Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162RHU3

Protein Details
Accession A0A162RHU3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-54YDQRHTQPGTSRKKPSHPHHQHKMKPIHHQSKKKHAEEQQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-48RKKPSHPHHQHKMKPIHHQSKKK
Subcellular Location(s) nucl 13, plas 8, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006629  LITAF  
IPR037519  LITAF_fam  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10601  zf-LITAF-like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51837  LITAF  
Amino Acid Sequences MDLPSSSSNATCFQYDQRHTQPGTSRKKPSHPHHQHKMKPIHHQSKKKHAEEQQPSFQPITTTTAPTDPDLSADTHRYFAEARSTPIMYSTSSLHSTTSTSSSSSLEYSPTGAKEHTKRHGKADDNRSLCSAHSFTAAQQQQMEYLNNRTGSSITTTTTHSSTRNQTFYFGTPLPPQKQQPYQYHDPTWYYGDESNTPPWHTPGTLSQSQQQPSASGSKSSFLARKKDMFLQSNANHRRRLSEGGASIKSAFSTGRQTIKSWRQKRINIMMKQHQLPDFETKAFCEVCEKYIQTRIRYRNGSMVWLMSFILLLCTVVLFWVPFYVKYFKDVAHFCPGCGKQLGVSYRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.44
4 0.47
5 0.53
6 0.52
7 0.56
8 0.58
9 0.59
10 0.65
11 0.66
12 0.68
13 0.68
14 0.77
15 0.81
16 0.81
17 0.82
18 0.83
19 0.85
20 0.87
21 0.9
22 0.88
23 0.88
24 0.89
25 0.84
26 0.83
27 0.84
28 0.84
29 0.83
30 0.86
31 0.84
32 0.85
33 0.89
34 0.83
35 0.81
36 0.78
37 0.79
38 0.8
39 0.79
40 0.77
41 0.71
42 0.68
43 0.6
44 0.52
45 0.42
46 0.33
47 0.32
48 0.24
49 0.22
50 0.21
51 0.23
52 0.23
53 0.23
54 0.24
55 0.17
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.2
61 0.19
62 0.19
63 0.18
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.24
68 0.21
69 0.22
70 0.24
71 0.25
72 0.23
73 0.24
74 0.24
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.14
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.18
101 0.23
102 0.3
103 0.37
104 0.45
105 0.46
106 0.52
107 0.59
108 0.6
109 0.64
110 0.67
111 0.66
112 0.59
113 0.58
114 0.52
115 0.45
116 0.37
117 0.31
118 0.22
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.22
124 0.22
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.2
130 0.2
131 0.13
132 0.15
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.17
149 0.24
150 0.27
151 0.28
152 0.27
153 0.27
154 0.28
155 0.27
156 0.28
157 0.21
158 0.19
159 0.2
160 0.25
161 0.25
162 0.27
163 0.28
164 0.29
165 0.35
166 0.4
167 0.42
168 0.45
169 0.5
170 0.5
171 0.49
172 0.46
173 0.42
174 0.36
175 0.31
176 0.23
177 0.18
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.17
182 0.2
183 0.19
184 0.2
185 0.18
186 0.18
187 0.17
188 0.15
189 0.14
190 0.15
191 0.21
192 0.24
193 0.24
194 0.28
195 0.32
196 0.33
197 0.33
198 0.29
199 0.23
200 0.21
201 0.25
202 0.2
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.18
207 0.2
208 0.23
209 0.22
210 0.28
211 0.29
212 0.32
213 0.34
214 0.4
215 0.43
216 0.42
217 0.41
218 0.44
219 0.43
220 0.5
221 0.56
222 0.53
223 0.5
224 0.46
225 0.47
226 0.42
227 0.44
228 0.37
229 0.33
230 0.33
231 0.36
232 0.36
233 0.33
234 0.3
235 0.24
236 0.21
237 0.16
238 0.13
239 0.09
240 0.14
241 0.18
242 0.23
243 0.24
244 0.26
245 0.34
246 0.45
247 0.53
248 0.55
249 0.61
250 0.64
251 0.69
252 0.76
253 0.78
254 0.78
255 0.74
256 0.75
257 0.74
258 0.72
259 0.69
260 0.65
261 0.56
262 0.49
263 0.45
264 0.43
265 0.37
266 0.32
267 0.3
268 0.26
269 0.27
270 0.25
271 0.22
272 0.21
273 0.19
274 0.19
275 0.24
276 0.25
277 0.25
278 0.34
279 0.39
280 0.4
281 0.48
282 0.53
283 0.57
284 0.59
285 0.58
286 0.58
287 0.54
288 0.52
289 0.44
290 0.38
291 0.3
292 0.26
293 0.23
294 0.15
295 0.14
296 0.09
297 0.09
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.15
311 0.2
312 0.2
313 0.24
314 0.26
315 0.24
316 0.3
317 0.33
318 0.33
319 0.39
320 0.39
321 0.36
322 0.43
323 0.42
324 0.4
325 0.38
326 0.34
327 0.26
328 0.34