FuNGI

J4W4E8

Protein Details

Accession

J4W4E8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-39	VDESGPSKPEQKRARKARPKQSSSVDPNSG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-29	PEQKRARKARPK

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MSIKREHEQVDESGPSKPEQKRARKARPKQSSSVDPNSGQNYVFATYHNATTIPVGEESDFEDDTDAMAYLMSVRSQASEIPHVLAAPRRQIGPQIPKDFVRITHEESDDGDIRVEADDEVDKSIHITGLGDGRGFYEDGAYIGRDYYRDDAEGSDNWDETEDEDGEVSEAAVLEAYSSAIMHQYHRLRAILNRPPPVDAAKRITSSQATYVAAFGPGSSAIKVWPPLLRNTDPTPLQVSLMSKDTVIRILRLMLGGKFLRRGYPMPERTSRWIWALLAKLPERGELNHSEIGWVRDLGRRAVLLGRSLSEMAALREELAKGGLGVNDAVDASSSDDELVADELDGQEEDGAPNGDEPEEMNDKPDQGAGEESTEAADEGEDDVAMDLESDSDEGEICEDREEKTSEKDESLEAAKAAFLARLEVQTSDDEDDEEELDAVRERSRMNMRATLNMILTITGEFYGQRDLLEFREPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.3
3	0.35
4	0.37
5	0.42
6	0.48
7	0.58
8	0.64
9	0.74
10	0.84
11	0.86
12	0.92
13	0.93
14	0.94
15	0.91
16	0.88
17	0.86
18	0.85
19	0.82
20	0.8
21	0.74
22	0.65
23	0.63
24	0.58
25	0.51
26	0.4
27	0.32
28	0.26
29	0.23
30	0.21
31	0.16
32	0.2
33	0.2
34	0.2
35	0.2
36	0.18
37	0.16
38	0.17
39	0.18
40	0.14
41	0.13
42	0.13
43	0.13
44	0.13
45	0.15
46	0.17
47	0.15
48	0.13
49	0.13
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.09
54	0.06
55	0.06
56	0.05
57	0.06
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.06
62	0.08
63	0.08
64	0.11
65	0.13
66	0.17
67	0.18
68	0.19
69	0.19
70	0.18
71	0.19
72	0.23
73	0.22
74	0.24
75	0.24
76	0.24
77	0.24
78	0.3
79	0.37
80	0.42
81	0.47
82	0.47
83	0.48
84	0.48
85	0.51
86	0.47
87	0.41
88	0.37
89	0.32
90	0.32
91	0.36
92	0.35
93	0.32
94	0.32
95	0.34
96	0.29
97	0.25
98	0.2
99	0.14
100	0.14
101	0.13
102	0.12
103	0.07
104	0.07
105	0.08
106	0.08
107	0.09
108	0.09
109	0.08
110	0.09
111	0.09
112	0.08
113	0.07
114	0.07
115	0.07
116	0.1
117	0.11
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.11
122	0.11
123	0.09
124	0.07
125	0.06
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.06
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.09
134	0.11
135	0.11
136	0.11
137	0.12
138	0.13
139	0.15
140	0.15
141	0.17
142	0.15
143	0.14
144	0.14
145	0.14
146	0.12
147	0.1
148	0.12
149	0.09
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.07
156	0.04
157	0.04
158	0.03
159	0.03
160	0.03
161	0.03
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.03
166	0.03
167	0.05
168	0.06
169	0.07
170	0.14
171	0.17
172	0.19
173	0.2
174	0.21
175	0.2
176	0.24
177	0.32
178	0.33
179	0.36
180	0.39
181	0.38
182	0.38
183	0.38
184	0.38
185	0.33
186	0.28
187	0.28
188	0.26
189	0.27
190	0.27
191	0.27
192	0.24
193	0.22
194	0.2
195	0.17
196	0.15
197	0.14
198	0.14
199	0.12
200	0.11
201	0.1
202	0.07
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.07
211	0.08
212	0.1
213	0.11
214	0.15
215	0.2
216	0.21
217	0.24
218	0.26
219	0.28
220	0.26
221	0.26
222	0.25
223	0.2
224	0.19
225	0.17
226	0.15
227	0.12
228	0.14
229	0.13
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.13
234	0.12
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.11
241	0.07
242	0.11
243	0.11
244	0.11
245	0.13
246	0.13
247	0.14
248	0.15
249	0.16
250	0.18
251	0.28
252	0.32
253	0.35
254	0.39
255	0.41
256	0.44
257	0.45
258	0.41
259	0.33
260	0.29
261	0.25
262	0.23
263	0.22
264	0.2
265	0.21
266	0.2
267	0.2
268	0.19
269	0.2
270	0.18
271	0.17
272	0.18
273	0.17
274	0.21
275	0.2
276	0.19
277	0.19
278	0.19
279	0.2
280	0.17
281	0.14
282	0.12
283	0.13
284	0.15
285	0.14
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.15
290	0.15
291	0.14
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.14
296	0.12
297	0.11
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.05
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.05
340	0.06
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.11
346	0.14
347	0.14
348	0.16
349	0.16
350	0.17
351	0.17
352	0.18
353	0.13
354	0.11
355	0.13
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.07
364	0.06
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.04
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.15
389	0.18
390	0.18
391	0.23
392	0.28
393	0.28
394	0.28
395	0.28
396	0.25
397	0.26
398	0.27
399	0.22
400	0.18
401	0.15
402	0.14
403	0.13
404	0.13
405	0.11
406	0.08
407	0.09
408	0.11
409	0.12
410	0.13
411	0.13
412	0.15
413	0.15
414	0.17
415	0.16
416	0.15
417	0.14
418	0.14
419	0.14
420	0.13
421	0.12
422	0.1
423	0.08
424	0.09
425	0.1
426	0.11
427	0.11
428	0.13
429	0.13
430	0.2
431	0.28
432	0.34
433	0.37
434	0.44
435	0.45
436	0.49
437	0.52
438	0.47
439	0.4
440	0.34
441	0.29
442	0.21
443	0.2
444	0.14
445	0.11
446	0.08
447	0.08
448	0.07
449	0.08
450	0.12
451	0.12
452	0.11
453	0.13
454	0.14
455	0.17
456	0.24
457	0.23
458	0.21

J4W4E8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer