Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177CPL4

Protein Details
Accession A0A177CPL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-189QDPKARVKKSKYKKAIPKQTAHydrophilic
247-271FDGFVRPDKKRKSQQNKFARLPRNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-183KARVKKSKYKKA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
PF17683  TFIIF_beta_N  
Amino Acid Sequences MMKTEGGSPSFGEGGYMDDEFYEDTGELSLPREGEKHVMIARIPDWLYDHLTTWDKFLAQPGDDNEKITLGEVLSLPPDNAYDRNKAQKDGKKPSVKREGPPEPPSMRIFFNSDWNKVTKLPTAYEIEGQTVNETLLKNTYVFTEKDLPGYKHNGAGQNKANPSNGAVQDPKARVKKSKYKKAIPKQTALIGSVNTQYLAKPLNTAEFIAFNTARTKEAIQGRNSSTNIMTEIVDEVTVMNNLQNHFDGFVRPDKKRKSQQNKFARLPRNELIDILHAAFDNHKYWPMRAIKQHTKQPEAYLKEVLPSLAVLIKSGPFASYWKRDDSYDRPSLHDGIADIKIEEEEDDEEDEEMEDVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.1
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.17
22 0.18
23 0.2
24 0.21
25 0.23
26 0.22
27 0.24
28 0.23
29 0.24
30 0.23
31 0.2
32 0.2
33 0.2
34 0.24
35 0.21
36 0.22
37 0.22
38 0.26
39 0.25
40 0.24
41 0.23
42 0.2
43 0.19
44 0.24
45 0.23
46 0.19
47 0.23
48 0.25
49 0.32
50 0.31
51 0.32
52 0.27
53 0.24
54 0.23
55 0.2
56 0.17
57 0.09
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.14
68 0.17
69 0.21
70 0.26
71 0.36
72 0.37
73 0.41
74 0.48
75 0.52
76 0.58
77 0.63
78 0.68
79 0.69
80 0.71
81 0.76
82 0.78
83 0.76
84 0.71
85 0.71
86 0.69
87 0.67
88 0.67
89 0.65
90 0.55
91 0.54
92 0.51
93 0.44
94 0.37
95 0.3
96 0.3
97 0.24
98 0.32
99 0.32
100 0.31
101 0.31
102 0.31
103 0.31
104 0.29
105 0.3
106 0.25
107 0.24
108 0.23
109 0.24
110 0.26
111 0.26
112 0.27
113 0.24
114 0.21
115 0.19
116 0.18
117 0.15
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.14
131 0.2
132 0.19
133 0.23
134 0.26
135 0.26
136 0.26
137 0.31
138 0.28
139 0.25
140 0.28
141 0.31
142 0.29
143 0.33
144 0.34
145 0.35
146 0.37
147 0.35
148 0.33
149 0.26
150 0.26
151 0.26
152 0.23
153 0.2
154 0.18
155 0.18
156 0.22
157 0.24
158 0.28
159 0.27
160 0.28
161 0.31
162 0.38
163 0.47
164 0.52
165 0.61
166 0.64
167 0.69
168 0.77
169 0.82
170 0.85
171 0.8
172 0.73
173 0.65
174 0.6
175 0.52
176 0.43
177 0.33
178 0.23
179 0.19
180 0.16
181 0.14
182 0.1
183 0.09
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.17
205 0.25
206 0.3
207 0.3
208 0.34
209 0.36
210 0.4
211 0.4
212 0.35
213 0.27
214 0.22
215 0.21
216 0.17
217 0.14
218 0.09
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.2
238 0.24
239 0.27
240 0.35
241 0.42
242 0.51
243 0.59
244 0.68
245 0.71
246 0.76
247 0.84
248 0.86
249 0.88
250 0.87
251 0.87
252 0.85
253 0.78
254 0.75
255 0.68
256 0.63
257 0.54
258 0.46
259 0.38
260 0.31
261 0.28
262 0.21
263 0.18
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.17
271 0.18
272 0.19
273 0.27
274 0.32
275 0.37
276 0.44
277 0.53
278 0.58
279 0.65
280 0.72
281 0.71
282 0.7
283 0.66
284 0.65
285 0.64
286 0.59
287 0.54
288 0.5
289 0.43
290 0.39
291 0.37
292 0.29
293 0.2
294 0.15
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.13
306 0.2
307 0.27
308 0.3
309 0.34
310 0.36
311 0.38
312 0.45
313 0.48
314 0.49
315 0.5
316 0.48
317 0.47
318 0.49
319 0.49
320 0.41
321 0.36
322 0.28
323 0.24
324 0.25
325 0.21
326 0.17
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.13
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.12