Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168N710

Protein Details
Accession A0A168N710    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-194AKETKTKKTTEKVRKEKVFVHydrophilic
209-229RKNDRRGGRGGNNNNKNNRRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-66KINKDAARAAKGGKPAKGARQQNGRPQRG
204-221ARPEFRKNDRRGGRGGNN
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, cyto 11, nucl 9, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSTYSKNLFDILGDGEVPRPAPVKEEAPVVVDKKSVSKINKDAARAAKGGKPAKGARQQNGRPQRGRQFDRHSGTGIVDTEKKVNKGWGKAGASEAEAAKDTLNPADPDAPEAEAAAPVEEEEQVKTLDEYLAEKANKSLKVSLPEARKANDADDSAFKGTVAFAKEDFEEFYVAKETKTKKTTEKVRKEKVFVEIEQRFQEKARPEFRKNDRRGGRGGNNNNKNNRRSTKNAAAPAVNLQDASAFPTLGATA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.11
8 0.14
9 0.17
10 0.19
11 0.2
12 0.23
13 0.22
14 0.23
15 0.27
16 0.25
17 0.23
18 0.21
19 0.2
20 0.21
21 0.25
22 0.29
23 0.3
24 0.36
25 0.41
26 0.49
27 0.53
28 0.51
29 0.54
30 0.52
31 0.52
32 0.45
33 0.42
34 0.36
35 0.4
36 0.42
37 0.37
38 0.38
39 0.37
40 0.45
41 0.51
42 0.54
43 0.54
44 0.6
45 0.63
46 0.67
47 0.74
48 0.73
49 0.69
50 0.7
51 0.71
52 0.7
53 0.7
54 0.68
55 0.67
56 0.68
57 0.69
58 0.63
59 0.55
60 0.46
61 0.42
62 0.35
63 0.27
64 0.2
65 0.17
66 0.16
67 0.19
68 0.2
69 0.21
70 0.2
71 0.25
72 0.27
73 0.29
74 0.32
75 0.34
76 0.34
77 0.33
78 0.34
79 0.28
80 0.24
81 0.22
82 0.18
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.19
128 0.23
129 0.26
130 0.29
131 0.29
132 0.33
133 0.34
134 0.32
135 0.31
136 0.28
137 0.26
138 0.23
139 0.2
140 0.16
141 0.16
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.18
164 0.21
165 0.28
166 0.32
167 0.34
168 0.38
169 0.47
170 0.57
171 0.62
172 0.69
173 0.72
174 0.79
175 0.81
176 0.78
177 0.72
178 0.69
179 0.63
180 0.54
181 0.53
182 0.46
183 0.43
184 0.43
185 0.41
186 0.34
187 0.3
188 0.33
189 0.31
190 0.36
191 0.42
192 0.47
193 0.51
194 0.6
195 0.7
196 0.75
197 0.74
198 0.76
199 0.74
200 0.7
201 0.7
202 0.7
203 0.68
204 0.68
205 0.73
206 0.73
207 0.75
208 0.78
209 0.83
210 0.81
211 0.76
212 0.76
213 0.73
214 0.7
215 0.68
216 0.7
217 0.7
218 0.71
219 0.73
220 0.67
221 0.61
222 0.55
223 0.53
224 0.46
225 0.36
226 0.27
227 0.2
228 0.17
229 0.16
230 0.18
231 0.14
232 0.11
233 0.1