Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177CHP1

Protein Details
Accession A0A177CHP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
482-506LEKTAEKHAREKKKQEEKFAKEVRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
486-521AEKHAREKKKQEEKFAKEVRKLEARRERETKKLLAR
589-620ELEGKKGRERAGSRGSNRSGGSGSGRKSGHQR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024500  DUF3074  
IPR023393  START-like_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF11274  DUF3074  
CDD cd08864  SRPBCC_DUF3074  
Amino Acid Sequences MAELHKALECLRPKDFADIPVNDLKTFLPEIFAKAELIANSVPPPPNGTPYESSQRSRSDANCARSAAELTISKARRPIRPEHEALHKAWGKPVKLGAKETATGISVFKMAGHDRHGAWFARTSVHEGLGFAKWKKAMMREFPASLEVQGGPGEGNVRGIGGDQRLEDINVDGIGKLEVYQLSAQFPGPTAPREFLTLLLTSPNCLSNASKVGDVMPRHYMVVSIPVSHESAPPRDGMVRGQYESVEMIREIPLAHSRHTNPVEWIMITRSDPGGGIPRFMVERGTPGSIVNDAGKFLDWACSNDDFPSREEDEQHSTVAEPLEEHTRQSFDRQPRLSIVENNGILAGVGTSIADRPVSIRHPSQRNLDAIAQAINSLHRTDSQSSTATSLSSIDSFASAEQYNTAPEGPPVSSPLSTTSNTSIPLASGDSSKSPTQLQDRHNRELQKIEEKRAKLKERLDAARSKQDQSTLSLTTKSEKELEKTAEKHAREKKKQEEKFAKEVRKLEARRERETKKLLARQQKEADKTALQKAQRERDEYKSRAELAEQELRIVKEQIGELQRENTALVAGMGKSEKGMEVLRRVREELEGKKGRERAGSRGSNRSGGSGSGRKSGHQREGSGLAKGEGPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.42
4 0.43
5 0.4
6 0.43
7 0.46
8 0.46
9 0.39
10 0.37
11 0.3
12 0.26
13 0.26
14 0.21
15 0.17
16 0.17
17 0.2
18 0.22
19 0.22
20 0.19
21 0.18
22 0.2
23 0.16
24 0.18
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.2
29 0.2
30 0.18
31 0.24
32 0.23
33 0.29
34 0.3
35 0.34
36 0.33
37 0.37
38 0.47
39 0.46
40 0.48
41 0.47
42 0.48
43 0.46
44 0.48
45 0.44
46 0.45
47 0.48
48 0.51
49 0.5
50 0.47
51 0.45
52 0.4
53 0.4
54 0.3
55 0.26
56 0.22
57 0.21
58 0.28
59 0.29
60 0.29
61 0.34
62 0.38
63 0.4
64 0.44
65 0.51
66 0.51
67 0.58
68 0.61
69 0.59
70 0.64
71 0.62
72 0.57
73 0.57
74 0.53
75 0.45
76 0.47
77 0.48
78 0.39
79 0.39
80 0.45
81 0.43
82 0.42
83 0.45
84 0.43
85 0.4
86 0.4
87 0.38
88 0.32
89 0.25
90 0.22
91 0.18
92 0.14
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.13
98 0.15
99 0.18
100 0.21
101 0.21
102 0.24
103 0.27
104 0.25
105 0.24
106 0.25
107 0.22
108 0.22
109 0.22
110 0.25
111 0.23
112 0.24
113 0.22
114 0.19
115 0.21
116 0.21
117 0.25
118 0.2
119 0.22
120 0.21
121 0.23
122 0.26
123 0.3
124 0.34
125 0.37
126 0.44
127 0.45
128 0.45
129 0.43
130 0.42
131 0.35
132 0.28
133 0.22
134 0.15
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.08
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.18
181 0.18
182 0.16
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.15
187 0.15
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.17
200 0.21
201 0.2
202 0.2
203 0.18
204 0.18
205 0.18
206 0.17
207 0.16
208 0.11
209 0.17
210 0.15
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.14
216 0.17
217 0.13
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.18
226 0.18
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.19
244 0.2
245 0.28
246 0.29
247 0.29
248 0.24
249 0.26
250 0.25
251 0.21
252 0.2
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.15
262 0.13
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.06
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.1
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.09
286 0.08
287 0.09
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.16
293 0.14
294 0.15
295 0.18
296 0.17
297 0.17
298 0.18
299 0.2
300 0.23
301 0.22
302 0.22
303 0.17
304 0.15
305 0.16
306 0.14
307 0.11
308 0.06
309 0.06
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.22
318 0.24
319 0.32
320 0.33
321 0.34
322 0.34
323 0.37
324 0.36
325 0.32
326 0.29
327 0.25
328 0.24
329 0.23
330 0.2
331 0.16
332 0.14
333 0.11
334 0.07
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.04
344 0.07
345 0.1
346 0.13
347 0.17
348 0.24
349 0.3
350 0.34
351 0.38
352 0.4
353 0.38
354 0.38
355 0.35
356 0.28
357 0.23
358 0.2
359 0.15
360 0.11
361 0.1
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.11
368 0.14
369 0.16
370 0.18
371 0.18
372 0.19
373 0.2
374 0.18
375 0.15
376 0.12
377 0.11
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.07
394 0.07
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.12
402 0.15
403 0.17
404 0.17
405 0.19
406 0.19
407 0.18
408 0.19
409 0.19
410 0.15
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.14
422 0.17
423 0.24
424 0.31
425 0.37
426 0.44
427 0.5
428 0.55
429 0.59
430 0.58
431 0.52
432 0.52
433 0.49
434 0.49
435 0.47
436 0.49
437 0.51
438 0.5
439 0.56
440 0.59
441 0.61
442 0.57
443 0.58
444 0.58
445 0.59
446 0.63
447 0.6
448 0.58
449 0.56
450 0.59
451 0.56
452 0.51
453 0.45
454 0.43
455 0.39
456 0.36
457 0.35
458 0.28
459 0.27
460 0.26
461 0.25
462 0.25
463 0.25
464 0.23
465 0.24
466 0.23
467 0.25
468 0.29
469 0.34
470 0.36
471 0.38
472 0.45
473 0.47
474 0.47
475 0.53
476 0.56
477 0.62
478 0.65
479 0.72
480 0.74
481 0.77
482 0.81
483 0.83
484 0.84
485 0.81
486 0.82
487 0.82
488 0.78
489 0.74
490 0.72
491 0.67
492 0.66
493 0.61
494 0.61
495 0.62
496 0.6
497 0.62
498 0.68
499 0.66
500 0.65
501 0.69
502 0.66
503 0.66
504 0.68
505 0.69
506 0.7
507 0.71
508 0.71
509 0.74
510 0.74
511 0.69
512 0.64
513 0.59
514 0.53
515 0.53
516 0.52
517 0.48
518 0.43
519 0.46
520 0.5
521 0.56
522 0.56
523 0.58
524 0.55
525 0.59
526 0.66
527 0.62
528 0.6
529 0.55
530 0.51
531 0.46
532 0.43
533 0.38
534 0.35
535 0.4
536 0.33
537 0.31
538 0.33
539 0.32
540 0.33
541 0.3
542 0.24
543 0.19
544 0.19
545 0.24
546 0.25
547 0.27
548 0.26
549 0.28
550 0.27
551 0.25
552 0.24
553 0.17
554 0.13
555 0.11
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.1
565 0.11
566 0.15
567 0.18
568 0.27
569 0.34
570 0.39
571 0.41
572 0.43
573 0.42
574 0.44
575 0.47
576 0.43
577 0.47
578 0.5
579 0.49
580 0.55
581 0.58
582 0.55
583 0.56
584 0.54
585 0.52
586 0.54
587 0.61
588 0.6
589 0.65
590 0.65
591 0.61
592 0.59
593 0.52
594 0.43
595 0.36
596 0.38
597 0.35
598 0.34
599 0.36
600 0.36
601 0.37
602 0.45
603 0.51
604 0.53
605 0.53
606 0.52
607 0.5
608 0.57
609 0.56
610 0.5
611 0.43
612 0.34