FuNGI

A0A177CKN1

Protein Details

Accession

A0A177CKN1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-58	PTAVEAPKPKKSKKSKAIEPAETV	Hydrophilic
65-85	VVTEKPAKKAKKTKEPAPAVE	Hydrophilic
87-111	APESDAKPAKKSKKGKKAAEVEVAV	Hydrophilic
122-147	GAEELKPKKEKKSKKSKKADAVEEPA	Basic
156-179	AVAVEEKKPKKGKKSKKEEAPVVD	Basic
365-387	TRDVWEKRVQRENKRRTGKAKGL	Basic
439-466	TEEVAEKKPKKSSKDKKRKSDVVPEATE	Hydrophilic
468-489	AVVSAPKSKKAKKEVQPETEVI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-26	KKRKGATDAQPKAKKARK
40-50	APKPKKSKKSK
69-104	KPAKKAKKTKEPAPAVEAAPESDAKPAKKSKKGKKA
127-139	KPKKEKKSKKSKK
162-172	KKPKKGKKSKK
374-383	QRENKRRTGK
445-457	KKPKKSSKDKKRK
476-478	KKA

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12307 RRM_NIFK_like

Amino Acid Sequences

MAASDIQSKKRKGATDAQPKAKKARKSDDIAVEAPTAVEAPKPKKSKKSKAIEPAETVTVEETVVVTEKPAKKAKKTKEPAPAVEAAPESDAKPAKKSKKGKKAAEVEVAVTEEDIQDALAGAEELKPKKEKKSKKSKKADAVEEPAAEPVVEEVAVAVEEKKPKKGKKSKKEEAPVVDAEETVAAEGNDAEDEEALDDQTAALLAGFESDRDESDLEKEDEEFDEDALVEAGQEISKKKRRELDQARKDAAPAVIYLGRVPHGFFEPQMKKYFSQFGRVLRLRLSRNKKTGASKHFAFIEFANGEVADIVAKTMHNYLMFGHILQCRVVPSEQVHPELFKGANERFKIDPRNQKERTALARGATRDVWEKRVQRENKRRTGKAKGLLEEFGYEFNAPPVKAVDAVPKKAAAVEDAPAQAQLTAVEADVEPKAEAVVATEEVAEKKPKKSSKDKKRKSDVVPEATEEAVVSAPKSKKAKKEVQPETEVIVEKKRKVSQNGTTTTTTKKTKKVKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.65
3	0.73
4	0.76
5	0.77
6	0.76
7	0.79
8	0.76
9	0.73
10	0.72
11	0.72
12	0.71
13	0.72
14	0.77
15	0.75
16	0.73
17	0.66
18	0.59
19	0.49
20	0.4
21	0.32
22	0.23
23	0.15
24	0.09
25	0.11
26	0.16
27	0.21
28	0.3
29	0.39
30	0.46
31	0.56
32	0.67
33	0.75
34	0.79
35	0.84
36	0.85
37	0.87
38	0.9
39	0.86
40	0.8
41	0.72
42	0.64
43	0.53
44	0.43
45	0.33
46	0.24
47	0.17
48	0.12
49	0.09
50	0.07
51	0.08
52	0.07
53	0.07
54	0.15
55	0.2
56	0.27
57	0.35
58	0.4
59	0.49
60	0.6
61	0.69
62	0.72
63	0.76
64	0.79
65	0.81
66	0.83
67	0.77
68	0.73
69	0.66
70	0.56
71	0.5
72	0.41
73	0.31
74	0.25
75	0.21
76	0.16
77	0.17
78	0.21
79	0.19
80	0.25
81	0.34
82	0.41
83	0.5
84	0.6
85	0.66
86	0.73
87	0.82
88	0.84
89	0.85
90	0.86
91	0.83
92	0.8
93	0.7
94	0.61
95	0.51
96	0.43
97	0.33
98	0.23
99	0.16
100	0.08
101	0.07
102	0.06
103	0.04
104	0.04
105	0.04
106	0.04
107	0.03
108	0.04
109	0.04
110	0.07
111	0.12
112	0.13
113	0.16
114	0.22
115	0.26
116	0.36
117	0.46
118	0.54
119	0.6
120	0.7
121	0.78
122	0.84
123	0.92
124	0.91
125	0.92
126	0.9
127	0.88
128	0.84
129	0.79
130	0.71
131	0.6
132	0.51
133	0.41
134	0.32
135	0.23
136	0.15
137	0.08
138	0.06
139	0.04
140	0.04
141	0.03
142	0.03
143	0.04
144	0.04
145	0.05
146	0.07
147	0.14
148	0.15
149	0.23
150	0.31
151	0.36
152	0.47
153	0.57
154	0.66
155	0.7
156	0.8
157	0.83
158	0.85
159	0.89
160	0.85
161	0.79
162	0.73
163	0.63
164	0.54
165	0.45
166	0.34
167	0.25
168	0.18
169	0.13
170	0.07
171	0.07
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.03
180	0.03
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.02
191	0.02
192	0.02
193	0.03
194	0.03
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.09
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.12
209	0.13
210	0.11
211	0.08
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.06
216	0.05
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.05
222	0.06
223	0.13
224	0.21
225	0.23
226	0.27
227	0.34
228	0.39
229	0.49
230	0.59
231	0.63
232	0.66
233	0.7
234	0.69
235	0.61
236	0.57
237	0.47
238	0.36
239	0.25
240	0.16
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.17
254	0.2
255	0.23
256	0.26
257	0.27
258	0.27
259	0.29
260	0.36
261	0.28
262	0.32
263	0.32
264	0.32
265	0.39
266	0.4
267	0.38
268	0.34
269	0.39
270	0.37
271	0.43
272	0.48
273	0.47
274	0.51
275	0.54
276	0.55
277	0.58
278	0.62
279	0.59
280	0.56
281	0.5
282	0.47
283	0.45
284	0.41
285	0.33
286	0.25
287	0.22
288	0.16
289	0.15
290	0.13
291	0.1
292	0.1
293	0.08
294	0.08
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.04
301	0.05
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.11
307	0.11
308	0.11
309	0.14
310	0.14
311	0.15
312	0.14
313	0.14
314	0.12
315	0.14
316	0.14
317	0.12
318	0.13
319	0.19
320	0.22
321	0.24
322	0.24
323	0.22
324	0.22
325	0.23
326	0.21
327	0.14
328	0.17
329	0.17
330	0.23
331	0.24
332	0.27
333	0.26
334	0.31
335	0.37
336	0.41
337	0.48
338	0.49
339	0.59
340	0.59
341	0.61
342	0.6
343	0.59
344	0.57
345	0.53
346	0.47
347	0.39
348	0.41
349	0.37
350	0.37
351	0.3
352	0.26
353	0.28
354	0.28
355	0.3
356	0.33
357	0.37
358	0.4
359	0.5
360	0.57
361	0.6
362	0.69
363	0.75
364	0.78
365	0.82
366	0.82
367	0.79
368	0.8
369	0.78
370	0.76
371	0.72
372	0.66
373	0.6
374	0.54
375	0.48
376	0.39
377	0.31
378	0.23
379	0.17
380	0.13
381	0.11
382	0.12
383	0.14
384	0.12
385	0.12
386	0.13
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.22
391	0.25
392	0.28
393	0.29
394	0.28
395	0.27
396	0.27
397	0.26
398	0.19
399	0.15
400	0.14
401	0.16
402	0.17
403	0.17
404	0.15
405	0.15
406	0.12
407	0.1
408	0.09
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.08
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.11
429	0.15
430	0.21
431	0.22
432	0.27
433	0.35
434	0.42
435	0.49
436	0.59
437	0.68
438	0.72
439	0.8
440	0.86
441	0.88
442	0.92
443	0.93
444	0.9
445	0.9
446	0.88
447	0.86
448	0.78
449	0.7
450	0.62
451	0.52
452	0.43
453	0.32
454	0.23
455	0.15
456	0.12
457	0.09
458	0.15
459	0.17
460	0.25
461	0.33
462	0.4
463	0.48
464	0.58
465	0.68
466	0.69
467	0.79
468	0.81
469	0.82
470	0.81
471	0.73
472	0.66
473	0.6
474	0.54
475	0.45
476	0.44
477	0.41
478	0.4
479	0.46
480	0.51
481	0.54
482	0.6
483	0.67
484	0.68
485	0.71
486	0.72
487	0.7
488	0.66
489	0.61
490	0.59
491	0.57
492	0.56
493	0.53
494	0.57

A0A177CKN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer