Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162R8C7

Protein Details
Accession A0A162R8C7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
534-555LKLATRYFHKHKKEQQEQQNALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11, cyto 4, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005378  Vps35  
IPR042491  Vps35_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences TVSDQQAQYLKEALQVVRIQSKLMRQCLDKQRLMDGIKHCSNMLGELRTSLLSPKSYYELYISIFDAMRHLIDYLLEAHQAGKHHLGDLYELVQYASSIVPRLYLMATVGSIYLSVDDAPPVAEVMSDMMEMTRGVQHPIRGLFLRHYLGGMTRDFLPHHVDHLSATIQFILTNFAEMNKLWVRLQHMGHTRDRAKRESERKELGTLVGTNLVRLSQLEGVDLEMYQTDILPGILSQVISCHDVMAQEYLMEVVIQIFPDEFHIHTLKPFLATTAQLHANVNIKMIIMALLDRLATYSKDEQANMDIQQEEKQESNALFLMFWNEIMELVKSRRELPVQDQTSLFLSLANFSISCYPDRLDYMDQIFHFTKESIFSQYAPELHTKQSEQNVLQLLLLPAQTWDVLTLITTLKHYQPLLAIQPYSTRRTVGLAILDNILDKETRIDQPEQVYQILEICHVLIKDHKNTFVSQQLYQYEDEDDRDEQGWVARLVHLFYSEDEDTQFLLLSAARQQLENGDQNRIKTIFPSLIVSSLKLATRYFHKHKKEQQEQQNALATEQEKQNTPWSKKMTTLYHFIHQIIMVFCRQCENTEAHTVQFFLMAGQNANYCGFEETAFELYLDAFRVYEESVSHSRAQFNAIVYSIGSLLNTSPRFQEQYFNTLSTKLTLYSTKLLKKPDQSRAVYLSSHLWTQGETPSRVIECLQKSLKIADSCMDAATNELLFLELLNQYMYYFERGQSLVTASYLNGLMDLISSRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.3
4 0.34
5 0.33
6 0.31
7 0.3
8 0.39
9 0.41
10 0.45
11 0.46
12 0.43
13 0.53
14 0.62
15 0.68
16 0.64
17 0.58
18 0.56
19 0.58
20 0.57
21 0.54
22 0.48
23 0.48
24 0.48
25 0.47
26 0.41
27 0.36
28 0.34
29 0.32
30 0.32
31 0.25
32 0.22
33 0.22
34 0.23
35 0.21
36 0.21
37 0.2
38 0.19
39 0.18
40 0.19
41 0.21
42 0.24
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.22
47 0.22
48 0.23
49 0.21
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.17
54 0.15
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.17
69 0.19
70 0.18
71 0.19
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.2
76 0.19
77 0.14
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.1
121 0.1
122 0.14
123 0.16
124 0.18
125 0.22
126 0.23
127 0.25
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.26
132 0.26
133 0.22
134 0.21
135 0.18
136 0.2
137 0.21
138 0.18
139 0.15
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.2
145 0.17
146 0.19
147 0.18
148 0.17
149 0.16
150 0.18
151 0.17
152 0.12
153 0.12
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.23
171 0.27
172 0.29
173 0.31
174 0.37
175 0.4
176 0.43
177 0.48
178 0.5
179 0.52
180 0.55
181 0.51
182 0.51
183 0.56
184 0.62
185 0.63
186 0.65
187 0.64
188 0.62
189 0.6
190 0.54
191 0.45
192 0.37
193 0.29
194 0.21
195 0.2
196 0.18
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.08
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.07
247 0.08
248 0.07
249 0.1
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.12
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.12
261 0.14
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.17
266 0.19
267 0.18
268 0.17
269 0.13
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.08
284 0.1
285 0.14
286 0.16
287 0.16
288 0.16
289 0.18
290 0.19
291 0.17
292 0.16
293 0.13
294 0.12
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.1
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.08
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.14
321 0.15
322 0.17
323 0.21
324 0.3
325 0.3
326 0.3
327 0.29
328 0.28
329 0.27
330 0.26
331 0.2
332 0.11
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.06
338 0.06
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.13
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.15
351 0.14
352 0.18
353 0.17
354 0.15
355 0.15
356 0.13
357 0.12
358 0.11
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.14
365 0.14
366 0.14
367 0.15
368 0.13
369 0.14
370 0.15
371 0.15
372 0.17
373 0.2
374 0.22
375 0.19
376 0.21
377 0.21
378 0.2
379 0.18
380 0.16
381 0.13
382 0.1
383 0.1
384 0.07
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.14
405 0.14
406 0.13
407 0.11
408 0.17
409 0.19
410 0.21
411 0.2
412 0.18
413 0.17
414 0.18
415 0.19
416 0.16
417 0.15
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.11
423 0.1
424 0.09
425 0.06
426 0.05
427 0.06
428 0.08
429 0.1
430 0.14
431 0.15
432 0.17
433 0.2
434 0.22
435 0.23
436 0.2
437 0.18
438 0.15
439 0.15
440 0.13
441 0.1
442 0.08
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.11
448 0.15
449 0.21
450 0.23
451 0.25
452 0.25
453 0.26
454 0.29
455 0.3
456 0.28
457 0.23
458 0.26
459 0.25
460 0.26
461 0.25
462 0.23
463 0.19
464 0.17
465 0.16
466 0.14
467 0.14
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.1
472 0.11
473 0.12
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.09
482 0.09
483 0.14
484 0.13
485 0.13
486 0.12
487 0.13
488 0.12
489 0.11
490 0.11
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.08
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.12
500 0.13
501 0.18
502 0.23
503 0.22
504 0.26
505 0.27
506 0.27
507 0.31
508 0.3
509 0.25
510 0.2
511 0.22
512 0.17
513 0.16
514 0.19
515 0.16
516 0.18
517 0.18
518 0.18
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.19
526 0.28
527 0.35
528 0.42
529 0.5
530 0.58
531 0.66
532 0.76
533 0.79
534 0.81
535 0.82
536 0.84
537 0.79
538 0.73
539 0.7
540 0.59
541 0.49
542 0.42
543 0.32
544 0.25
545 0.26
546 0.23
547 0.19
548 0.2
549 0.29
550 0.34
551 0.37
552 0.41
553 0.44
554 0.44
555 0.47
556 0.53
557 0.52
558 0.46
559 0.51
560 0.46
561 0.45
562 0.45
563 0.41
564 0.35
565 0.27
566 0.26
567 0.2
568 0.18
569 0.16
570 0.15
571 0.14
572 0.17
573 0.17
574 0.16
575 0.17
576 0.2
577 0.21
578 0.28
579 0.29
580 0.27
581 0.27
582 0.26
583 0.23
584 0.19
585 0.15
586 0.09
587 0.11
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.11
592 0.11
593 0.12
594 0.11
595 0.09
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.11
600 0.12
601 0.14
602 0.14
603 0.13
604 0.11
605 0.11
606 0.12
607 0.11
608 0.09
609 0.07
610 0.07
611 0.08
612 0.08
613 0.09
614 0.08
615 0.13
616 0.16
617 0.2
618 0.23
619 0.24
620 0.25
621 0.25
622 0.28
623 0.25
624 0.23
625 0.22
626 0.19
627 0.18
628 0.15
629 0.16
630 0.13
631 0.1
632 0.08
633 0.07
634 0.07
635 0.14
636 0.15
637 0.15
638 0.17
639 0.21
640 0.25
641 0.25
642 0.33
643 0.29
644 0.35
645 0.36
646 0.36
647 0.34
648 0.31
649 0.31
650 0.25
651 0.23
652 0.17
653 0.17
654 0.17
655 0.2
656 0.26
657 0.32
658 0.37
659 0.41
660 0.46
661 0.5
662 0.58
663 0.63
664 0.67
665 0.69
666 0.65
667 0.67
668 0.65
669 0.61
670 0.52
671 0.44
672 0.39
673 0.32
674 0.28
675 0.24
676 0.19
677 0.17
678 0.18
679 0.23
680 0.24
681 0.24
682 0.24
683 0.27
684 0.28
685 0.28
686 0.28
687 0.29
688 0.26
689 0.33
690 0.35
691 0.34
692 0.35
693 0.37
694 0.43
695 0.36
696 0.34
697 0.28
698 0.29
699 0.27
700 0.26
701 0.23
702 0.16
703 0.16
704 0.16
705 0.14
706 0.1
707 0.09
708 0.09
709 0.08
710 0.08
711 0.09
712 0.07
713 0.08
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.1
718 0.11
719 0.14
720 0.15
721 0.15
722 0.19
723 0.19
724 0.2
725 0.2
726 0.21
727 0.17
728 0.16
729 0.16
730 0.12
731 0.15
732 0.14
733 0.12
734 0.1
735 0.09
736 0.08
737 0.08