0.73
16 0.79
17 0.82
18 0.83
19 0.9
20 0.93
21 0.93
22 0.91
23 0.91
24 0.92
25 0.91
26 0.92
27 0.88
28 0.87
29 0.84
30 0.85
31 0.77
32 0.68
33 0.64
34 0.59
35 0.55
36 0.46
37 0.4
38 0.3
39 0.27
40 0.25
41 0.18
42 0.15
43 0.11
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.1
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.11
72 0.14
73 0.15
74 0.13
75 0.13
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.11
81 0.11
82 0.13
83 0.19
84 0.2
85 0.23
86 0.31
87 0.35
88 0.43
89 0.52
90 0.61
91 0.64
92 0.67
93 0.69
94 0.67
95 0.64
96 0.59
97 0.56
98 0.54
99 0.54
100 0.57
101 0.54
102 0.52
103 0.54
104 0.59
105 0.56
106 0.56
107 0.51
108 0.54
109 0.51
110 0.48
111 0.45
112 0.36
113 0.34
114 0.27
115 0.23
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.11
124 0.14
125 0.15
126 0.16
127 0.18
128 0.21
129 0.21
130 0.22
131 0.23
132 0.21
133 0.19
134 0.19
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.17
149 0.18
150 0.15
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.19
155 0.17
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.09
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.14
178 0.15
179 0.23
180 0.27
181 0.29
182 0.35
183 0.42
184 0.45
185 0.45
186 0.45
187 0.46
188 0.45
189 0.43
190 0.42
191 0.4
192 0.41
193 0.44
194 0.42
195 0.35
196 0.34
197 0.34
198 0.31
199 0.33
200 0.32
201 0.26
202 0.28
203 0.29
204 0.28
205 0.29
206 0.27
207 0.22
208 0.2
209 0.18
210 0.14
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.16
224 0.19
225 0.2
226 0.21
227 0.23
228 0.25
229 0.27
230 0.32
231 0.31
232 0.26
233 0.24
234 0.3
235 0.29
236 0.27
237 0.27
238 0.25
239 0.22
240 0.23
241 0.24
242 0.18
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.18
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.17
251 0.17
252 0.16
253 0.18
254 0.16
255 0.18
256 0.2
257 0.22
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.21
263 0.2
264 0.24
265 0.27
266 0.32
267 0.39
268 0.47
269 0.5
270 0.53
271 0.63
272 0.68
273 0.71
274 0.72
275 0.7
276 0.69
277 0.71
278 0.66
279 0.56
280 0.45
281 0.36
282 0.29
283 0.25
284 0.16
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.11
292 0.15
293 0.18
294 0.2
295 0.25
296 0.31
297 0.34
298 0.34
299 0.38
300 0.37
301 0.41
302 0.41
303 0.4
304 0.36
305 0.32
306 0.35
307 0.37
308 0.4
309 0.38
310 0.38
311 0.41
312 0.48
313 0.59
314 0.66
315 0.7
316 0.74
317 0.79
318 0.83
319 0.81
320 0.8
321 0.8
322 0.8
323 0.75
324 0.74
325 0.69
326 0.66
327 0.6
328 0.54
329 0.44
330 0.36
331 0.32