FuNGI

A0A168JEE6

Protein Details

Accession

A0A168JEE6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-26	DTPGVKKTTRRFAPVKRGGKS	Hydrophilic
104-127	GTMKMKFKPTIPHKRNKKEVSSSA	Hydrophilic
255-274	MTVKSQKKERKPSMTKVKLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-31	TRRFAPVKRGGKSPAAQR
110-121	FKPTIPHKRNKK
140-161	NHGGERGRGGRGRGGRGRGRGR

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSEPSDTPGVKKTTRRFAPVKRGGKSPAAQRRAAAAAAAAASEDVDSPVKSELAESANDSPSAESASAEGHASTKSPSIGTIRPEGSGSGRLQSVNEGQKTRGGTMKMKFKPTIPHKRNKKEVSSSAIDEALGKTAGGHNHGGERGRGGRGRGGRGRGRGRGLVIVDESTASGIFSLGPSAVSRGRPGFGGGGFASYGGDVPSRAEGDDTNSDMVEMFTSSVGRDTPVTFRHVSRLEGDIDPVTLKQTIGKIPWMTVKSQKKERKPSMTKVKLEPSDDVDMEADDDVSKVLDTIDSLVDDAEDENDEEPRELPKVYMDGDSPAQNIFALDEKQRLVCVAEEELLYFQLPTVVPIFEKPKSDDPNADVDMTEEGDVKPEVVENTLPAAAKKTASLEDAMANMGLEDMPDGQVGKLIVYKSGKVKMQFGSILLDVNQGMQSTFLENIMVVDHESEDSKKAIELGHIVQKFVCAPNMDALLNESLN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.68
3	0.7
4	0.74
5	0.79
6	0.81
7	0.82
8	0.75
9	0.74
10	0.71
11	0.7
12	0.65
13	0.64
14	0.64
15	0.61
16	0.59
17	0.54
18	0.53
19	0.48
20	0.42
21	0.32
22	0.21
23	0.17
24	0.15
25	0.14
26	0.09
27	0.06
28	0.06
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.08
33	0.08
34	0.09
35	0.1
36	0.11
37	0.1
38	0.11
39	0.12
40	0.13
41	0.14
42	0.17
43	0.19
44	0.21
45	0.21
46	0.21
47	0.18
48	0.16
49	0.17
50	0.14
51	0.1
52	0.09
53	0.09
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.09
58	0.09
59	0.09
60	0.1
61	0.11
62	0.12
63	0.11
64	0.13
65	0.17
66	0.21
67	0.23
68	0.28
69	0.27
70	0.27
71	0.27
72	0.26
73	0.24
74	0.25
75	0.23
76	0.19
77	0.19
78	0.19
79	0.19
80	0.21
81	0.25
82	0.27
83	0.31
84	0.3
85	0.3
86	0.33
87	0.34
88	0.33
89	0.31
90	0.27
91	0.3
92	0.35
93	0.44
94	0.46
95	0.5
96	0.49
97	0.48
98	0.55
99	0.59
100	0.64
101	0.62
102	0.67
103	0.72
104	0.8
105	0.87
106	0.84
107	0.83
108	0.8
109	0.77
110	0.74
111	0.68
112	0.6
113	0.51
114	0.44
115	0.35
116	0.27
117	0.21
118	0.15
119	0.11
120	0.08
121	0.07
122	0.1
123	0.11
124	0.12
125	0.13
126	0.12
127	0.15
128	0.17
129	0.18
130	0.15
131	0.17
132	0.17
133	0.2
134	0.21
135	0.2
136	0.24
137	0.27
138	0.34
139	0.35
140	0.4
141	0.41
142	0.47
143	0.52
144	0.51
145	0.5
146	0.45
147	0.41
148	0.38
149	0.33
150	0.26
151	0.21
152	0.17
153	0.14
154	0.12
155	0.1
156	0.07
157	0.06
158	0.05
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.07
168	0.09
169	0.09
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.12
174	0.13
175	0.13
176	0.11
177	0.12
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.09
182	0.08
183	0.06
184	0.06
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.05
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.1
195	0.12
196	0.12
197	0.12
198	0.11
199	0.11
200	0.1
201	0.1
202	0.07
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.07
213	0.1
214	0.11
215	0.15
216	0.16
217	0.17
218	0.21
219	0.22
220	0.22
221	0.2
222	0.21
223	0.2
224	0.18
225	0.19
226	0.14
227	0.13
228	0.12
229	0.1
230	0.09
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.09
235	0.1
236	0.11
237	0.14
238	0.13
239	0.14
240	0.19
241	0.18
242	0.19
243	0.26
244	0.33
245	0.36
246	0.46
247	0.53
248	0.57
249	0.66
250	0.73
251	0.75
252	0.74
253	0.78
254	0.79
255	0.8
256	0.75
257	0.7
258	0.69
259	0.61
260	0.56
261	0.48
262	0.4
263	0.35
264	0.31
265	0.26
266	0.19
267	0.15
268	0.13
269	0.12
270	0.08
271	0.04
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.12
303	0.12
304	0.11
305	0.13
306	0.14
307	0.15
308	0.14
309	0.12
310	0.11
311	0.1
312	0.09
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.1
317	0.12
318	0.13
319	0.13
320	0.13
321	0.13
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.1
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.1
331	0.09
332	0.07
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.12
341	0.17
342	0.17
343	0.2
344	0.23
345	0.3
346	0.35
347	0.38
348	0.39
349	0.37
350	0.41
351	0.4
352	0.36
353	0.28
354	0.23
355	0.21
356	0.18
357	0.16
358	0.1
359	0.08
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.09
369	0.11
370	0.12
371	0.13
372	0.12
373	0.15
374	0.14
375	0.15
376	0.15
377	0.16
378	0.16
379	0.17
380	0.18
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.15
385	0.12
386	0.1
387	0.09
388	0.08
389	0.06
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.07
396	0.06
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.11
401	0.11
402	0.16
403	0.18
404	0.21
405	0.25
406	0.31
407	0.35
408	0.34
409	0.4
410	0.37
411	0.4
412	0.38
413	0.33
414	0.31
415	0.27
416	0.26
417	0.21
418	0.2
419	0.14
420	0.14
421	0.14
422	0.1
423	0.1
424	0.09
425	0.09
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.08
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.09
438	0.11
439	0.12
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.13
444	0.14
445	0.15
446	0.15
447	0.19
448	0.22
449	0.3
450	0.3
451	0.3
452	0.28
453	0.29
454	0.29
455	0.27
456	0.26
457	0.19
458	0.2
459	0.24
460	0.27
461	0.26
462	0.23
463	0.24

A0A168JEE6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer