Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JJ93

Protein Details
Accession J5JJ93    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-257PKTKTRGRKPAATRARKRKATABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-257KTKTRGRKPAATRARKRKATA
319-347ESSPPKKAAAPPPKRALPFANRKPKEAPK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 11.333, mito_nucl 10.833, cyto 2.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MVTSRVLKVPQSDNDKAFVLLQASSSGRKPLDLKLIGTEGEAPYVVKNNESDHARHTVKHDRVPALKVKNSHLSDTEWESLLEDFFDQKPLKDINATATVQSEASITITIRKQVQGITQRLGTITLSHDENEAIELFEWCAASADAVVASNKATAQIQSKATELEASIHQLKDQLEELLKAKDEDETALLQKFRDLLNEKKVKIREQQKVLASGSFSAPKQEEPQEPSPDPELEAPKTKTRGRKPAATRARKRKATAPAKEESDEEDVAGEQSPIKSEPEDTDDGQTTEATASVDGDSDEDEEMADNGEDGEAAAPPRESSPPKKAAAPPPKRALPFANRKPKEAPKPVAQAGGADTDSDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.47
3 0.41
4 0.35
5 0.29
6 0.22
7 0.16
8 0.15
9 0.16
10 0.16
11 0.18
12 0.19
13 0.22
14 0.2
15 0.23
16 0.25
17 0.27
18 0.35
19 0.36
20 0.36
21 0.34
22 0.36
23 0.33
24 0.31
25 0.29
26 0.19
27 0.17
28 0.16
29 0.12
30 0.11
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.16
35 0.18
36 0.24
37 0.27
38 0.27
39 0.25
40 0.33
41 0.33
42 0.34
43 0.37
44 0.42
45 0.44
46 0.49
47 0.52
48 0.51
49 0.53
50 0.56
51 0.58
52 0.56
53 0.54
54 0.51
55 0.49
56 0.52
57 0.5
58 0.48
59 0.42
60 0.37
61 0.37
62 0.39
63 0.35
64 0.26
65 0.24
66 0.22
67 0.2
68 0.17
69 0.14
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.19
80 0.2
81 0.19
82 0.24
83 0.25
84 0.21
85 0.21
86 0.2
87 0.18
88 0.17
89 0.13
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.11
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.24
102 0.28
103 0.3
104 0.3
105 0.29
106 0.29
107 0.28
108 0.27
109 0.2
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.07
142 0.1
143 0.14
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.12
151 0.1
152 0.08
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.14
182 0.17
183 0.2
184 0.29
185 0.35
186 0.36
187 0.4
188 0.42
189 0.42
190 0.46
191 0.51
192 0.49
193 0.49
194 0.54
195 0.51
196 0.52
197 0.48
198 0.41
199 0.32
200 0.25
201 0.2
202 0.17
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.16
208 0.2
209 0.23
210 0.27
211 0.33
212 0.36
213 0.36
214 0.37
215 0.36
216 0.32
217 0.29
218 0.26
219 0.24
220 0.2
221 0.26
222 0.26
223 0.29
224 0.33
225 0.37
226 0.43
227 0.47
228 0.56
229 0.55
230 0.61
231 0.64
232 0.7
233 0.76
234 0.78
235 0.79
236 0.8
237 0.85
238 0.82
239 0.78
240 0.75
241 0.75
242 0.75
243 0.73
244 0.67
245 0.62
246 0.6
247 0.58
248 0.51
249 0.43
250 0.37
251 0.28
252 0.23
253 0.18
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.1
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.14
266 0.18
267 0.21
268 0.21
269 0.24
270 0.24
271 0.24
272 0.23
273 0.2
274 0.15
275 0.12
276 0.11
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.1
305 0.16
306 0.22
307 0.28
308 0.37
309 0.43
310 0.45
311 0.52
312 0.58
313 0.63
314 0.68
315 0.7
316 0.7
317 0.72
318 0.76
319 0.71
320 0.67
321 0.65
322 0.64
323 0.66
324 0.68
325 0.71
326 0.66
327 0.68
328 0.73
329 0.75
330 0.75
331 0.74
332 0.71
333 0.69
334 0.75
335 0.74
336 0.69
337 0.59
338 0.5
339 0.41
340 0.38
341 0.28
342 0.2
343 0.17