Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177C4B4

Protein Details
Accession A0A177C4B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-327ASIASQPKPGKEKRRKSKGPGSLASPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
307-321QPKPGKEKRRKSKGP
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences SNTILWYFYNSPWFDQGSNNNSLLRQVGGTPQQELLFNNRVAFEERMRTDYPYGTQYVVAYEPKNEGEPWVIQRQEKSVDQETGRTAKTEVTATYYTQGTRIFMAKSLLDVLQTRLLSVSTQLQDLMELSQGLSHFSPATGHTYVPPSFDLAKASSASRGGSRAGSRTGSPVPDQSSQSQSQTQPGAQPTAADPFETFSDAFFLRSLDRTEAYFEEYVDENPLQGEPGSFVLTHSWRNTVTRREEDKKRAEQAAAQQAAAAQAAAQPTQLSISTSQTQSGLQSSTSTPKPATPATESFSRKASIASQPKPGKEKRRKSKGPGSLASPVTPTGP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.37
4 0.35
5 0.39
6 0.38
7 0.36
8 0.33
9 0.33
10 0.29
11 0.22
12 0.17
13 0.13
14 0.18
15 0.23
16 0.24
17 0.25
18 0.26
19 0.26
20 0.26
21 0.26
22 0.27
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.24
27 0.25
28 0.27
29 0.29
30 0.26
31 0.28
32 0.29
33 0.32
34 0.33
35 0.35
36 0.33
37 0.32
38 0.31
39 0.26
40 0.26
41 0.22
42 0.22
43 0.19
44 0.18
45 0.19
46 0.19
47 0.16
48 0.16
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.17
53 0.16
54 0.16
55 0.19
56 0.22
57 0.27
58 0.28
59 0.28
60 0.3
61 0.32
62 0.34
63 0.33
64 0.34
65 0.32
66 0.35
67 0.34
68 0.35
69 0.35
70 0.34
71 0.32
72 0.26
73 0.22
74 0.19
75 0.2
76 0.19
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.17
85 0.18
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.15
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.15
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.15
159 0.17
160 0.19
161 0.21
162 0.2
163 0.23
164 0.23
165 0.24
166 0.25
167 0.22
168 0.23
169 0.22
170 0.21
171 0.2
172 0.2
173 0.19
174 0.15
175 0.15
176 0.13
177 0.16
178 0.15
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.07
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.08
190 0.09
191 0.08
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.14
198 0.14
199 0.16
200 0.15
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.11
219 0.13
220 0.16
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.21
225 0.26
226 0.3
227 0.36
228 0.41
229 0.49
230 0.55
231 0.62
232 0.67
233 0.71
234 0.71
235 0.7
236 0.64
237 0.57
238 0.53
239 0.53
240 0.54
241 0.46
242 0.38
243 0.32
244 0.29
245 0.28
246 0.24
247 0.15
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.14
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.2
267 0.16
268 0.12
269 0.14
270 0.15
271 0.2
272 0.22
273 0.23
274 0.22
275 0.23
276 0.27
277 0.28
278 0.3
279 0.3
280 0.32
281 0.34
282 0.42
283 0.43
284 0.4
285 0.4
286 0.37
287 0.31
288 0.29
289 0.3
290 0.32
291 0.38
292 0.4
293 0.48
294 0.53
295 0.58
296 0.65
297 0.69
298 0.7
299 0.71
300 0.79
301 0.8
302 0.85
303 0.89
304 0.9
305 0.92
306 0.91
307 0.9
308 0.84
309 0.79
310 0.76
311 0.68
312 0.59
313 0.5