Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168M2D5

Protein Details
Accession A0A168M2D5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-381QYGHKRDVPRRRKDAFGQCVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.833, cyto 8.5, mito_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037796  TAF6  
IPR011442  TAF6_C  
IPR046344  TAF6_C_sf  
IPR004823  TAF_TATA-bd_Histone-like_dom  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02969  TAF  
PF07571  TAF6_C  
CDD cd08050  TAF6C  
Amino Acid Sequences MSVFPKETIKNVGESLGITNLKDEVATALAQDVEYRVHELIQEASKFMRHSKRTKLSVDDINAALRVKNVEPLYGYTCGEAPKFKKTTVNSNDIYFDDDEEVDFDSVLNKPLPKIPLDVTFTAHWLAIEGVQPAIPQNPTPSDAKAELLSKRAKSHASSNGITTDQVNVKPLVKHVLSKELQMYFERITEAVLSEDERLQSQAFESLRSDPGLHQLLPYFVQHIHKKVTQNHKNLDVLEAMLSMAYSLLNNKHLFVEPYLHQLVPPILSCLVGRTICENPQTQDHWSTRQRAATMIATICHQYGKAYHTLQPRITKTLLRAFLDPARPLTTQYGAIIGLDHIGTEVTRVLIAPNIKIILLVQYGHKRDVPRRRKDAFGQCVIIDLLNKRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.22
4 0.21
5 0.18
6 0.18
7 0.17
8 0.16
9 0.15
10 0.13
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.13
27 0.17
28 0.21
29 0.21
30 0.19
31 0.2
32 0.22
33 0.23
34 0.29
35 0.35
36 0.37
37 0.44
38 0.54
39 0.62
40 0.67
41 0.71
42 0.7
43 0.67
44 0.67
45 0.63
46 0.56
47 0.47
48 0.41
49 0.37
50 0.31
51 0.24
52 0.18
53 0.17
54 0.13
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.19
59 0.22
60 0.24
61 0.24
62 0.23
63 0.18
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.22
68 0.21
69 0.28
70 0.3
71 0.31
72 0.37
73 0.38
74 0.48
75 0.49
76 0.54
77 0.47
78 0.46
79 0.47
80 0.4
81 0.4
82 0.29
83 0.23
84 0.17
85 0.15
86 0.13
87 0.11
88 0.12
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.11
98 0.16
99 0.18
100 0.18
101 0.2
102 0.2
103 0.25
104 0.29
105 0.29
106 0.27
107 0.26
108 0.25
109 0.23
110 0.21
111 0.14
112 0.1
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.1
125 0.11
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.17
133 0.19
134 0.18
135 0.22
136 0.25
137 0.23
138 0.25
139 0.26
140 0.27
141 0.25
142 0.31
143 0.34
144 0.36
145 0.35
146 0.34
147 0.33
148 0.32
149 0.3
150 0.23
151 0.18
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.17
160 0.15
161 0.18
162 0.18
163 0.25
164 0.24
165 0.25
166 0.27
167 0.23
168 0.24
169 0.22
170 0.23
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.1
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.1
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.1
207 0.1
208 0.16
209 0.17
210 0.2
211 0.23
212 0.26
213 0.32
214 0.38
215 0.48
216 0.51
217 0.56
218 0.57
219 0.57
220 0.55
221 0.5
222 0.43
223 0.32
224 0.24
225 0.17
226 0.13
227 0.08
228 0.06
229 0.06
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.05
235 0.06
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.18
244 0.15
245 0.2
246 0.21
247 0.2
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.15
252 0.14
253 0.11
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.14
262 0.16
263 0.18
264 0.21
265 0.22
266 0.2
267 0.25
268 0.27
269 0.26
270 0.31
271 0.31
272 0.36
273 0.39
274 0.44
275 0.43
276 0.44
277 0.41
278 0.36
279 0.37
280 0.31
281 0.29
282 0.24
283 0.2
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.12
289 0.09
290 0.11
291 0.14
292 0.19
293 0.21
294 0.26
295 0.33
296 0.39
297 0.43
298 0.49
299 0.48
300 0.48
301 0.47
302 0.45
303 0.42
304 0.45
305 0.46
306 0.4
307 0.39
308 0.38
309 0.42
310 0.44
311 0.4
312 0.34
313 0.32
314 0.3
315 0.31
316 0.31
317 0.27
318 0.23
319 0.22
320 0.2
321 0.16
322 0.16
323 0.14
324 0.1
325 0.09
326 0.07
327 0.07
328 0.05
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.15
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.18
349 0.26
350 0.29
351 0.31
352 0.35
353 0.37
354 0.46
355 0.56
356 0.6
357 0.63
358 0.7
359 0.72
360 0.76
361 0.8
362 0.81
363 0.79
364 0.76
365 0.68
366 0.58
367 0.56
368 0.48
369 0.39
370 0.32