Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168HND9

Protein Details
Accession A0A168HND9    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-163KTEYSKAKYIERKKKKFMKTFTPVRPTHydrophilic
415-438AGDGNDRRSKKKKVSHAAAKTSAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-152RKKKK
421-427RRSKKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MTEVTKYEDNDLIQAQQTVIIEMPSGNAKIISLKPDTMVNLGKFGTFQSDHLIGKPFGLSYEIISKQGEIRPVGHVSKNNNIEETAANNQMIIDDASNQTLTHEQVLALKEKGLQGELATEEIIKMMVDSHSGFSKKTEYSKAKYIERKKKKFMKTFTPVRPTISTINDYFFSKNPDKIKHMRIDTLSQLLSMANVHANAKLLVVDDTQGLIVSSCLERMGGFGQLVAIHEGDHHNYDILRYMNFSKAVQSVFHPVPMTMIDQSIPNDPFEILTEEQEAALSENDTISYGRRKAAWEARVKCRDALHQGNFDGLIISSSFQPETVIKELLQYVNGSRPIVVYSFNKEVLLQTAYWMRRSSDFLNAELTESSMREYQVLPGRMHPNMNMSCGGGYLLSTLRVIDCPFDPSLVKKSAGDGNDRRSKKKKVSHAAAKTSAEETATAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.18
3 0.17
4 0.17
5 0.15
6 0.14
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.12
13 0.11
14 0.1
15 0.11
16 0.15
17 0.18
18 0.22
19 0.22
20 0.22
21 0.23
22 0.26
23 0.27
24 0.26
25 0.3
26 0.26
27 0.25
28 0.25
29 0.24
30 0.21
31 0.2
32 0.22
33 0.17
34 0.17
35 0.2
36 0.23
37 0.24
38 0.26
39 0.3
40 0.24
41 0.24
42 0.24
43 0.18
44 0.15
45 0.16
46 0.14
47 0.12
48 0.19
49 0.2
50 0.2
51 0.21
52 0.21
53 0.23
54 0.26
55 0.28
56 0.22
57 0.22
58 0.25
59 0.29
60 0.32
61 0.33
62 0.35
63 0.35
64 0.42
65 0.47
66 0.44
67 0.4
68 0.37
69 0.34
70 0.3
71 0.29
72 0.25
73 0.2
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.15
78 0.15
79 0.12
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.14
93 0.16
94 0.18
95 0.17
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.15
101 0.13
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.05
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.18
123 0.19
124 0.23
125 0.31
126 0.33
127 0.37
128 0.45
129 0.5
130 0.53
131 0.6
132 0.67
133 0.68
134 0.73
135 0.77
136 0.79
137 0.84
138 0.86
139 0.86
140 0.83
141 0.82
142 0.8
143 0.82
144 0.81
145 0.78
146 0.69
147 0.64
148 0.58
149 0.5
150 0.45
151 0.38
152 0.32
153 0.25
154 0.26
155 0.23
156 0.23
157 0.22
158 0.19
159 0.22
160 0.22
161 0.26
162 0.29
163 0.32
164 0.37
165 0.42
166 0.48
167 0.48
168 0.48
169 0.47
170 0.44
171 0.42
172 0.38
173 0.34
174 0.27
175 0.2
176 0.18
177 0.14
178 0.12
179 0.09
180 0.07
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.17
239 0.16
240 0.17
241 0.16
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.12
258 0.14
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.16
279 0.18
280 0.24
281 0.32
282 0.38
283 0.42
284 0.48
285 0.56
286 0.61
287 0.61
288 0.56
289 0.51
290 0.48
291 0.46
292 0.49
293 0.44
294 0.41
295 0.4
296 0.38
297 0.36
298 0.3
299 0.23
300 0.14
301 0.1
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.13
311 0.15
312 0.16
313 0.14
314 0.16
315 0.19
316 0.18
317 0.18
318 0.15
319 0.13
320 0.17
321 0.19
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.16
326 0.15
327 0.17
328 0.15
329 0.19
330 0.22
331 0.22
332 0.22
333 0.21
334 0.21
335 0.21
336 0.2
337 0.15
338 0.13
339 0.2
340 0.21
341 0.23
342 0.24
343 0.22
344 0.23
345 0.28
346 0.29
347 0.31
348 0.31
349 0.3
350 0.33
351 0.31
352 0.3
353 0.25
354 0.24
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.19
363 0.26
364 0.3
365 0.29
366 0.34
367 0.38
368 0.39
369 0.4
370 0.35
371 0.35
372 0.33
373 0.34
374 0.28
375 0.25
376 0.22
377 0.21
378 0.2
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.11
388 0.12
389 0.13
390 0.13
391 0.16
392 0.16
393 0.18
394 0.18
395 0.2
396 0.26
397 0.28
398 0.28
399 0.25
400 0.28
401 0.33
402 0.34
403 0.4
404 0.4
405 0.46
406 0.54
407 0.58
408 0.62
409 0.65
410 0.71
411 0.72
412 0.75
413 0.76
414 0.78
415 0.85
416 0.87
417 0.89
418 0.88
419 0.85
420 0.78
421 0.7
422 0.6
423 0.5
424 0.39