Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177CUX7

Protein Details
Accession A0A177CUX7    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-209NYGVRREKKMEARQYMNRQGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-19RERRDRD
21-87FRDSRNGGRDRANAPDSRNRSRSPRRDGGDRRGGYRDRSPPGRGGDRGRGRGRGSRGRGGWDGDRGG
106-118PPTGPRGAPAGPR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADDRRGGGDRIRERRDRDDFRDSRNGGRDRANAPDSRNRSRSPRRDGGDRRGGYRDRSPPGRGGDRGRGRGRGSRGRGGWDGDRGGDRRQYNDRDVRDPRSNREPPTGPRGAPAGPRREFNPGGAPKAPADSCAAASPEADEDVKMEEQPQRQRPEGMDDDTWEMAQVMGFARFKSTKNTKVPGNDKNYGVRREKKMEARQYMNRQGGFNRPLSPSHG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.68
3 0.74
4 0.73
5 0.7
6 0.72
7 0.69
8 0.69
9 0.74
10 0.66
11 0.63
12 0.64
13 0.6
14 0.52
15 0.55
16 0.53
17 0.45
18 0.5
19 0.47
20 0.41
21 0.43
22 0.49
23 0.5
24 0.53
25 0.55
26 0.51
27 0.57
28 0.65
29 0.69
30 0.69
31 0.71
32 0.67
33 0.73
34 0.77
35 0.77
36 0.76
37 0.68
38 0.62
39 0.6
40 0.57
41 0.51
42 0.51
43 0.49
44 0.45
45 0.49
46 0.48
47 0.46
48 0.5
49 0.51
50 0.47
51 0.45
52 0.48
53 0.5
54 0.55
55 0.53
56 0.51
57 0.48
58 0.5
59 0.52
60 0.51
61 0.49
62 0.48
63 0.46
64 0.46
65 0.45
66 0.42
67 0.37
68 0.31
69 0.26
70 0.2
71 0.22
72 0.19
73 0.19
74 0.22
75 0.2
76 0.22
77 0.28
78 0.3
79 0.34
80 0.4
81 0.4
82 0.42
83 0.45
84 0.47
85 0.5
86 0.48
87 0.47
88 0.5
89 0.51
90 0.47
91 0.49
92 0.46
93 0.41
94 0.46
95 0.43
96 0.34
97 0.3
98 0.29
99 0.25
100 0.28
101 0.29
102 0.3
103 0.28
104 0.29
105 0.3
106 0.34
107 0.33
108 0.28
109 0.32
110 0.26
111 0.29
112 0.29
113 0.28
114 0.22
115 0.25
116 0.23
117 0.15
118 0.15
119 0.13
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.1
135 0.14
136 0.19
137 0.28
138 0.35
139 0.37
140 0.38
141 0.41
142 0.4
143 0.43
144 0.41
145 0.37
146 0.3
147 0.27
148 0.29
149 0.27
150 0.25
151 0.18
152 0.14
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.06
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.14
161 0.16
162 0.17
163 0.26
164 0.33
165 0.39
166 0.46
167 0.51
168 0.53
169 0.6
170 0.68
171 0.67
172 0.67
173 0.63
174 0.58
175 0.63
176 0.64
177 0.62
178 0.62
179 0.62
180 0.61
181 0.63
182 0.69
183 0.7
184 0.73
185 0.76
186 0.76
187 0.75
188 0.77
189 0.8
190 0.82
191 0.78
192 0.7
193 0.62
194 0.57
195 0.58
196 0.53
197 0.46
198 0.42
199 0.37