Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162MTM7

Protein Details
Accession A0A162MTM7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-252QDERHPKRPKLDVDDARRPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-258RHPKRPKLDVDDARRPGEKKKKP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPNTVKSLVASCQDILTKHLDVVSEVGCVPYSLMKNSLVHATPQQLYKIEKANPDIAAESDELWLKHCLTYKDIREDYYEHGLYRDPSKWRELYLNRYKETEKKRQLIKQKVKSQYSKIQNEKEKRSIKVLHGVVPTTGKRSYEAARRSTMSKLFQQTRKETEKVASIYQQKRPTVTSAMPMSFHHPPSSTVIKVPKPASQLTRAYQSYQSKYPRLNSPPPPAPLIAPRPHIQDERHPKRPKLDVDDARRPGEKKKKPVAMLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.23
4 0.21
5 0.19
6 0.2
7 0.18
8 0.16
9 0.18
10 0.16
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.12
18 0.14
19 0.14
20 0.16
21 0.19
22 0.2
23 0.21
24 0.26
25 0.21
26 0.22
27 0.23
28 0.26
29 0.26
30 0.27
31 0.28
32 0.26
33 0.27
34 0.29
35 0.33
36 0.32
37 0.34
38 0.35
39 0.37
40 0.34
41 0.33
42 0.3
43 0.24
44 0.22
45 0.18
46 0.15
47 0.12
48 0.13
49 0.11
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.14
54 0.18
55 0.18
56 0.21
57 0.29
58 0.32
59 0.4
60 0.4
61 0.39
62 0.38
63 0.38
64 0.38
65 0.37
66 0.32
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.21
74 0.22
75 0.27
76 0.27
77 0.28
78 0.35
79 0.36
80 0.41
81 0.47
82 0.51
83 0.48
84 0.49
85 0.5
86 0.49
87 0.53
88 0.54
89 0.52
90 0.53
91 0.59
92 0.63
93 0.71
94 0.74
95 0.77
96 0.76
97 0.77
98 0.78
99 0.78
100 0.75
101 0.71
102 0.69
103 0.68
104 0.66
105 0.64
106 0.63
107 0.65
108 0.67
109 0.67
110 0.67
111 0.62
112 0.55
113 0.54
114 0.5
115 0.44
116 0.45
117 0.4
118 0.36
119 0.32
120 0.31
121 0.26
122 0.25
123 0.23
124 0.17
125 0.17
126 0.12
127 0.13
128 0.15
129 0.18
130 0.24
131 0.28
132 0.29
133 0.3
134 0.31
135 0.32
136 0.33
137 0.33
138 0.28
139 0.28
140 0.32
141 0.37
142 0.41
143 0.45
144 0.47
145 0.5
146 0.52
147 0.48
148 0.43
149 0.38
150 0.38
151 0.34
152 0.31
153 0.3
154 0.33
155 0.37
156 0.42
157 0.47
158 0.42
159 0.42
160 0.41
161 0.39
162 0.34
163 0.3
164 0.29
165 0.26
166 0.26
167 0.26
168 0.25
169 0.26
170 0.26
171 0.26
172 0.21
173 0.19
174 0.2
175 0.24
176 0.28
177 0.24
178 0.25
179 0.3
180 0.31
181 0.37
182 0.37
183 0.35
184 0.34
185 0.38
186 0.37
187 0.38
188 0.4
189 0.37
190 0.43
191 0.4
192 0.39
193 0.43
194 0.46
195 0.44
196 0.46
197 0.49
198 0.47
199 0.5
200 0.53
201 0.54
202 0.55
203 0.59
204 0.6
205 0.64
206 0.66
207 0.64
208 0.61
209 0.53
210 0.48
211 0.46
212 0.46
213 0.42
214 0.39
215 0.39
216 0.42
217 0.45
218 0.47
219 0.43
220 0.46
221 0.53
222 0.57
223 0.65
224 0.67
225 0.67
226 0.71
227 0.76
228 0.74
229 0.72
230 0.73
231 0.73
232 0.74
233 0.81
234 0.77
235 0.72
236 0.68
237 0.61
238 0.61
239 0.62
240 0.62
241 0.62
242 0.68
243 0.73