FuNGI

A0A162RJQ0

Protein Details

Accession

A0A162RJQ0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-44	IENDKNINEKKRKYQHVQLESQY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022042 snRNA-activating_su3
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF12251 SNAPC3

Amino Acid Sequences

MKVNPASLKTEFNKLFELQASIENDKNINEKKRKYQHVQLESQYNTNTLSEIFQDPDLLARISEDAHKIMQTKTLRPPRVREASDIITSRKPQAKDVTTTRVIEEDLATHYSAIEKNLNSEEYVNPLAPKQRRYIAHDEHGESASQPQTPTQPFPDPISMSLESLATQNAGNSNNNELTHMLDETSRLIRESPLKTVRSNHLYTLLPRQSDINAYIYVKEDYNPPANKEAGSPTDDTLITVTIFNPDNPNVKFQEIELLGSQTLSNLRDAIYCQSDFTLNRDHKNQDPNEKIVNTTKTKLSPSVIYMDHVFYIDTRNKNDIPADYYENWIDAWLTKKQVNRDVYRYETKSMEKAKLENMTLELHKPFAFIHQDTCEHMMLIDDVRLISSSEFGSKRDFPRTTRNLRYDRFKCSMCSVYPATKITHEDIVSGFSPCYFCDICFESFHHGDTNVKVSEYSGTPGRETKSARLSKSHKHCHN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.39
3	0.33
4	0.33
5	0.24
6	0.27
7	0.3
8	0.29
9	0.3
10	0.29
11	0.28
12	0.27
13	0.33
14	0.35
15	0.41
16	0.47
17	0.52
18	0.61
19	0.7
20	0.79
21	0.79
22	0.82
23	0.82
24	0.82
25	0.83
26	0.78
27	0.77
28	0.69
29	0.64
30	0.54
31	0.45
32	0.36
33	0.29
34	0.23
35	0.15
36	0.14
37	0.14
38	0.15
39	0.16
40	0.15
41	0.15
42	0.14
43	0.16
44	0.16
45	0.13
46	0.11
47	0.1
48	0.11
49	0.11
50	0.15
51	0.15
52	0.14
53	0.15
54	0.17
55	0.19
56	0.19
57	0.26
58	0.27
59	0.31
60	0.4
61	0.49
62	0.55
63	0.58
64	0.64
65	0.66
66	0.71
67	0.68
68	0.62
69	0.58
70	0.55
71	0.55
72	0.51
73	0.45
74	0.4
75	0.4
76	0.42
77	0.42
78	0.38
79	0.39
80	0.45
81	0.47
82	0.49
83	0.53
84	0.54
85	0.52
86	0.52
87	0.47
88	0.38
89	0.33
90	0.27
91	0.21
92	0.15
93	0.13
94	0.13
95	0.13
96	0.11
97	0.11
98	0.12
99	0.13
100	0.14
101	0.16
102	0.14
103	0.17
104	0.2
105	0.2
106	0.19
107	0.2
108	0.17
109	0.18
110	0.19
111	0.17
112	0.15
113	0.16
114	0.24
115	0.26
116	0.29
117	0.28
118	0.34
119	0.38
120	0.45
121	0.53
122	0.51
123	0.55
124	0.56
125	0.54
126	0.49
127	0.46
128	0.38
129	0.29
130	0.26
131	0.2
132	0.16
133	0.14
134	0.13
135	0.18
136	0.2
137	0.23
138	0.24
139	0.26
140	0.27
141	0.3
142	0.33
143	0.28
144	0.27
145	0.3
146	0.26
147	0.22
148	0.2
149	0.17
150	0.14
151	0.13
152	0.12
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.09
157	0.1
158	0.11
159	0.12
160	0.15
161	0.17
162	0.17
163	0.17
164	0.15
165	0.15
166	0.14
167	0.13
168	0.1
169	0.08
170	0.09
171	0.1
172	0.11
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.11
177	0.18
178	0.19
179	0.25
180	0.29
181	0.31
182	0.33
183	0.37
184	0.4
185	0.4
186	0.39
187	0.33
188	0.31
189	0.3
190	0.3
191	0.35
192	0.32
193	0.25
194	0.24
195	0.24
196	0.21
197	0.21
198	0.21
199	0.14
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.14
204	0.14
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.13
209	0.2
210	0.2
211	0.21
212	0.22
213	0.23
214	0.22
215	0.21
216	0.21
217	0.16
218	0.17
219	0.16
220	0.14
221	0.15
222	0.15
223	0.14
224	0.11
225	0.1
226	0.08
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.08
232	0.1
233	0.11
234	0.15
235	0.16
236	0.18
237	0.17
238	0.18
239	0.17
240	0.15
241	0.2
242	0.15
243	0.16
244	0.13
245	0.13
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.06
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.09
257	0.11
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.12
262	0.14
263	0.13
264	0.15
265	0.21
266	0.21
267	0.24
268	0.27
269	0.3
270	0.33
271	0.41
272	0.42
273	0.43
274	0.44
275	0.45
276	0.46
277	0.43
278	0.4
279	0.37
280	0.39
281	0.33
282	0.31
283	0.31
284	0.29
285	0.3
286	0.31
287	0.27
288	0.23
289	0.22
290	0.24
291	0.21
292	0.2
293	0.19
294	0.18
295	0.16
296	0.14
297	0.12
298	0.08
299	0.13
300	0.17
301	0.19
302	0.21
303	0.25
304	0.25
305	0.26
306	0.28
307	0.25
308	0.23
309	0.24
310	0.27
311	0.23
312	0.25
313	0.24
314	0.22
315	0.2
316	0.16
317	0.13
318	0.09
319	0.12
320	0.12
321	0.15
322	0.18
323	0.21
324	0.27
325	0.35
326	0.41
327	0.43
328	0.46
329	0.48
330	0.51
331	0.56
332	0.53
333	0.48
334	0.44
335	0.41
336	0.43
337	0.43
338	0.42
339	0.36
340	0.36
341	0.38
342	0.39
343	0.38
344	0.32
345	0.29
346	0.26
347	0.25
348	0.26
349	0.21
350	0.18
351	0.17
352	0.17
353	0.15
354	0.17
355	0.21
356	0.19
357	0.23
358	0.25
359	0.26
360	0.28
361	0.31
362	0.26
363	0.2
364	0.19
365	0.16
366	0.13
367	0.12
368	0.1
369	0.08
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.14
378	0.15
379	0.16
380	0.21
381	0.26
382	0.31
383	0.38
384	0.41
385	0.4
386	0.5
387	0.58
388	0.62
389	0.66
390	0.71
391	0.7
392	0.73
393	0.79
394	0.73
395	0.72
396	0.68
397	0.6
398	0.54
399	0.52
400	0.52
401	0.42
402	0.43
403	0.4
404	0.4
405	0.42
406	0.41
407	0.37
408	0.34
409	0.37
410	0.34
411	0.35
412	0.29
413	0.26
414	0.25
415	0.26
416	0.24
417	0.21
418	0.18
419	0.14
420	0.14
421	0.13
422	0.18
423	0.15
424	0.14
425	0.19
426	0.23
427	0.23
428	0.25
429	0.27
430	0.29
431	0.3
432	0.31
433	0.28
434	0.25
435	0.26
436	0.26
437	0.3
438	0.23
439	0.23
440	0.21
441	0.2
442	0.23
443	0.21
444	0.22
445	0.22
446	0.23
447	0.25
448	0.29
449	0.31
450	0.34
451	0.36
452	0.4
453	0.45
454	0.51
455	0.52
456	0.57
457	0.61
458	0.65
459	0.72

A0A162RJQ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer