Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168LVV1

Protein Details
Accession A0A168LVV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-39YSQLLAKKRQLHSKKSQAPKRGEKANDHydrophilic
238-260DWDVYKPRPSWKKKDPGEPDFRVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-33HSKKSQAPKR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MSDAEDDEVLIDYSQLLAKKRQLHSKKSQAPKRGEKANDQQQLAKSRQALFECIAHTVPMPKNASQGQLSTSHPYYTTITKSKGTHLHSMGFSHQGAITLFPEEAAFLVARNALTVTQHDVDPVGFEDYCQLMCECCDGWITFDKYQVYAYLKRLGYIVVRSRKLATITAQQTAQKEQPSMFQLLLDTITHWIQPLQNRPLVWDYKCRSYPHMYSTLQIIPSTPWYRPFYTSLCPTFDWDVYKPRPSWKKKDPGEPDFRVVVRSIHEAMPTLYEQKQLFGQLIGTSNANYKPALKRTELGLLAPTFVMALVGDAEGITFLRLAGDGVQDVSNVKAFSQKHGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.14
4 0.19
5 0.26
6 0.35
7 0.42
8 0.52
9 0.58
10 0.65
11 0.73
12 0.78
13 0.82
14 0.84
15 0.86
16 0.85
17 0.86
18 0.87
19 0.84
20 0.82
21 0.77
22 0.75
23 0.77
24 0.78
25 0.75
26 0.67
27 0.64
28 0.61
29 0.63
30 0.56
31 0.5
32 0.44
33 0.4
34 0.44
35 0.4
36 0.37
37 0.33
38 0.33
39 0.3
40 0.27
41 0.24
42 0.19
43 0.18
44 0.22
45 0.22
46 0.26
47 0.28
48 0.27
49 0.31
50 0.33
51 0.36
52 0.3
53 0.29
54 0.24
55 0.24
56 0.26
57 0.27
58 0.26
59 0.23
60 0.22
61 0.23
62 0.23
63 0.24
64 0.27
65 0.27
66 0.28
67 0.33
68 0.34
69 0.38
70 0.42
71 0.43
72 0.44
73 0.42
74 0.44
75 0.4
76 0.4
77 0.36
78 0.32
79 0.27
80 0.2
81 0.18
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.09
127 0.14
128 0.18
129 0.17
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.19
137 0.2
138 0.25
139 0.24
140 0.24
141 0.24
142 0.22
143 0.2
144 0.21
145 0.26
146 0.25
147 0.26
148 0.27
149 0.27
150 0.28
151 0.28
152 0.25
153 0.2
154 0.21
155 0.23
156 0.23
157 0.23
158 0.24
159 0.23
160 0.24
161 0.25
162 0.18
163 0.16
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.18
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.12
173 0.08
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.13
182 0.2
183 0.22
184 0.24
185 0.24
186 0.26
187 0.29
188 0.31
189 0.28
190 0.3
191 0.3
192 0.35
193 0.39
194 0.39
195 0.39
196 0.41
197 0.43
198 0.39
199 0.44
200 0.37
201 0.33
202 0.35
203 0.33
204 0.28
205 0.24
206 0.2
207 0.13
208 0.19
209 0.2
210 0.17
211 0.21
212 0.24
213 0.26
214 0.29
215 0.31
216 0.28
217 0.31
218 0.37
219 0.33
220 0.32
221 0.31
222 0.31
223 0.3
224 0.28
225 0.27
226 0.23
227 0.29
228 0.3
229 0.35
230 0.33
231 0.4
232 0.49
233 0.53
234 0.61
235 0.63
236 0.69
237 0.71
238 0.8
239 0.81
240 0.8
241 0.81
242 0.75
243 0.69
244 0.62
245 0.55
246 0.46
247 0.37
248 0.29
249 0.22
250 0.22
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.19
257 0.17
258 0.17
259 0.16
260 0.2
261 0.19
262 0.2
263 0.21
264 0.19
265 0.19
266 0.16
267 0.16
268 0.13
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.15
277 0.18
278 0.24
279 0.31
280 0.35
281 0.34
282 0.35
283 0.37
284 0.44
285 0.4
286 0.34
287 0.32
288 0.28
289 0.26
290 0.23
291 0.2
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.1
314 0.11
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.17
322 0.18