Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162YB29

Protein Details
Accession A0A162YB29    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-223GSKVPPRNSRDRSRSPTRSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-232VPPRNSRDRSRSPTRSEGRNIKRERS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDSTTQMDLDLELDAELERELAADLEAPTTTTTAPEATTDVKPNLADTMLVGDEPVDRFEALPRPTAIFLHGVDDMSTADITAYANSPLLVKVEWINDSSCNLAFKTQEDASQVAQTLLSEPVPALDHRTLVAAKPFENHPLSIRIATDEDVKERGARERSRYYLLHGVEDQPLSEERREARKAHVDRMQKNGGDGRDVFSRLGSKVPPRNSRDRSRSPTRSEGRNIKRERSVEREIPDRLKSRLGLVAKPETVEADEAKKGPIVKDEIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.11
24 0.14
25 0.17
26 0.2
27 0.2
28 0.21
29 0.21
30 0.21
31 0.2
32 0.16
33 0.13
34 0.09
35 0.12
36 0.1
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.12
47 0.19
48 0.18
49 0.21
50 0.21
51 0.22
52 0.23
53 0.23
54 0.21
55 0.17
56 0.16
57 0.15
58 0.15
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.09
64 0.08
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.11
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.16
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.13
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.14
128 0.17
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.13
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.13
142 0.17
143 0.2
144 0.23
145 0.28
146 0.32
147 0.35
148 0.38
149 0.38
150 0.37
151 0.37
152 0.35
153 0.31
154 0.26
155 0.25
156 0.23
157 0.22
158 0.18
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.22
166 0.25
167 0.25
168 0.3
169 0.37
170 0.4
171 0.45
172 0.49
173 0.5
174 0.51
175 0.57
176 0.56
177 0.47
178 0.46
179 0.43
180 0.37
181 0.32
182 0.28
183 0.24
184 0.22
185 0.23
186 0.21
187 0.17
188 0.19
189 0.16
190 0.19
191 0.19
192 0.24
193 0.3
194 0.39
195 0.47
196 0.51
197 0.61
198 0.66
199 0.73
200 0.74
201 0.76
202 0.76
203 0.78
204 0.8
205 0.77
206 0.79
207 0.75
208 0.74
209 0.72
210 0.75
211 0.73
212 0.75
213 0.73
214 0.69
215 0.71
216 0.68
217 0.66
218 0.63
219 0.62
220 0.58
221 0.58
222 0.57
223 0.55
224 0.56
225 0.56
226 0.52
227 0.46
228 0.44
229 0.4
230 0.37
231 0.39
232 0.37
233 0.34
234 0.37
235 0.41
236 0.37
237 0.37
238 0.34
239 0.28
240 0.26
241 0.25
242 0.21
243 0.18
244 0.2
245 0.2
246 0.21
247 0.22
248 0.23
249 0.22
250 0.26