Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177CIT1

Protein Details
Accession A0A177CIT1    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-67MSKSELKDEKKKRKRQEDGAVDVAKKSKKSKKSTDAAAEDPSVGDASKEKKEKKSKQAKKGGSSEDAHydrophilic
92-121GTISGDERKKEKKKEKKEKSSKKSKDAVEDBasic
129-152EAPAEKSKSKKDRKSKDSKADADPBasic
159-189VDSSSEKKDKKSKKGKKEKKAKKSKGVDEVABasic
198-226AEETPGKKSKKDKKSKKEKKSKNDPEDASBasic
380-399GKQAERKAKKESQKGKDGKDBasic
426-445QPERPQKQFKPNMGNVPKWKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-33EKKKRKRQEDGAVDVAKKSKKSKKS
46-61ASKEKKEKKSKQAKKG
99-116RKKEKKKEKKEKSSKKSK
134-144KSKSKKDRKSK
165-183KKDKKSKKGKKEKKAKKSK
203-219GKKSKKDKKSKKEKKSK
363-398KLANERQRNHEKRAEIEGKQAERKAKKESQKGKDGK
442-455PKWKGGPPARGPKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSKSELKDEKKKRKRQEDGAVDVAKKSKKSKKSTDAAAEDPSVGDASKEKKEKKSKQAKKGGSSEDAAPAADGFIAFDDTPMPDAFAGAMNGTISGDERKKEKKKEKKEKSSKKSKDAVEDEAESASVEAPAEKSKSKKDRKSKDSKADADPVESAAAVDSSSEKKDKKSKKGKKEKKAKKSKGVDEVAEPMDVDGAAEETPGKKSKKDKKSKKEKKSKNDPEDASEEVESTPAANDTDDHDEQAEGEANGAADDASQKGPFIVFVGNLPFSTTKEQIEEHFAKLKPFEVRLRTYKDTGKSMGCAFIQFERFDHMQTALLKFHHSVIDDPKKKEGRKINVELSAGGGGNTEARMAKINAKNEKLANERQRNHEKRAEIEGKQAERKAKKESQKGKDGKDGEAGGEGAAEEPENAGIHPARLAMLAQPERPQKQFKPNMGNVPKWKGGPPARGPKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.93
4 0.91
5 0.88
6 0.86
7 0.8
8 0.69
9 0.62
10 0.57
11 0.5
12 0.45
13 0.47
14 0.48
15 0.53
16 0.62
17 0.7
18 0.74
19 0.79
20 0.84
21 0.84
22 0.8
23 0.74
24 0.68
25 0.58
26 0.48
27 0.39
28 0.3
29 0.2
30 0.14
31 0.12
32 0.12
33 0.16
34 0.24
35 0.32
36 0.37
37 0.47
38 0.59
39 0.68
40 0.75
41 0.82
42 0.84
43 0.87
44 0.91
45 0.9
46 0.88
47 0.87
48 0.82
49 0.75
50 0.67
51 0.58
52 0.51
53 0.43
54 0.34
55 0.25
56 0.18
57 0.14
58 0.11
59 0.09
60 0.05
61 0.05
62 0.07
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.1
83 0.13
84 0.15
85 0.2
86 0.3
87 0.39
88 0.5
89 0.6
90 0.66
91 0.75
92 0.84
93 0.9
94 0.92
95 0.95
96 0.96
97 0.96
98 0.96
99 0.94
100 0.91
101 0.88
102 0.81
103 0.8
104 0.73
105 0.67
106 0.6
107 0.53
108 0.44
109 0.36
110 0.31
111 0.21
112 0.17
113 0.11
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.08
119 0.1
120 0.13
121 0.16
122 0.25
123 0.36
124 0.46
125 0.55
126 0.63
127 0.72
128 0.8
129 0.88
130 0.89
131 0.89
132 0.88
133 0.84
134 0.78
135 0.75
136 0.65
137 0.56
138 0.46
139 0.36
140 0.26
141 0.2
142 0.15
143 0.07
144 0.07
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.07
149 0.09
150 0.13
151 0.14
152 0.2
153 0.3
154 0.39
155 0.48
156 0.58
157 0.66
158 0.74
159 0.84
160 0.89
161 0.9
162 0.93
163 0.93
164 0.92
165 0.94
166 0.92
167 0.9
168 0.89
169 0.86
170 0.84
171 0.77
172 0.67
173 0.57
174 0.52
175 0.42
176 0.32
177 0.24
178 0.15
179 0.11
180 0.09
181 0.07
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.07
189 0.12
190 0.13
191 0.16
192 0.27
193 0.37
194 0.48
195 0.58
196 0.67
197 0.73
198 0.84
199 0.91
200 0.93
201 0.93
202 0.93
203 0.92
204 0.93
205 0.93
206 0.89
207 0.87
208 0.77
209 0.7
210 0.63
211 0.53
212 0.43
213 0.32
214 0.24
215 0.15
216 0.14
217 0.1
218 0.07
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.07
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.11
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.23
266 0.23
267 0.22
268 0.27
269 0.27
270 0.26
271 0.26
272 0.28
273 0.23
274 0.25
275 0.28
276 0.27
277 0.32
278 0.37
279 0.44
280 0.44
281 0.45
282 0.47
283 0.45
284 0.43
285 0.41
286 0.36
287 0.31
288 0.28
289 0.27
290 0.22
291 0.19
292 0.16
293 0.17
294 0.18
295 0.17
296 0.16
297 0.18
298 0.18
299 0.18
300 0.18
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.2
305 0.18
306 0.18
307 0.18
308 0.18
309 0.19
310 0.17
311 0.16
312 0.16
313 0.24
314 0.35
315 0.4
316 0.41
317 0.48
318 0.53
319 0.54
320 0.59
321 0.59
322 0.59
323 0.62
324 0.67
325 0.65
326 0.62
327 0.62
328 0.53
329 0.45
330 0.36
331 0.26
332 0.19
333 0.13
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.1
341 0.11
342 0.2
343 0.24
344 0.32
345 0.39
346 0.41
347 0.45
348 0.44
349 0.49
350 0.47
351 0.51
352 0.54
353 0.57
354 0.59
355 0.64
356 0.73
357 0.73
358 0.74
359 0.71
360 0.64
361 0.58
362 0.63
363 0.61
364 0.51
365 0.54
366 0.53
367 0.52
368 0.54
369 0.54
370 0.53
371 0.52
372 0.54
373 0.55
374 0.56
375 0.61
376 0.66
377 0.73
378 0.73
379 0.77
380 0.81
381 0.78
382 0.78
383 0.71
384 0.63
385 0.58
386 0.5
387 0.4
388 0.34
389 0.28
390 0.19
391 0.16
392 0.14
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.19
411 0.22
412 0.24
413 0.31
414 0.38
415 0.42
416 0.47
417 0.52
418 0.51
419 0.59
420 0.66
421 0.69
422 0.71
423 0.74
424 0.8
425 0.79
426 0.8
427 0.77
428 0.75
429 0.7
430 0.62
431 0.58
432 0.57
433 0.57
434 0.59
435 0.61
436 0.64