Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162TD53

Protein Details
Accession A0A162TD53    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-43SPGNHNSKVVKAKKKPLSHKKSYPPGQCTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-33KAKKKPLSHK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MELQQLPTPAIAVSPGNHNSKVVKAKKKPLSHKKSYPPGQCTLPIRVATHKPVRPPRHLECFNCKITKTPLWRRTPDRLQTLCNACGLYYKQYNQHRPIHIRHKPTSVNTTTSTPALLRPPSYQQEKWIAPIEFEQQHPQSPSPSSSPRSEQHDDIECINCQQTNTPLWRKNENGDPLCNACGLYVKLNHRNRPVEMRKSTIQRRRRDWASSCDAASQQQPSLSKSDSMAPFLTTFPSAEVSDMNKAEIQDYLGLLEHKCDLLRHVLDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.22
3 0.26
4 0.27
5 0.28
6 0.28
7 0.34
8 0.43
9 0.45
10 0.51
11 0.55
12 0.65
13 0.73
14 0.81
15 0.85
16 0.86
17 0.87
18 0.87
19 0.88
20 0.88
21 0.89
22 0.89
23 0.87
24 0.81
25 0.76
26 0.69
27 0.66
28 0.6
29 0.54
30 0.5
31 0.43
32 0.39
33 0.41
34 0.41
35 0.43
36 0.48
37 0.46
38 0.5
39 0.58
40 0.63
41 0.66
42 0.69
43 0.68
44 0.7
45 0.74
46 0.7
47 0.69
48 0.69
49 0.66
50 0.61
51 0.54
52 0.47
53 0.47
54 0.48
55 0.49
56 0.53
57 0.56
58 0.62
59 0.68
60 0.71
61 0.74
62 0.76
63 0.73
64 0.72
65 0.65
66 0.59
67 0.6
68 0.58
69 0.49
70 0.41
71 0.33
72 0.24
73 0.24
74 0.23
75 0.21
76 0.2
77 0.21
78 0.28
79 0.36
80 0.44
81 0.48
82 0.54
83 0.55
84 0.58
85 0.63
86 0.66
87 0.65
88 0.65
89 0.61
90 0.6
91 0.57
92 0.55
93 0.54
94 0.46
95 0.42
96 0.37
97 0.36
98 0.31
99 0.27
100 0.24
101 0.17
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.19
108 0.23
109 0.29
110 0.27
111 0.28
112 0.33
113 0.32
114 0.33
115 0.33
116 0.28
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.2
121 0.2
122 0.21
123 0.16
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.21
132 0.22
133 0.23
134 0.27
135 0.29
136 0.35
137 0.36
138 0.34
139 0.33
140 0.35
141 0.34
142 0.31
143 0.3
144 0.22
145 0.2
146 0.19
147 0.16
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.2
153 0.27
154 0.32
155 0.35
156 0.4
157 0.4
158 0.42
159 0.46
160 0.48
161 0.43
162 0.39
163 0.38
164 0.35
165 0.34
166 0.3
167 0.22
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.17
173 0.23
174 0.32
175 0.39
176 0.45
177 0.49
178 0.52
179 0.52
180 0.58
181 0.6
182 0.6
183 0.57
184 0.57
185 0.56
186 0.61
187 0.67
188 0.66
189 0.66
190 0.65
191 0.69
192 0.72
193 0.71
194 0.71
195 0.67
196 0.66
197 0.65
198 0.59
199 0.52
200 0.46
201 0.41
202 0.35
203 0.32
204 0.26
205 0.2
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.24
210 0.23
211 0.22
212 0.21
213 0.27
214 0.25
215 0.27
216 0.26
217 0.24
218 0.23
219 0.22
220 0.23
221 0.16
222 0.15
223 0.13
224 0.15
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.16
229 0.2
230 0.2
231 0.21
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.18
236 0.17
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.14
242 0.13
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.15
249 0.21