FuNGI

A0A177CA66

Protein Details

Accession

A0A177CA66

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
47-100	YYGDRDHRDSRRHGRDRDRSRDRYTTRESNGERRHSRERRRRDGSRPRSSKSKD	Basic
139-164	GGGRGGRSRSPRRDRGDRREDRYRDR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
56-99	SRRHGRDRDRSRDRYTTRESNGERRHSRERRRRDGSRPRSSKSK
117-185	SRDRYRGGRGRDRGDRGGDYYSGGGRGGRSRSPRRDRGDRREDRYRDRSSGPARRDRDTDDRRGSGRRR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12283 RRM1_RBM39_like cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MEVENFLDNVAKELEDEQKRKAKSDTGDHNDDERRTRSDRSDRGDRYYGDRDHRDSRRHGRDRDRSRDRYTTRESNGERRHSRERRRRDGSRPRSSKSKDADTDEDRARYSSHRSSSRDRYRGGRGRDRGDRGGDYYSGGGRGGRSRSPRRDRGDRREDRYRDRSSGPARRDRDTDDRRGSGRRRTPTPEPTEDDRDKRTIFVQQISQRAETRHLKAFFEAVGPVVEAQIVKDRVTGRSKGVGYVEFKSEESVPKALELTGQKLKGVPIIAQLTEAEKNRASRTTGEGGAASATNGAPFHRLYVGNIHFSVTEEDLKEIFLPFGELEQVTLQRDEQNPTRSKGYGFVQFVDPNDAKKALTEMNGFELAGRQIRVGLGNDKFTPESTAHLLRNFPTQAAAYQGSAFSGAGGRGAYAGGSGGVFDRAHGRDDRGISGASALDDTDMAGVNFKQVDRNKLMMNLARNEVDIPTKKDDRPTAKARAPVENTIAPSKCIKIQNVFDADEELSKYGANWAKDLETEIKVECDKKYGKVVHIAVDANSDGEVFVKFDSVSGGEKALQGLNGRTFNYRVIRASYVVDKVYNSLYGAAANF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.3
3	0.33
4	0.38
5	0.45
6	0.46
7	0.49
8	0.51
9	0.49
10	0.48
11	0.55
12	0.59
13	0.59
14	0.64
15	0.62
16	0.64
17	0.63
18	0.58
19	0.54
20	0.47
21	0.44
22	0.42
23	0.46
24	0.49
25	0.54
26	0.59
27	0.61
28	0.68
29	0.66
30	0.7
31	0.71
32	0.63
33	0.6
34	0.61
35	0.59
36	0.56
37	0.58
38	0.57
39	0.6
40	0.65
41	0.65
42	0.66
43	0.71
44	0.73
45	0.76
46	0.8
47	0.81
48	0.84
49	0.87
50	0.89
51	0.89
52	0.85
53	0.83
54	0.85
55	0.78
56	0.76
57	0.74
58	0.72
59	0.67
60	0.68
61	0.66
62	0.66
63	0.7
64	0.72
65	0.68
66	0.66
67	0.72
68	0.73
69	0.79
70	0.79
71	0.81
72	0.82
73	0.86
74	0.88
75	0.88
76	0.9
77	0.89
78	0.9
79	0.87
80	0.81
81	0.82
82	0.79
83	0.76
84	0.72
85	0.71
86	0.66
87	0.65
88	0.67
89	0.61
90	0.62
91	0.57
92	0.52
93	0.42
94	0.37
95	0.32
96	0.27
97	0.31
98	0.31
99	0.35
100	0.41
101	0.46
102	0.54
103	0.63
104	0.71
105	0.7
106	0.65
107	0.64
108	0.67
109	0.7
110	0.7
111	0.69
112	0.65
113	0.66
114	0.71
115	0.71
116	0.65
117	0.61
118	0.54
119	0.46
120	0.42
121	0.35
122	0.28
123	0.23
124	0.19
125	0.15
126	0.13
127	0.11
128	0.1
129	0.15
130	0.17
131	0.21
132	0.29
133	0.38
134	0.49
135	0.58
136	0.65
137	0.69
138	0.77
139	0.82
140	0.84
141	0.86
142	0.84
143	0.82
144	0.84
145	0.82
146	0.8
147	0.78
148	0.73
149	0.66
150	0.6
151	0.6
152	0.59
153	0.62
154	0.6
155	0.6
156	0.58
157	0.57
158	0.57
159	0.55
160	0.56
161	0.55
162	0.57
163	0.54
164	0.54
165	0.53
166	0.58
167	0.56
168	0.55
169	0.56
170	0.54
171	0.53
172	0.57
173	0.63
174	0.64
175	0.67
176	0.63
177	0.61
178	0.6
179	0.63
180	0.61
181	0.57
182	0.51
183	0.47
184	0.41
185	0.36
186	0.32
187	0.3
188	0.28
189	0.27
190	0.31
191	0.32
192	0.38
193	0.39
194	0.4
195	0.36
196	0.34
197	0.38
198	0.36
199	0.35
200	0.37
201	0.36
202	0.34
203	0.33
204	0.33
205	0.26
206	0.22
207	0.18
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.1
217	0.11
218	0.11
219	0.14
220	0.15
221	0.19
222	0.24
223	0.25
