Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162TSC9

Protein Details
Accession A0A162TSC9    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MKLRARKKSFPSNIKQEDCKPHydrophilic
254-281NFYCHSCEKKMKSKKAFRRHLRLVHFIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-269KSKKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MKLRARKKSFPSNIKQEDCKPTTLINAQLPTTEVANTSTFDLTIKQEDSKDHKVSLEQHGKFGSKSYYYRCDICYQRFPNLKSVLEHRKSNHIGRRLSNHTMVKSLDKEPDLYNPDFYCKSCEKDYSNKNTYRAHLRGVHFMVLKPLRGQTAQKIDATPDPNDPNLHCKACNFTYQRKSYYKDHCRYTHGLNLAEFAKQTSSSSSLTDSYCQICDKRLSSMSYYRQHLFVVHNINIKQIQQKRNDILPNMDDPNFYCHSCEKKMKSKKAFRRHLRLVHFIFRSAPSQSELKPDVDDPNNYCRACEKNYASRGKYRVHLRLVHQMIIPLLEGSGSHMKLPDPYNRDYYCSFISWY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.82
3 0.79
4 0.78
5 0.71
6 0.64
7 0.55
8 0.47
9 0.47
10 0.44
11 0.42
12 0.38
13 0.37
14 0.35
15 0.33
16 0.33
17 0.28
18 0.24
19 0.18
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.15
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.21
34 0.27
35 0.35
36 0.41
37 0.41
38 0.38
39 0.38
40 0.4
41 0.43
42 0.47
43 0.5
44 0.42
45 0.42
46 0.44
47 0.44
48 0.39
49 0.37
50 0.31
51 0.25
52 0.29
53 0.32
54 0.36
55 0.38
56 0.41
57 0.4
58 0.44
59 0.46
60 0.49
61 0.52
62 0.49
63 0.54
64 0.59
65 0.58
66 0.58
67 0.56
68 0.51
69 0.44
70 0.49
71 0.51
72 0.49
73 0.51
74 0.45
75 0.5
76 0.53
77 0.59
78 0.58
79 0.55
80 0.55
81 0.55
82 0.61
83 0.58
84 0.57
85 0.56
86 0.53
87 0.46
88 0.43
89 0.4
90 0.37
91 0.33
92 0.32
93 0.28
94 0.25
95 0.26
96 0.24
97 0.29
98 0.31
99 0.28
100 0.28
101 0.24
102 0.27
103 0.26
104 0.26
105 0.25
106 0.22
107 0.25
108 0.25
109 0.29
110 0.3
111 0.38
112 0.46
113 0.5
114 0.56
115 0.56
116 0.58
117 0.57
118 0.56
119 0.55
120 0.48
121 0.43
122 0.42
123 0.4
124 0.42
125 0.4
126 0.39
127 0.31
128 0.3
129 0.32
130 0.26
131 0.24
132 0.19
133 0.19
134 0.17
135 0.18
136 0.19
137 0.18
138 0.25
139 0.26
140 0.26
141 0.25
142 0.25
143 0.28
144 0.29
145 0.25
146 0.21
147 0.2
148 0.21
149 0.21
150 0.2
151 0.21
152 0.22
153 0.22
154 0.19
155 0.18
156 0.21
157 0.22
158 0.28
159 0.27
160 0.32
161 0.39
162 0.42
163 0.47
164 0.47
165 0.5
166 0.5
167 0.57
168 0.59
169 0.57
170 0.6
171 0.57
172 0.59
173 0.58
174 0.53
175 0.48
176 0.4
177 0.35
178 0.29
179 0.28
180 0.23
181 0.2
182 0.16
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.14
198 0.14
199 0.13
200 0.14
201 0.17
202 0.17
203 0.19
204 0.21
205 0.22
206 0.24
207 0.31
208 0.36
209 0.39
210 0.42
211 0.39
212 0.36
213 0.34
214 0.33
215 0.28
216 0.26
217 0.25
218 0.25
219 0.28
220 0.27
221 0.29
222 0.28
223 0.27
224 0.3
225 0.32
226 0.37
227 0.39
228 0.45
229 0.47
230 0.52
231 0.55
232 0.48
233 0.44
234 0.4
235 0.38
236 0.34
237 0.31
238 0.25
239 0.22
240 0.26
241 0.24
242 0.21
243 0.19
244 0.2
245 0.25
246 0.31
247 0.39
248 0.41
249 0.49
250 0.59
251 0.68
252 0.74
253 0.8
254 0.84
255 0.86
256 0.9
257 0.9
258 0.9
259 0.89
260 0.87
261 0.83
262 0.81
263 0.75
264 0.73
265 0.63
266 0.54
267 0.47
268 0.4
269 0.36
270 0.28
271 0.25
272 0.2
273 0.22
274 0.22
275 0.27
276 0.27
277 0.26
278 0.26
279 0.27
280 0.31
281 0.31
282 0.35
283 0.31
284 0.36
285 0.42
286 0.4
287 0.39
288 0.35
289 0.36
290 0.37
291 0.42
292 0.42
293 0.44
294 0.53
295 0.62
296 0.62
297 0.65
298 0.65
299 0.61
300 0.61
301 0.61
302 0.6
303 0.58
304 0.61
305 0.58
306 0.63
307 0.62
308 0.58
309 0.5
310 0.43
311 0.36
312 0.3
313 0.26
314 0.15
315 0.11
316 0.08
317 0.07
318 0.11
319 0.17
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.25
325 0.29
326 0.33
327 0.32
328 0.36
329 0.44
330 0.44
331 0.48
332 0.44
333 0.45
334 0.4