Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168P654

Protein Details
Accession A0A168P654    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-52IKKRKSSGSERSSRSRKQNNNKSKKQHQMPSRPALQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-43KKRKSSGSERSSRSRKQNNNKSKKQHQ
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSHTPMDLDSSLDDLIKKRKSSGSERSSRSRKQNNNKSKKQHQMPSRPALQTSKAKVSKPAPVRSNAGINARLSTSSGNAPSGPLFTAKNTPPAQRPTPKADPSQIIITKAIPASNAVSSRLGSGAGNDKKVKSVIAGRLGSQPRQQQQQQQQQPQIQSQILRPLPPTQQQQQEQLYMPSSSIQSPRDPIQIRGMYQPEYVVPGQGISIRGRSNTATARPGISIRGESGPTTVLMTGLDAYTNSDDVRLAVEDFGNVLNCEVLRDRQGRSFGEAEIEFSSKDAALDCIAAMDNQLADGRILRIILREPKKPQTYAQKQLRSMVQPSYAVSGKMYSDQLTPRYDIYRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.25
3 0.3
4 0.3
5 0.33
6 0.39
7 0.45
8 0.53
9 0.59
10 0.61
11 0.64
12 0.7
13 0.75
14 0.78
15 0.8
16 0.81
17 0.81
18 0.81
19 0.83
20 0.88
21 0.89
22 0.91
23 0.93
24 0.92
25 0.92
26 0.92
27 0.9
28 0.88
29 0.87
30 0.87
31 0.86
32 0.85
33 0.82
34 0.74
35 0.67
36 0.63
37 0.59
38 0.57
39 0.53
40 0.55
41 0.51
42 0.51
43 0.55
44 0.55
45 0.56
46 0.57
47 0.6
48 0.54
49 0.54
50 0.57
51 0.52
52 0.54
53 0.48
54 0.44
55 0.39
56 0.34
57 0.31
58 0.27
59 0.25
60 0.2
61 0.17
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.15
70 0.13
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.18
75 0.18
76 0.26
77 0.28
78 0.31
79 0.36
80 0.42
81 0.48
82 0.49
83 0.53
84 0.54
85 0.6
86 0.6
87 0.58
88 0.56
89 0.51
90 0.46
91 0.48
92 0.41
93 0.34
94 0.31
95 0.27
96 0.24
97 0.22
98 0.19
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.17
113 0.18
114 0.22
115 0.23
116 0.23
117 0.24
118 0.24
119 0.23
120 0.16
121 0.2
122 0.21
123 0.27
124 0.27
125 0.27
126 0.34
127 0.36
128 0.35
129 0.34
130 0.34
131 0.31
132 0.37
133 0.38
134 0.39
135 0.47
136 0.56
137 0.6
138 0.61
139 0.62
140 0.6
141 0.59
142 0.52
143 0.45
144 0.36
145 0.29
146 0.24
147 0.26
148 0.23
149 0.22
150 0.21
151 0.22
152 0.23
153 0.27
154 0.3
155 0.28
156 0.35
157 0.36
158 0.4
159 0.38
160 0.37
161 0.33
162 0.29
163 0.25
164 0.18
165 0.16
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.15
173 0.17
174 0.22
175 0.23
176 0.23
177 0.28
178 0.29
179 0.29
180 0.31
181 0.31
182 0.25
183 0.24
184 0.23
185 0.15
186 0.16
187 0.15
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.08
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.13
200 0.15
201 0.17
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.2
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.15
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.09
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.15
251 0.18
252 0.21
253 0.25
254 0.29
255 0.29
256 0.32
257 0.32
258 0.26
259 0.28
260 0.26
261 0.23
262 0.21
263 0.2
264 0.15
265 0.14
266 0.15
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.16
291 0.26
292 0.3
293 0.36
294 0.42
295 0.52
296 0.58
297 0.59
298 0.61
299 0.62
300 0.67
301 0.71
302 0.74
303 0.73
304 0.69
305 0.72
306 0.71
307 0.65
308 0.58
309 0.52
310 0.46
311 0.38
312 0.37
313 0.37
314 0.31
315 0.26
316 0.24
317 0.21
318 0.18
319 0.21
320 0.21
321 0.18
322 0.21
323 0.25
324 0.29
325 0.3
326 0.31
327 0.31