224	0.21
225	0.27
226	0.27
227	0.26
228	0.26
229	0.25
230	0.23
231	0.23
232	0.23
233	0.18
234	0.18
235	0.17
236	0.17
237	0.16
238	0.15
239	0.15
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.11
244	0.14
245	0.13
246	0.15
247	0.18
248	0.18
249	0.18
250	0.18
251	0.19
252	0.17
253	0.16
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.13
258	0.12
259	0.12
260	0.12
261	0.15
262	0.15
263	0.13
264	0.13
265	0.15
266	0.16
267	0.17
268	0.17
269	0.15
270	0.19
271	0.21
272	0.2
273	0.19
274	0.17
275	0.16
276	0.14
277	0.13
278	0.08
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.16
291	0.18
292	0.18
293	0.18
294	0.18
295	0.15
296	0.16
297	0.17
298	0.11
299	0.11
300	0.09
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.09
305	0.08
306	0.07
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.11
320	0.13
321	0.16
322	0.2
323	0.27
324	0.3
325	0.32
326	0.34
327	0.3
328	0.29
329	0.3
330	0.28
331	0.27
332	0.25
333	0.24
334	0.24
335	0.25
336	0.25
337	0.27
338	0.24
339	0.18
340	0.18
341	0.18
342	0.15
343	0.14
344	0.16
345	0.11
346	0.14
347	0.14
348	0.13
349	0.15
350	0.15
351	0.15
352	0.13
353	0.12
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.1
361	0.1
362	0.15
363	0.15
364	0.17
365	0.17
366	0.19
367	0.19
368	0.17
369	0.18
370	0.13
371	0.15
372	0.16
373	0.2
374	0.2
375	0.22
376	0.22
377	0.21
378	0.26
379	0.23
380	0.2
381	0.16
382	0.15
383	0.14
384	0.17
385	0.17
386	0.12
387	0.12
388	0.12
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.04
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.11
411	0.12
412	0.15
413	0.16
414	0.18
415	0.21
416	0.23
417	0.24
418	0.21
419	0.2
420	0.17
421	0.17
422	0.15
423	0.1
424	0.09
425	0.07
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.07
435	0.08
436	0.09
437	0.16
438	0.18
439	0.25
440	0.28
441	0.32
442	0.31
443	0.33
444	0.37
445	0.34
446	0.37
447	0.33
448	0.31
449	0.29
450	0.28
451	0.26
452	0.23
453	0.25
454	0.24
455	0.26
456	0.3
457	0.34
458	0.36
459	0.42
460	0.49
461	0.5
462	0.54
463	0.57
464	0.59
465	0.59
466	0.63
467	0.6
468	0.6
469	0.57
470	0.52
471	0.5
472	0.44
473	0.42
474	0.42
475	0.4
476	0.33
477	0.3
478	0.29
479	0.3
480	0.32
481	0.34
482	0.35
483	0.39
484	0.45
485	0.47
486	0.46
487	0.4
488	0.37
489	0.34
490	0.28
491	0.24
492	0.17
493	0.13
494	0.11
495	0.11
496	0.16
497	0.2
498	0.19
499	0.19
500	0.2
501	0.21
502	0.22
503	0.25
504	0.22
505	0.2
506	0.2
507	0.2
508	0.21
509	0.23
510	0.26
511	0.23
512	0.25
513	0.27
514	0.28
515	0.37
516	0.39
517	0.4
518	0.46
519	0.48
520	0.45
521	0.46
522	0.44
523	0.35
524	0.33
525	0.29
526	0.2
527	0.18
528	0.13
529	0.09
530	0.08
531	0.08
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.09
538	0.1
539	0.12
540	0.13
541	0.14
542	0.14
543	0.15
544	0.17
545	0.16
546	0.17
547	0.16
548	0.2
549	0.24
550	0.26
551	0.27
552	0.28
553	0.28
554	0.33
555	0.36
556	0.36
557	0.33
558	0.35
559	0.37
560	0.35
561	0.38
562	0.37
563	0.35
564	0.33
565	0.31
566	0.27
567	0.26
568	0.26
569	0.23
570	0.19
571	0.17
572	0.15

A0A177CA66

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer