Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4KP73

Protein Details
Accession J4KP73    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-28APTGQTSSSKRKRSAPAEKITKRQRATHydrophilic
246-266HKPEKKSHYLRQPNQHKKQGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-16RKRSA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, plas 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030692  C:Noc4p-Nop14p complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MAPTGQTSSSKRKRSAPAEKITKRQRATSSEDEEDPNAEILLLEQGILESKKNYNNIAVLLRKAADFTPGNPEAMLSTVALCRIFMRLLAQGSLVSKKSFSEKEQVVVGWLRDQFGQFKNVLLDLLGEDDVAITALTLCMRTLKAEGEFLRDESVYAFPRDFLGKVVKNIIASENDEVRKMYIEEFAEQYDDIRYYTFASVASGIKDFADDQHKLKSRLFESAFALLSVLDGVPSSADELEDFYVHKPEKKSHYLRQPNQHKKQGQEAWLALMNIVETNDQRKRLLALIADVIAPWFATPEMLSDFLTSCYDASGSIALLALSGVFFLIRERNLDYPSFYTKLYSLLNSQILHSKYRARFFRLLDTFLGSTHLPVALVASFLKRLARLSLNAPPSAAAFVVPWIYNMLKKHPLCTFMLHRETKDEEVKKELREHGMEDPFLADESDPMKTQAIESSFWELVQLQSHYHPNVATIAKIVAEQFTKHSYNMEDFLDHSYASLLDAEMDKDVKKAPVVEFHIPKRVFLPQDDAAGTPDSLLVKLWDFQTVEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.81
3 0.8
4 0.81
5 0.84
6 0.86
7 0.87
8 0.87
9 0.86
10 0.78
11 0.75
12 0.72
13 0.67
14 0.69
15 0.68
16 0.65
17 0.6
18 0.6
19 0.54
20 0.48
21 0.43
22 0.35
23 0.26
24 0.19
25 0.14
26 0.11
27 0.09
28 0.1
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.17
38 0.23
39 0.26
40 0.28
41 0.28
42 0.3
43 0.32
44 0.36
45 0.35
46 0.31
47 0.3
48 0.29
49 0.25
50 0.24
51 0.21
52 0.21
53 0.19
54 0.19
55 0.26
56 0.26
57 0.26
58 0.25
59 0.24
60 0.19
61 0.19
62 0.18
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.12
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.17
80 0.2
81 0.19
82 0.16
83 0.15
84 0.16
85 0.22
86 0.25
87 0.26
88 0.31
89 0.32
90 0.33
91 0.35
92 0.34
93 0.3
94 0.29
95 0.26
96 0.21
97 0.2
98 0.19
99 0.18
100 0.19
101 0.21
102 0.21
103 0.24
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.18
109 0.13
110 0.12
111 0.08
112 0.1
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.12
132 0.17
133 0.18
134 0.22
135 0.22
136 0.22
137 0.22
138 0.19
139 0.18
140 0.15
141 0.17
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.12
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.19
151 0.2
152 0.22
153 0.25
154 0.25
155 0.24
156 0.24
157 0.24
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.2
162 0.19
163 0.2
164 0.19
165 0.17
166 0.17
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.24
200 0.28
201 0.3
202 0.32
203 0.35
204 0.31
205 0.37
206 0.37
207 0.32
208 0.29
209 0.3
210 0.28
211 0.22
212 0.2
213 0.12
214 0.11
215 0.08
216 0.06
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.11
232 0.11
233 0.15
234 0.16
235 0.21
236 0.27
237 0.36
238 0.42
239 0.46
240 0.56
241 0.63
242 0.68
243 0.73
244 0.78
245 0.79
246 0.81
247 0.82
248 0.74
249 0.66
250 0.68
251 0.63
252 0.55
253 0.48
254 0.4
255 0.33
256 0.31
257 0.28
258 0.19
259 0.14
260 0.1
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.04
265 0.1
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.05
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.03
315 0.05
316 0.06
317 0.08
318 0.1
319 0.12
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.21
325 0.2
326 0.18
327 0.17
328 0.16
329 0.18
330 0.17
331 0.16
332 0.14
333 0.16
334 0.19
335 0.18
336 0.19
337 0.22
338 0.22
339 0.23
340 0.22
341 0.27
342 0.28
343 0.36
344 0.39
345 0.39
346 0.44
347 0.44
348 0.53
349 0.47
350 0.45
351 0.38
352 0.37
353 0.31
354 0.25
355 0.25
356 0.15
357 0.13
358 0.11
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.12
373 0.15
374 0.16
375 0.2
376 0.26
377 0.28
378 0.28
379 0.27
380 0.23
381 0.21
382 0.2
383 0.16
384 0.09
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.13
393 0.14
394 0.19
395 0.27
396 0.27
397 0.31
398 0.32
399 0.35
400 0.33
401 0.38
402 0.4
403 0.39
404 0.47
405 0.45
406 0.43
407 0.44
408 0.45
409 0.44
410 0.46
411 0.42
412 0.36
413 0.42
414 0.45
415 0.44
416 0.47
417 0.46
418 0.43
419 0.4
420 0.41
421 0.4
422 0.4
423 0.37
424 0.31
425 0.27
426 0.22
427 0.2
428 0.18
429 0.1
430 0.08
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.13
438 0.16
439 0.16
440 0.16
441 0.18
442 0.23
443 0.22
444 0.21
445 0.21
446 0.17
447 0.16
448 0.19
449 0.18
450 0.13
451 0.17
452 0.22
453 0.22
454 0.23
455 0.22
456 0.19
457 0.23
458 0.22
459 0.19
460 0.15
461 0.15
462 0.14
463 0.15
464 0.14
465 0.12
466 0.13
467 0.13
468 0.15
469 0.21
470 0.22
471 0.22
472 0.24
473 0.24
474 0.26
475 0.28
476 0.26
477 0.21
478 0.21
479 0.24
480 0.23
481 0.19
482 0.16
483 0.14
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.12
493 0.12
494 0.13
495 0.15
496 0.16
497 0.17
498 0.21
499 0.22
500 0.29
501 0.36
502 0.43
503 0.48
504 0.51
505 0.58
506 0.54
507 0.52
508 0.47
509 0.48
510 0.42
511 0.37
512 0.4
513 0.33
514 0.38
515 0.38
516 0.35
517 0.3
518 0.29
519 0.25
520 0.18
521 0.17
522 0.14
523 0.13
524 0.13
525 0.12
526 0.12
527 0.15
528 0.16
529 0.18